資料來源:https://github.com/BrambleXu/pydata-notebook
NumPy(Numerical Python的簡稱)是Python數(shù)值計算最重要的基礎(chǔ)包翁涤。大多數(shù)提供科學(xué)計算的包都是用NumPy的數(shù)組作為構(gòu)建基礎(chǔ)。
NumPy的部分功能如下:
- ndarray谱净,一個具有矢量算術(shù)運算和復(fù)雜廣播能力的快速且節(jié)省空間的多維數(shù)組状勤。
- 用于對整組數(shù)據(jù)進行快速運算的標(biāo)準(zhǔn)數(shù)學(xué)函數(shù)(無需編寫循環(huán))谴仙。
- 用于讀寫磁盤數(shù)據(jù)的工具以及用于操作內(nèi)存映射文件的工具央星。
- 線性代數(shù)、隨機數(shù)生成以及傅里葉變換功能褥实。
- 用于集成由C呀狼、C++、Fortran等語言編寫的代碼的A C API损离。
由于NumPy提供了一個簡單易用的C API哥艇,因此很容易將數(shù)據(jù)傳遞給由低級語言編寫的外部庫,外部庫也能以NumPy數(shù)組的形式將數(shù)據(jù)返回給Python僻澎。這個功能使Python成為一種包裝C/C++/Fortran歷史代碼庫的選擇貌踏,并使被包裝庫擁有一個動態(tài)的、易用的接口窟勃。
NumPy本身并沒有提供多么高級的數(shù)據(jù)分析功能祖乳,理解NumPy數(shù)組以及面向數(shù)組的計算將有助于你更加高效地使用諸如pandas之類的工具。因為NumPy是一個很大的題目秉氧,我會在附錄A中介紹更多NumPy高級功能眷昆,比如廣播。
對于大部分?jǐn)?shù)據(jù)分析應(yīng)用而言汁咏,我最關(guān)注的功能主要集中在:
- 用于數(shù)據(jù)整理和清理亚斋、子集構(gòu)造和過濾、轉(zhuǎn)換等快速的矢量化數(shù)組運算攘滩。
- 常用的數(shù)組算法帅刊,如排序、唯一化漂问、集合運算等赖瞒。
- 高效的描述統(tǒng)計和數(shù)據(jù)聚合/摘要運算。
- 用于異構(gòu)數(shù)據(jù)集的合并/連接運算的數(shù)據(jù)對齊和關(guān)系型數(shù)據(jù)運算蚤假。
- 將條件邏輯表述為數(shù)組表達式(而不是帶有if-elif-else分支的循環(huán))栏饮。
- 數(shù)據(jù)的分組運算(聚合、轉(zhuǎn)換磷仰、函數(shù)應(yīng)用等)抡爹。。
雖然NumPy提供了通用的數(shù)值數(shù)據(jù)處理的計算基礎(chǔ)芒划,但大多數(shù)讀者可能還是想將pandas作為統(tǒng)計和分析工作的基礎(chǔ)冬竟,尤其是處理表格數(shù)據(jù)時。pandas還提供了一些NumPy所沒有的領(lǐng)域特定的功能民逼,如時間序列處理等泵殴。
筆記:Python的面向數(shù)組計算可以追溯到1995年,Jim Hugunin創(chuàng)建了Numeric庫拼苍。接下來的10年笑诅,許多科學(xué)編程社區(qū)紛紛開始使用Python的數(shù)組編程,但是進入21世紀(jì)疮鲫,庫的生態(tài)系統(tǒng)變得碎片化了吆你。2005年,Travis Oliphant從Numeric和Numarray項目整了出了NumPy項目俊犯,進而所有社區(qū)都集合到了這個框架下妇多。
NumPy之于數(shù)值計算特別重要的原因之一,是因為它可以高效處理大數(shù)組的數(shù)據(jù)燕侠。這是因為:
- NumPy是在一個連續(xù)的內(nèi)存塊中存儲數(shù)據(jù)者祖,獨立于其他Python內(nèi)置對象。NumPy的C語言編寫的算法庫可以操作內(nèi)存绢彤,而不必進行類型檢查或其它前期工作七问。比起Python的內(nèi)置序列,NumPy數(shù)組使用的內(nèi)存更少茫舶。
- NumPy可以在整個數(shù)組上執(zhí)行復(fù)雜的計算械巡,而不需要Python的for循環(huán)。
要搞明白具體的性能差距饶氏,考察一個包含一百萬整數(shù)的數(shù)組讥耗,和一個等價的Python列表:
In [7]: import numpy as np
In [8]: my_arr = np.arange(1000000)
In [9]: my_list = list(range(1000000))
各個序列分別乘以2:
In [10]: %time for _ in range(10): my_arr2 = my_arr * 2
CPU times: user 20 ms, sys: 50 ms, total: 70 ms
Wall time: 72.4 ms
In [11]: %time for _ in range(10): my_list2 = [x * 2 for x in my_list]
CPU times: user 760 ms, sys: 290 ms, total: 1.05 s
Wall time: 1.05 s
基于NumPy的算法要比純Python快10到100倍(甚至更快),并且使用的內(nèi)存更少嚷往。
4.1 NumPy的ndarray:一種多維數(shù)組對象
NumPy最重要的一個特點就是其N維數(shù)組對象(即ndarray)葛账,該對象是一個快速而靈活的大數(shù)據(jù)集容器。你可以利用這種數(shù)組對整塊數(shù)據(jù)執(zhí)行一些數(shù)學(xué)運算皮仁,其語法跟標(biāo)量元素之間的運算一樣籍琳。
要明白Python是如何利用與標(biāo)量值類似的語法進行批次計算,我先引入NumPy贷祈,然后生成一個包含隨機數(shù)據(jù)的小數(shù)組:
In [12]: import numpy as np
# Generate some random data
In [13]: data = np.random.randn(2, 3)
In [14]: data
Out[14]:
array([[-0.2047, 0.4789, -0.5194],
[-0.5557, 1.9658, 1.3934]])
然后進行數(shù)學(xué)運算:
In [15]: data * 10
Out[15]:
array([[ -2.0471, 4.7894, -5.1944],
[ -5.5573, 19.6578, 13.9341]])
In [16]: data + data
Out[16]:
array([[-0.4094, 0.9579, -1.0389],
[-1.1115, 3.9316, 2.7868]])
第一個例子中趋急,所有的元素都乘以10。第二個例子中势誊,每個元素都與自身相加呜达。
筆記:在本章及全書中,我會使用標(biāo)準(zhǔn)的NumPy慣用法
import numpy as np
粟耻。你當(dāng)然也可以在代碼中使用from numpy import *
查近,但不建議這么做眉踱。numpy
的命名空間很大,包含許多函數(shù)霜威,其中一些的名字與Python的內(nèi)置函數(shù)重名(比如min和max)谈喳。
ndarray是一個通用的同構(gòu)數(shù)據(jù)多維容器,也就是說戈泼,其中的所有元素必須是相同類型的婿禽。每個數(shù)組都有一個shape(一個表示各維度大小的元組)和一個dtype(一個用于說明數(shù)組數(shù)據(jù)類型的對象):
In [17]: data.shape
Out[17]: (2, 3)
In [18]: data.dtype
Out[18]: dtype('float64')
本章將會介紹NumPy數(shù)組的基本用法,這對于本書后面各章的理解基本夠用大猛。雖然大多數(shù)數(shù)據(jù)分析工作不需要深入理解NumPy扭倾,但是精通面向數(shù)組的編程和思維方式是成為Python科學(xué)計算牛人的一大關(guān)鍵步驟。
筆記:當(dāng)你在本書中看到“數(shù)組”挽绩、“NumPy數(shù)組”膛壹、"ndarray"時,基本上都指的是同一樣?xùn)|西琼牧,即ndarray對象恢筝。
創(chuàng)建ndarray
創(chuàng)建數(shù)組最簡單的辦法就是使用array函數(shù)。它接受一切序列型的對象(包括其他數(shù)組)巨坊,然后產(chǎn)生一個新的含有傳入數(shù)據(jù)的NumPy數(shù)組撬槽。以一個列表的轉(zhuǎn)換為例:
In [19]: data1 = [6, 7.5, 8, 0, 1]
In [20]: arr1 = np.array(data1)
In [21]: arr1
Out[21]: array([ 6. , 7.5, 8. , 0. , 1. ])
嵌套序列(比如由一組等長列表組成的列表)將會被轉(zhuǎn)換為一個多維數(shù)組:
In [22]: data2 = [[1, 2, 3, 4], [5, 6, 7, 8]]
In [23]: arr2 = np.array(data2)
In [24]: arr2
Out[24]:
array([[1, 2, 3, 4],
[5, 6, 7, 8]])
因為data2是列表的列表,NumPy數(shù)組arr2的兩個維度的shape是從data2引入的趾撵≈度幔可以用屬性ndim和shape驗證:
In [25]: arr2.ndim
Out[25]: 2
In [26]: arr2.shape
Out[26]: (2, 4)
除非特別說明(稍后將會詳細(xì)介紹),np.array會嘗試為新建的這個數(shù)組推斷出一個較為合適的數(shù)據(jù)類型占调。數(shù)據(jù)類型保存在一個特殊的dtype對象中暂题。比如說,在上面的兩個例子中究珊,我們有:
In [27]: arr1.dtype
Out[27]: dtype('float64')
In [28]: arr2.dtype
Out[28]: dtype('int64')
除np.array之外抄肖,還有一些函數(shù)也可以新建數(shù)組达箍。比如劳坑,zeros和ones分別可以創(chuàng)建指定長度或形狀的全0或全1數(shù)組腻异。empty可以創(chuàng)建一個沒有任何具體值的數(shù)組。要用這些方法創(chuàng)建多維數(shù)組取试,只需傳入一個表示形狀的元組即可:
In [29]: np.zeros(10)
Out[29]: array([ 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 0.])
In [30]: np.zeros((3, 6))
Out[30]:
array([[ 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0., 0., 0.]])
In [31]: np.empty((2, 3, 2))
Out[31]:
array([[[ 0., 0.],
[ 0., 0.],
[ 0., 0.]],
[[ 0., 0.],
[ 0., 0.],
[ 0., 0.]]])
注意:認(rèn)為np.empty會返回全0數(shù)組的想法是不安全的悬槽。很多情況下(如前所示),它返回的都是一些未初始化的垃圾值瞬浓。
arange是Python內(nèi)置函數(shù)range的數(shù)組版:
In [32]: np.arange(15)
Out[32]: array([ 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14])
表4-1列出了一些數(shù)組創(chuàng)建函數(shù)初婆。由于NumPy關(guān)注的是數(shù)值計算,因此,如果沒有特別指定磅叛,數(shù)據(jù)類型基本都是float64(浮點數(shù))屑咳。
ndarray的數(shù)據(jù)類型
dtype(數(shù)據(jù)類型)是一個特殊的對象,它含有ndarray將一塊內(nèi)存解釋為特定數(shù)據(jù)類型所需的信息:
In [33]: arr1 = np.array([1, 2, 3], dtype=np.float64)
In [34]: arr2 = np.array([1, 2, 3], dtype=np.int32)
In [35]: arr1.dtype
Out[35]: dtype('float64')
In [36]: arr2.dtype
Out[36]: dtype('int32')
dtype是NumPy靈活交互其它系統(tǒng)的源泉之一弊琴。多數(shù)情況下乔宿,它們直接映射到相應(yīng)的機器表示,這使得“讀寫磁盤上的二進制數(shù)據(jù)流”以及“集成低級語言代碼(如C访雪、Fortran)”等工作變得更加簡單。數(shù)值型dtype的命名方式相同:一個類型名(如float或int)掂林,后面跟一個用于表示各元素位長的數(shù)字臣缀。標(biāo)準(zhǔn)的雙精度浮點值(即Python中的float對象)需要占用8字節(jié)(即64位)。因此泻帮,該類型在NumPy中就記作float64精置。表4-2列出了NumPy所支持的全部數(shù)據(jù)類型。
筆記:記不住這些NumPy的dtype也沒關(guān)系锣杂,新手更是如此脂倦。通常只需要知道你所處理的數(shù)據(jù)的大致類型是浮點數(shù)、復(fù)數(shù)元莫、整數(shù)赖阻、布爾值、字符串踱蠢,還是普通的Python對象即可火欧。當(dāng)你需要控制數(shù)據(jù)在內(nèi)存和磁盤中的存儲方式時(尤其是對大數(shù)據(jù)集),那就得了解如何控制存儲類型茎截。
你可以通過ndarray的astype方法明確地將一個數(shù)組從一個dtype轉(zhuǎn)換成另一個dtype:
In [37]: arr = np.array([1, 2, 3, 4, 5])
In [38]: arr.dtype
Out[38]: dtype('int64')
In [39]: float_arr = arr.astype(np.float64)
In [40]: float_arr.dtype
Out[40]: dtype('float64')
在本例中苇侵,整數(shù)被轉(zhuǎn)換成了浮點數(shù)。如果將浮點數(shù)轉(zhuǎn)換成整數(shù)企锌,則小數(shù)部分將會被截取刪除:
In [41]: arr = np.array([3.7, -1.2, -2.6, 0.5, 12.9, 10.1])
In [42]: arr
Out[42]: array([ 3.7, -1.2, -2.6, 0.5, 12.9, 10.1])
In [43]: arr.astype(np.int32)
Out[43]: array([ 3, -1, -2, 0, 12, 10], dtype=int32)
如果某字符串?dāng)?shù)組表示的全是數(shù)字榆浓,也可以用astype將其轉(zhuǎn)換為數(shù)值形式:
In [44]: numeric_strings = np.array(['1.25', '-9.6', '42'], dtype=np.string_)
In [45]: numeric_strings.astype(float)
Out[45]: array([ 1.25, -9.6 , 42. ])
注意:使用numpy.string_類型時,一定要小心撕攒,因為NumPy的字符串?dāng)?shù)據(jù)是大小固定的陡鹃,發(fā)生截取時,不會發(fā)出警告打却。pandas提供了更多非數(shù)值數(shù)據(jù)的便利的處理方法杉适。
如果轉(zhuǎn)換過程因為某種原因而失敗了(比如某個不能被轉(zhuǎn)換為float64的字符串),就會引發(fā)一個ValueError柳击。這里猿推,我比較懶,寫的是float而不是np.float64;NumPy很聰明蹬叭,它會將Python類型映射到等價的dtype上藕咏。
數(shù)組的dtype還有另一個屬性:
In [46]: int_array = np.arange(10)
In [47]: calibers = np.array([.22, .270, .357, .380, .44, .50], dtype=np.float64)
In [48]: int_array.astype(calibers.dtype)
Out[48]: array([ 0., 1., 2., 3., 4., 5., 6., 7., 8., 9.])
你還可以用簡潔的類型代碼來表示dtype:
In [49]: empty_uint32 = np.empty(8, dtype='u4')
In [50]: empty_uint32
Out[50]:
array([ 0, 1075314688, 0, 1075707904, 0,
1075838976, 0, 1072693248], dtype=uint32)
筆記:調(diào)用astype總會創(chuàng)建一個新的數(shù)組(一個數(shù)據(jù)的備份),即使新的dtype與舊的dtype相同秽五。
NumPy數(shù)組的運算
數(shù)組很重要孽查,因為它使你不用編寫循環(huán)即可對數(shù)據(jù)執(zhí)行批量運算。NumPy用戶稱其為矢量化(vectorization)坦喘。大小相等的數(shù)組之間的任何算術(shù)運算都會將運算應(yīng)用到元素級:
In [51]: arr = np.array([[1., 2., 3.], [4., 5., 6.]])
In [52]: arr
Out[52]:
array([[ 1., 2., 3.],
[ 4., 5., 6.]])
In [53]: arr * arr
Out[53]:
array([[ 1., 4., 9.],
[ 16., 25., 36.]])
In [54]: arr - arr
Out[54]:
array([[ 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0.]])
數(shù)組與標(biāo)量的算術(shù)運算會將標(biāo)量值傳播到各個元素:
In [55]: 1 / arr
Out[55]:
array([[ 1. , 0.5 , 0.3333],
[ 0.25 , 0.2 , 0.1667]])
In [56]: arr ** 0.5
Out[56]:
array([[ 1. , 1.4142, 1.7321],
[ 2. , 2.2361, 2.4495]])
大小相同的數(shù)組之間的比較會生成布爾值數(shù)組:
In [57]: arr2 = np.array([[0., 4., 1.], [7., 2., 12.]])
In [58]: arr2
Out[58]:
array([[ 0., 4., 1.],
[ 7., 2., 12.]])
In [59]: arr2 > arr
Out[59]:
array([[False, True, False],
[ True, False, True]], dtype=bool)
不同大小的數(shù)組之間的運算叫做廣播(broadcasting)盲再,將在附錄A中對其進行詳細(xì)討論。本書的內(nèi)容不需要對廣播機制有多深的理解瓣铣。
基本的索引和切片
NumPy數(shù)組的索引是一個內(nèi)容豐富的主題答朋,因為選取數(shù)據(jù)子集或單個元素的方式有很多。一維數(shù)組很簡單棠笑。從表面上看梦碗,它們跟Python列表的功能差不多:
In [60]: arr = np.arange(10)
In [61]: arr
Out[61]: array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9])
In [62]: arr[5]
Out[62]: 5
In [63]: arr[5:8]
Out[63]: array([5, 6, 7])
In [64]: arr[5:8] = 12
In [65]: arr
Out[65]: array([ 0, 1, 2, 3, 4, 12, 12, 12, 8, 9])
如上所示,當(dāng)你將一個標(biāo)量值賦值給一個切片時(如arr[5:8]=12)蓖救,該值會自動傳播(也就說后面將會講到的“廣播”)到整個選區(qū)洪规。跟列表最重要的區(qū)別在于,數(shù)組切片是原始數(shù)組的視圖循捺。這意味著數(shù)據(jù)不會被復(fù)制斩例,視圖上的任何修改都會直接反映到源數(shù)組上。
作為例子巨柒,先創(chuàng)建一個arr的切片:
In [66]: arr_slice = arr[5:8]
In [67]: arr_slice
Out[67]: array([12, 12, 12])
現(xiàn)在樱拴,當(dāng)我修稿arr_slice中的值,變動也會體現(xiàn)在原始數(shù)組arr中:
In [68]: arr_slice[1] = 12345
In [69]: arr
Out[69]: array([ 0, 1, 2, 3, 4, 12, 12345, 12, 8,
9])
切片[ : ]會給數(shù)組中的所有值賦值:
In [70]: arr_slice[:] = 64
In [71]: arr
Out[71]: array([ 0, 1, 2, 3, 4, 64, 64, 64, 8, 9])
如果你剛開始接觸NumPy洋满,可能會對此感到驚訝(尤其是當(dāng)你曾經(jīng)用過其他熱衷于復(fù)制數(shù)組數(shù)據(jù)的編程語言)晶乔。由于NumPy的設(shè)計目的是處理大數(shù)據(jù),所以你可以想象一下牺勾,假如NumPy堅持要將數(shù)據(jù)復(fù)制來復(fù)制去的話會產(chǎn)生何等的性能和內(nèi)存問題正罢。
注意:如果你想要得到的是ndarray切片的一份副本而非視圖,就需要明確地進行復(fù)制操作驻民,例如
arr[5:8].copy()
翻具。
對于高維度數(shù)組,能做的事情更多回还。在一個二維數(shù)組中裆泳,各索引位置上的元素不再是標(biāo)量而是一維數(shù)組:
In [72]: arr2d = np.array([[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]])
In [73]: arr2d[2]
Out[73]: array([7, 8, 9])
因此,可以對各個元素進行遞歸訪問柠硕,但這樣需要做的事情有點多工禾。你可以傳入一個以逗號隔開的索引列表來選取單個元素运提。也就是說,下面兩種方式是等價的:
In [74]: arr2d[0][2]
Out[74]: 3
In [75]: arr2d[0, 2]
Out[75]: 3
圖4-1說明了二維數(shù)組的索引方式闻葵。軸0作為行民泵,軸1作為列。
在多維數(shù)組中槽畔,如果省略了后面的索引栈妆,則返回對象會是一個維度低一點的ndarray(它含有高一級維度上的所有數(shù)據(jù))。因此厢钧,在2×2×3數(shù)組arr3d中:
In [76]: arr3d = np.array([[[1, 2, 3], [4, 5, 6]], [[7, 8, 9], [10, 11, 12]]])
In [77]: arr3d
Out[77]:
array([[[ 1, 2, 3],
[ 4, 5, 6]],
[[ 7, 8, 9],
[10, 11, 12]]])
arr3d[0]是一個2×3數(shù)組:
In [78]: arr3d[0]
Out[78]:
array([[1, 2, 3],
[4, 5, 6]])
標(biāo)量值和數(shù)組都可以被賦值給arr3d[0]:
In [79]: old_values = arr3d[0].copy()
In [80]: arr3d[0] = 42
In [81]: arr3d
Out[81]:
array([[[42, 42, 42],
[42, 42, 42]],
[[ 7, 8, 9],
[10, 11, 12]]])
In [82]: arr3d[0] = old_values
In [83]: arr3d
Out[83]:
array([[[ 1, 2, 3],
[ 4, 5, 6]],
[[ 7, 8, 9],
[10, 11, 12]]])
相似的鳞尔,arr3d[1,0]可以訪問索引以(1,0)開頭的那些值(以一維數(shù)組的形式返回):
In [84]: arr3d[1, 0]
Out[84]: array([7, 8, 9])
雖然是用兩步進行索引的,表達式是相同的:
In [85]: x = arr3d[1]
In [86]: x
Out[86]:
array([[ 7, 8, 9],
[10, 11, 12]])
In [87]: x[0]
Out[87]: array([7, 8, 9])
注意早直,在上面所有這些選取數(shù)組子集的例子中铅檩,返回的數(shù)組都是視圖。
切片索引
ndarray的切片語法跟Python列表這樣的一維對象差不多:
In [88]: arr
Out[88]: array([ 0, 1, 2, 3, 4, 64, 64, 64, 8, 9])
In [89]: arr[1:6]
Out[89]: array([ 1, 2, 3, 4, 64])
對于之前的二維數(shù)組arr2d莽鸿,其切片方式稍顯不同:
In [90]: arr2d
Out[90]:
array([[1, 2, 3],
[4, 5, 6],
[7, 8, 9]])
In [91]: arr2d[:2]
Out[91]:
array([[1, 2, 3],
[4, 5, 6]])
可以看出,它是沿著第0軸(即第一個軸)切片的拾给。也就是說祥得,切片是沿著一個軸向選取元素的。表達式arr2d[:2]可以被認(rèn)為是“選取arr2d的前兩行”蒋得。
你可以一次傳入多個切片级及,就像傳入多個索引那樣:
In [92]: arr2d[:2, 1:]
Out[92]:
array([[2, 3],
[5, 6]])
像這樣進行切片時,只能得到相同維數(shù)的數(shù)組視圖额衙。通過將整數(shù)索引和切片混合饮焦,可以得到低維度的切片。
例如窍侧,我可以選取第二行的前兩列:
In [93]: arr2d[1, :2]
Out[93]: array([4, 5])
相似的县踢,還可以選擇第三列的前兩行:
In [94]: arr2d[:2, 2]
Out[94]: array([3, 6])
圖4-2對此進行了說明。注意伟件,“只有冒號”表示選取整個軸硼啤,因此你可以像下面這樣只對高維軸進行切片:
In [95]: arr2d[:, :1]
Out[95]:
array([[1],
[4],
[7]])
自然,對切片表達式的賦值操作也會被擴散到整個選區(qū):
In [96]: arr2d[:2, 1:] = 0
In [97]: arr2d
Out[97]:
array([[1, 0, 0],
[4, 0, 0],
[7, 8, 9]])
布爾型索引
來看這樣一個例子斧账,假設(shè)我們有一個用于存儲數(shù)據(jù)的數(shù)組以及一個存儲姓名的數(shù)組(含有重復(fù)項)谴返。在這里,我將使用numpy.random中的randn函數(shù)生成一些正態(tài)分布的隨機數(shù)據(jù):
In [98]: names = np.array(['Bob', 'Joe', 'Will', 'Bob', 'Will', 'Joe', 'Joe'])
In [99]: data = np.random.randn(7, 4)
In [100]: names
Out[100]:
array(['Bob', 'Joe', 'Will', 'Bob', 'Will', 'Joe', 'Joe'],
dtype='<U4')
In [101]: data
Out[101]:
array([[ 0.0929, 0.2817, 0.769 , 1.2464],
[ 1.0072, -1.2962, 0.275 , 0.2289],
[ 1.3529, 0.8864, -2.0016, -0.3718],
[ 1.669 , -0.4386, -0.5397, 0.477 ],
[ 3.2489, -1.0212, -0.5771, 0.1241],
[ 0.3026, 0.5238, 0.0009, 1.3438],
[-0.7135, -0.8312, -2.3702, -1.8608]])
假設(shè)每個名字都對應(yīng)data數(shù)組中的一行咧织,而我們想要選出對應(yīng)于名字"Bob"的所有行嗓袱。跟算術(shù)運算一樣,數(shù)組的比較運算(如==)也是矢量化的习绢。因此渠抹,對names和字符串"Bob"的比較運算將會產(chǎn)生一個布爾型數(shù)組:
In [102]: names == 'Bob'
Out[102]: array([ True, False, False, True, False, False, False], dtype=bool)
這個布爾型數(shù)組可用于數(shù)組索引:
In [103]: data[names == 'Bob']
Out[103]:
array([[ 0.0929, 0.2817, 0.769 , 1.2464],
[ 1.669 , -0.4386, -0.5397, 0.477 ]])
布爾型數(shù)組的長度必須跟被索引的軸長度一致。此外,還可以將布爾型數(shù)組跟切片逼肯、整數(shù)(或整數(shù)序列耸黑,稍后將對此進行詳細(xì)講解)混合使用:
In [103]: data[names == 'Bob']
Out[103]:
array([[ 0.0929, 0.2817, 0.769 , 1.2464],
[ 1.669 , -0.4386, -0.5397, 0.477 ]])
注意:如果布爾型數(shù)組的長度不對,布爾型選擇就會出錯篮幢,因此一定要小心大刊。
下面的例子,我選取了names == 'Bob'
的行三椿,并索引了列:
In [104]: data[names == 'Bob', 2:]
Out[104]:
array([[ 0.769 , 1.2464],
[-0.5397, 0.477 ]])
In [105]: data[names == 'Bob', 3]
Out[105]: array([ 1.2464, 0.477 ])
要選擇除"Bob"以外的其他值缺菌,既可以使用不等于符號(!=),也可以通過~對條件進行否定:
In [106]: names != 'Bob'
Out[106]: array([False, True, True, False, True, True, True], dtype=bool)
In [107]: data[~(names == 'Bob')]
Out[107]:
array([[ 1.0072, -1.2962, 0.275 , 0.2289],
[ 1.3529, 0.8864, -2.0016, -0.3718],
[ 3.2489, -1.0212, -0.5771, 0.1241],
[ 0.3026, 0.5238, 0.0009, 1.3438],
[-0.7135, -0.8312, -2.3702, -1.8608]])
~操作符用來反轉(zhuǎn)條件很好用:
In [108]: cond = names == 'Bob'
In [109]: data[~cond]
Out[109]:
array([[ 1.0072, -1.2962, 0.275 , 0.2289],
[ 1.3529, 0.8864, -2.0016, -0.3718],
[ 3.2489, -1.0212, -0.5771, 0.1241],
[ 0.3026, 0.5238, 0.0009, 1.3438],
[-0.7135, -0.8312, -2.3702, -1.8608]])
選取這三個名字中的兩個需要組合應(yīng)用多個布爾條件搜锰,使用&(和)伴郁、|(或)之類的布爾算術(shù)運算符即可:
In [110]: mask = (names == 'Bob') | (names == 'Will')
In [111]: mask
Out[111]: array([ True, False, True, True, True, False, False], dtype=bool)
In [112]: data[mask]
Out[112]:
array([[ 0.0929, 0.2817, 0.769 , 1.2464],
[ 1.3529, 0.8864, -2.0016, -0.3718],
[ 1.669 , -0.4386, -0.5397, 0.477 ],
[ 3.2489, -1.0212, -0.5771, 0.1241]])
通過布爾型索引選取數(shù)組中的數(shù)據(jù),將總是創(chuàng)建數(shù)據(jù)的副本蛋叼,即使返回一模一樣的數(shù)組也是如此焊傅。
注意:Python關(guān)鍵字and和or在布爾型數(shù)組中無效。要使用&與|狈涮。
通過布爾型數(shù)組設(shè)置值是一種經(jīng)常用到的手段狐胎。為了將data中的所有負(fù)值都設(shè)置為0,我們只需:
In [113]: data[data < 0] = 0
In [114]: data
Out[114]:
array([[ 0.0929, 0.2817, 0.769 , 1.2464],
[ 1.0072, 0. , 0.275 , 0.2289],
[ 1.3529, 0.8864, 0. , 0. ],
[ 1.669 , 0. , 0. , 0.477 ],
[ 3.2489, 0. , 0. , 0.1241],
[ 0.3026, 0.5238, 0.0009, 1.3438],
[ 0. , 0. , 0. , 0. ]])
通過一維布爾數(shù)組設(shè)置整行或列的值也很簡單:
In [115]: data[names != 'Joe'] = 7
In [116]: data
Out[116]:
array([[ 7. , 7. , 7. , 7. ],
[ 1.0072, 0. , 0.275 , 0.2289],
[ 7. , 7. , 7. , 7. ],
[ 7. , 7. , 7. , 7. ],
[ 7. , 7. , 7. , 7. ],
[ 0.3026, 0.5238, 0.0009, 1.3438],
[ 0. , 0. , 0. , 0. ]])
后面會看到歌馍,這類二維數(shù)據(jù)的操作也可以用pandas方便的來做握巢。
花式索引
花式索引(Fancy indexing)是一個NumPy術(shù)語,它指的是利用整數(shù)數(shù)組進行索引松却。假設(shè)我們有一個8×4數(shù)組:
In [117]: arr = np.empty((8, 4))
In [118]: for i in range(8):
.....: arr[i] = i
In [119]: arr
Out[119]:
array([[ 0., 0., 0., 0.],
[ 1., 1., 1., 1.],
[ 2., 2., 2., 2.],
[ 3., 3., 3., 3.],
[ 4., 4., 4., 4.],
[ 5., 5., 5., 5.],
[ 6., 6., 6., 6.],
[ 7., 7., 7., 7.]])
為了以特定順序選取行子集暴浦,只需傳入一個用于指定順序的整數(shù)列表或ndarray即可:
In [120]: arr[[4, 3, 0, 6]]
Out[120]:
array([[ 4., 4., 4., 4.],
[ 3., 3., 3., 3.],
[ 0., 0., 0., 0.],
[ 6., 6., 6., 6.]])
這段代碼確實達到我們的要求了!使用負(fù)數(shù)索引將會從末尾開始選取行:
In [121]: arr[[-3, -5, -7]]
Out[121]:
array([[ 5., 5., 5., 5.],
[ 3., 3., 3., 3.],
[ 1., 1., 1., 1.]])
一次傳入多個索引數(shù)組會有一點特別晓锻。它返回的是一個一維數(shù)組歌焦,其中的元素對應(yīng)各個索引元組:
In [122]: arr = np.arange(32).reshape((8, 4))
In [123]: arr
Out[123]:
array([[ 0, 1, 2, 3],
[ 4, 5, 6, 7],
[ 8, 9, 10, 11],
[12, 13, 14, 15],
[16, 17, 18, 19],
[20, 21, 22, 23],
[24, 25, 26, 27],
[28, 29, 30, 31]])
In [124]: arr[[1, 5, 7, 2], [0, 3, 1, 2]]
Out[124]: array([ 4, 23, 29, 10])
附錄A中會詳細(xì)介紹reshape方法。
最終選出的是元素(1,0)砚哆、(5,3)同规、(7,1)和(2,2)。無論數(shù)組是多少維的窟社,花式索引總是一維的券勺。
這個花式索引的行為可能會跟某些用戶的預(yù)期不一樣(包括我在內(nèi)),選取矩陣的行列子集應(yīng)該是矩形區(qū)域的形式才對灿里。下面是得到該結(jié)果的一個辦法:
In [125]: arr[[1, 5, 7, 2]][:, [0, 3, 1, 2]]
Out[125]:
array([[ 4, 7, 5, 6],
[20, 23, 21, 22],
[28, 31, 29, 30],
[ 8, 11, 9, 10]])
記住关炼,花式索引跟切片不一樣,它總是將數(shù)據(jù)復(fù)制到新數(shù)組中匣吊。
數(shù)組轉(zhuǎn)置和軸對換
轉(zhuǎn)置是重塑的一種特殊形式儒拂,它返回的是源數(shù)據(jù)的視圖(不會進行任何復(fù)制操作)寸潦。數(shù)組不僅有transpose方法,還有一個特殊的T屬性:
In [126]: arr = np.arange(15).reshape((3, 5))
In [127]: arr
Out[127]:
array([[ 0, 1, 2, 3, 4],
[ 5, 6, 7, 8, 9],
[10, 11, 12, 13, 14]])
In [128]: arr.T
Out[128]:
array([[ 0, 5, 10],
[ 1, 6, 11],
[ 2, 7, 12],
[ 3, 8, 13],
[ 4, 9, 14]])
在進行矩陣計算時社痛,經(jīng)常需要用到該操作见转,比如利用np.dot計算矩陣內(nèi)積:
In [129]: arr = np.random.randn(6, 3)
In [130]: arr
Out[130]:
array([[-0.8608, 0.5601, -1.2659],
[ 0.1198, -1.0635, 0.3329],
[-2.3594, -0.1995, -1.542 ],
[-0.9707, -1.307 , 0.2863],
[ 0.378 , -0.7539, 0.3313],
[ 1.3497, 0.0699, 0.2467]])
In [131]: np.dot(arr.T, arr)
Out[131]:
array([[ 9.2291, 0.9394, 4.948 ],
[ 0.9394, 3.7662, -1.3622],
[ 4.948 , -1.3622, 4.3437]])
對于高維數(shù)組,transpose需要得到一個由軸編號組成的元組才能對這些軸進行轉(zhuǎn)置(比較費腦子):
In [132]: arr = np.arange(16).reshape((2, 2, 4))
In [133]: arr
Out[133]:
array([[[ 0, 1, 2, 3],
[ 4, 5, 6, 7]],
[[ 8, 9, 10, 11],
[12, 13, 14, 15]]])
In [134]: arr.transpose((1, 0, 2))
Out[134]:
array([[[ 0, 1, 2, 3],
[ 8, 9, 10, 11]],
[[ 4, 5, 6, 7],
[12, 13, 14, 15]]])
這里蒜哀,第一個軸被換成了第二個斩箫,第二個軸被換成了第一個,最后一個軸不變撵儿。
簡單的轉(zhuǎn)置可以使用.T乘客,它其實就是進行軸對換而已。ndarray還有一個swapaxes方法淀歇,它需要接受一對軸編號:
In [135]: arr
Out[135]:
array([[[ 0, 1, 2, 3],
[ 4, 5, 6, 7]],
[[ 8, 9, 10, 11],
[12, 13, 14, 15]]])
In [136]: arr.swapaxes(1, 2)
Out[136]:
array([[[ 0, 4],
[ 1, 5],
[ 2, 6],
[ 3, 7]],
[[ 8, 12],
[ 9, 13],
[10, 14],
[11, 15]]])
swapaxes也是返回源數(shù)據(jù)的視圖(不會進行任何復(fù)制操作)易核。
4.2 通用函數(shù):快速的元素級數(shù)組函數(shù)
通用函數(shù)(即ufunc)是一種對ndarray中的數(shù)據(jù)執(zhí)行元素級運算的函數(shù)。你可以將其看做簡單函數(shù)(接受一個或多個標(biāo)量值浪默,并產(chǎn)生一個或多個標(biāo)量值)的矢量化包裝器牡直。
許多ufunc都是簡單的元素級變體,如sqrt和exp:
In [137]: arr = np.arange(10)
In [138]: arr
Out[138]: array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9])
In [139]: np.sqrt(arr)
Out[139]:
array([ 0. , 1. , 1.4142, 1.7321, 2. , 2.2361, 2.4495,
2.6458, 2.8284, 3. ])
In [140]: np.exp(arr)
Out[140]:
array([ 1. , 2.7183, 7.3891, 20.0855, 54.5982,
148.4132, 403.4288, 1096.6332, 2980.958 , 8103.0839])
這些都是一元(unary)ufunc纳决。另外一些(如add或maximum)接受2個數(shù)組(因此也叫二元(binary)ufunc)井氢,并返回一個結(jié)果數(shù)組:
In [141]: x = np.random.randn(8)
In [142]: y = np.random.randn(8)
In [143]: x
Out[143]:
array([-0.0119, 1.0048, 1.3272, -0.9193, -1.5491, 0.0222, 0.7584,
-0.6605])
In [144]: y
Out[144]:
array([ 0.8626, -0.01 , 0.05 , 0.6702, 0.853 , -0.9559, -0.0235,
-2.3042])
In [145]: np.maximum(x, y)
Out[145]:
array([ 0.8626, 1.0048, 1.3272, 0.6702, 0.853 , 0.0222, 0.7584,
-0.6605])
這里,numpy.maximum計算了x和y中元素級別最大的元素岳链。
雖然并不常見,但有些ufunc的確可以返回多個數(shù)組劲件。modf就是一個例子掸哑,它是Python內(nèi)置函數(shù)divmod的矢量化版本,它會返回浮點數(shù)數(shù)組的小數(shù)和整數(shù)部分:
In [146]: arr = np.random.randn(7) * 5
In [147]: arr
Out[147]: array([-3.2623, -6.0915, -6.663 , 5.3731, 3.6182, 3.45 , 5.0077])
In [148]: remainder, whole_part = np.modf(arr)
In [149]: remainder
Out[149]: array([-0.2623, -0.0915, -0.663 , 0.3731,
0.6182, 0.45 , 0.0077])
In [150]: whole_part
Out[150]: array([-3., -6., -6., 5., 3., 3., 5.])
Ufuncs可以接受一個out可選參數(shù)零远,這樣就能在數(shù)組原地進行操作:
In [151]: arr
Out[151]: array([-3.2623, -6.0915, -6.663 , 5.3731, 3.6182, 3.45 , 5.0077])
In [152]: np.sqrt(arr)
Out[152]: array([ nan, nan, nan, 2.318 , 1.9022, 1.8574, 2.2378])
In [153]: np.sqrt(arr, arr)
Out[153]: array([ nan, nan, nan, 2.318 , 1.9022, 1.8574, 2.2378])
In [154]: arr
Out[154]: array([ nan, nan, nan, 2.318 , 1.9022, 1.8574, 2.2378])
表4-3和表4-4分別列出了一些一元和二元ufunc苗分。
4.3 利用數(shù)組進行數(shù)據(jù)處理
NumPy數(shù)組使你可以將許多種數(shù)據(jù)處理任務(wù)表述為簡潔的數(shù)組表達式(否則需要編寫循環(huán))。用數(shù)組表達式代替循環(huán)的做法牵辣,通常被稱為矢量化摔癣。一般來說,矢量化數(shù)組運算要比等價的純Python方式快上一兩個數(shù)量級(甚至更多)纬向,尤其是各種數(shù)值計算择浊。在后面內(nèi)容中(見附錄A)我將介紹廣播,這是一種針對矢量化計算的強大手段逾条。
作為簡單的例子琢岩,假設(shè)我們想要在一組值(網(wǎng)格型)上計算函數(shù)sqrt(x^2+y^2)
。np.meshgrid函數(shù)接受兩個一維數(shù)組师脂,并產(chǎn)生兩個二維矩陣(對應(yīng)于兩個數(shù)組中所有的(x,y)對):
In [155]: points = np.arange(-5, 5, 0.01) # 1000 equally spaced points
In [156]: xs, ys = np.meshgrid(points, points)
In [157]: ys
Out[157]:
array([[-5. , -5. , -5. , ..., -5. , -5. , -5. ],
[-4.99, -4.99, -4.99, ..., -4.99, -4.99, -4.99],
[-4.98, -4.98, -4.98, ..., -4.98, -4.98, -4.98],
...,
[ 4.97, 4.97, 4.97, ..., 4.97, 4.97, 4.97],
[ 4.98, 4.98, 4.98, ..., 4.98, 4.98, 4.98],
[ 4.99, 4.99, 4.99, ..., 4.99, 4.99, 4.99]])
現(xiàn)在担孔,對該函數(shù)的求值運算就好辦了江锨,把這兩個數(shù)組當(dāng)做兩個浮點數(shù)那樣編寫表達式即可:
In [158]: z = np.sqrt(xs ** 2 + ys ** 2)
In [159]: z
Out[159]:
array([[ 7.0711, 7.064 , 7.0569, ..., 7.0499, 7.0569, 7.064 ],
[ 7.064 , 7.0569, 7.0499, ..., 7.0428, 7.0499, 7.0569],
[ 7.0569, 7.0499, 7.0428, ..., 7.0357, 7.0428, 7.0499],
...,
[ 7.0499, 7.0428, 7.0357, ..., 7.0286, 7.0357, 7.0428],
[ 7.0569, 7.0499, 7.0428, ..., 7.0357, 7.0428, 7.0499],
[ 7.064 , 7.0569, 7.0499, ..., 7.0428, 7.0499, 7.0569]])
作為第9章的先導(dǎo),我用matplotlib創(chuàng)建了這個二維數(shù)組的可視化:
In [160]: import matplotlib.pyplot as plt
In [161]: plt.imshow(z, cmap=plt.cm.gray); plt.colorbar()
Out[161]: <matplotlib.colorbar.Colorbar at 0x7f715e3fa630>
In [162]: plt.title("Image plot of $\sqrt{x^2 + y^2}$ for a grid of values")
Out[162]: <matplotlib.text.Text at 0x7f715d2de748>
見圖4-3糕篇。這張圖是用matplotlib的imshow函數(shù)創(chuàng)建的啄育。
將條件邏輯表述為數(shù)組運算
numpy.where函數(shù)是三元表達式x if condition else y的矢量化版本。假設(shè)我們有一個布爾數(shù)組和兩個值數(shù)組:
In [165]: xarr = np.array([1.1, 1.2, 1.3, 1.4, 1.5])
In [166]: yarr = np.array([2.1, 2.2, 2.3, 2.4, 2.5])
In [167]: cond = np.array([True, False, True, True, False])
假設(shè)我們想要根據(jù)cond中的值選取xarr和yarr的值:當(dāng)cond中的值為True時拌消,選取xarr的值挑豌,否則從yarr中選取。列表推導(dǎo)式的寫法應(yīng)該如下所示:
In [168]: result = [(x if c else y)
.....: for x, y, c in zip(xarr, yarr, cond)]
In [169]: result
Out[169]: [1.1000000000000001, 2.2000000000000002, 1.3, 1.3999999999999999, 2.5]
這有幾個問題拼坎。第一浮毯,它對大數(shù)組的處理速度不是很快(因為所有工作都是由純Python完成的)。第二泰鸡,無法用于多維數(shù)組债蓝。若使用np.where,則可以將該功能寫得非常簡潔:
In [170]: result = np.where(cond, xarr, yarr)
In [171]: result
Out[171]: array([ 1.1, 2.2, 1.3, 1.4, 2.5])
np.where的第二個和第三個參數(shù)不必是數(shù)組盛龄,它們都可以是標(biāo)量值饰迹。在數(shù)據(jù)分析工作中,where通常用于根據(jù)另一個數(shù)組而產(chǎn)生一個新的數(shù)組余舶。假設(shè)有一個由隨機數(shù)據(jù)組成的矩陣啊鸭,你希望將所有正值替換為2,將所有負(fù)值替換為-2匿值。若利用np.where赠制,則會非常簡單:
In [172]: arr = np.random.randn(4, 4)
In [173]: arr
Out[173]:
array([[-0.5031, -0.6223, -0.9212, -0.7262],
[ 0.2229, 0.0513, -1.1577, 0.8167],
[ 0.4336, 1.0107, 1.8249, -0.9975],
[ 0.8506, -0.1316, 0.9124, 0.1882]])
In [174]: arr > 0
Out[174]:
array([[False, False, False, False],
[ True, True, False, True],
[ True, True, True, False],
[ True, False, True, True]], dtype=bool)
In [175]: np.where(arr > 0, 2, -2)
Out[175]:
array([[-2, -2, -2, -2],
[ 2, 2, -2, 2],
[ 2, 2, 2, -2],
[ 2, -2, 2, 2]])
使用np.where,可以將標(biāo)量和數(shù)組結(jié)合起來挟憔。例如钟些,我可用常數(shù)2替換arr中所有正的值:
In [176]: np.where(arr > 0, 2, arr) # set only positive values to 2
Out[176]:
array([[-0.5031, -0.6223, -0.9212, -0.7262],
[ 2. , 2. , -1.1577, 2. ],
[ 2. , 2. , 2. , -0.9975],
[ 2. , -0.1316, 2. , 2. ]])
傳遞給where的數(shù)組大小可以不相等,甚至可以是標(biāo)量值绊谭。
數(shù)學(xué)和統(tǒng)計方法
可以通過數(shù)組上的一組數(shù)學(xué)函數(shù)對整個數(shù)組或某個軸向的數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計計算政恍。sum、mean以及標(biāo)準(zhǔn)差std等聚合計算(aggregation达传,通常叫做約簡(reduction))既可以當(dāng)做數(shù)組的實例方法調(diào)用篙耗,也可以當(dāng)做頂級NumPy函數(shù)使用。
這里宪赶,我生成了一些正態(tài)分布隨機數(shù)據(jù)宗弯,然后做了聚類統(tǒng)計:
In [177]: arr = np.random.randn(5, 4)
In [178]: arr
Out[178]:
array([[ 2.1695, -0.1149, 2.0037, 0.0296],
[ 0.7953, 0.1181, -0.7485, 0.585 ],
[ 0.1527, -1.5657, -0.5625, -0.0327],
[-0.929 , -0.4826, -0.0363, 1.0954],
[ 0.9809, -0.5895, 1.5817, -0.5287]])
In [179]: arr.mean()
Out[179]: 0.19607051119998253
In [180]: np.mean(arr)
Out[180]: 0.19607051119998253
In [181]: arr.sum()
Out[181]: 3.9214102239996507
mean和sum這類的函數(shù)可以接受一個axis選項參數(shù),用于計算該軸向上的統(tǒng)計值搂妻,最終結(jié)果是一個少一維的數(shù)組:
In [182]: arr.mean(axis=1)
Out[182]: array([ 1.022 , 0.1875, -0.502 , -0.0881, 0.3611])
In [183]: arr.sum(axis=0)
Out[183]: array([ 3.1693, -2.6345, 2.2381, 1.1486])
這里罕伯,arr.mean(1)是“計算行的平均值”,arr.sum(0)是“計算每列的和”叽讳。
其他如cumsum和cumprod之類的方法則不聚合追他,而是產(chǎn)生一個由中間結(jié)果組成的數(shù)組:
In [184]: arr = np.array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7])
In [185]: arr.cumsum()
Out[185]: array([ 0, 1, 3, 6, 10, 15, 21, 28])
在多維數(shù)組中坟募,累加函數(shù)(如cumsum)返回的是同樣大小的數(shù)組,但是會根據(jù)每個低維的切片沿著標(biāo)記軸計算部分聚類:
In [186]: arr = np.array([[0, 1, 2], [3, 4, 5], [6, 7, 8]])
In [187]: arr
Out[187]:
array([[0, 1, 2],
[3, 4, 5],
[6, 7, 8]])
In [188]: arr.cumsum(axis=0)
Out[188]:
array([[ 0, 1, 2],
[ 3, 5, 7],
[ 9, 12, 15]])
In [189]: arr.cumprod(axis=1)
Out[189]:
array([[ 0, 0, 0],
[ 3, 12, 60],
[ 6, 42, 336]])
表4-5列出了全部的基本數(shù)組統(tǒng)計方法邑狸。后續(xù)章節(jié)中有很多例子都會用到這些方法懈糯。
用于布爾型數(shù)組的方法
在上面這些方法中,布爾值會被強制轉(zhuǎn)換為1(True)和0(False)单雾。因此赚哗,sum經(jīng)常被用來對布爾型數(shù)組中的True值計數(shù):
In [190]: arr = np.random.randn(100)
In [191]: (arr > 0).sum() # Number of positive values
Out[191]: 42
另外還有兩個方法any和all,它們對布爾型數(shù)組非常有用硅堆。any用于測試數(shù)組中是否存在一個或多個True屿储,而all則檢查數(shù)組中所有值是否都是True:
In [192]: bools = np.array([False, False, True, False])
In [193]: bools.any()
Out[193]: True
In [194]: bools.all()
Out[194]: False
這兩個方法也能用于非布爾型數(shù)組,所有非0元素將會被當(dāng)做True渐逃。
排序
跟Python內(nèi)置的列表類型一樣够掠,NumPy數(shù)組也可以通過sort方法就地排序:
In [195]: arr = np.random.randn(6)
In [196]: arr
Out[196]: array([ 0.6095, -0.4938, 1.24 , -0.1357, 1.43 , -0.8469])
In [197]: arr.sort()
In [198]: arr
Out[198]: array([-0.8469, -0.4938, -0.1357, 0.6095, 1.24 , 1.43 ])
多維數(shù)組可以在任何一個軸向上進行排序,只需將軸編號傳給sort即可:
In [199]: arr = np.random.randn(5, 3)
In [200]: arr
Out[200]:
array([[ 0.6033, 1.2636, -0.2555],
[-0.4457, 0.4684, -0.9616],
[-1.8245, 0.6254, 1.0229],
[ 1.1074, 0.0909, -0.3501],
[ 0.218 , -0.8948, -1.7415]])
In [201]: arr.sort(1)
In [202]: arr
Out[202]:
array([[-0.2555, 0.6033, 1.2636],
[-0.9616, -0.4457, 0.4684],
[-1.8245, 0.6254, 1.0229],
[-0.3501, 0.0909, 1.1074],
[-1.7415, -0.8948, 0.218 ]])
頂級方法np.sort返回的是數(shù)組的已排序副本茄菊,而就地排序則會修改數(shù)組本身疯潭。計算數(shù)組分位數(shù)最簡單的辦法是對其進行排序,然后選取特定位置的值:
In [203]: large_arr = np.random.randn(1000)
In [204]: large_arr.sort()
In [205]: large_arr[int(0.05 * len(large_arr))] # 5% quantile
Out[205]: -1.5311513550102103
更多關(guān)于NumPy排序方法以及諸如間接排序之類的高級技術(shù)面殖,請參閱附錄A竖哩。在pandas中還可以找到一些其他跟排序有關(guān)的數(shù)據(jù)操作(比如根據(jù)一列或多列對表格型數(shù)據(jù)進行排序)。
唯一化以及其它的集合邏輯
NumPy提供了一些針對一維ndarray的基本集合運算脊僚。最常用的可能要數(shù)np.unique了相叁,它用于找出數(shù)組中的唯一值并返回已排序的結(jié)果:
In [206]: names = np.array(['Bob', 'Joe', 'Will', 'Bob', 'Will', 'Joe', 'Joe'])
In [207]: np.unique(names)
Out[207]:
array(['Bob', 'Joe', 'Will'],
dtype='<U4')
In [208]: ints = np.array([3, 3, 3, 2, 2, 1, 1, 4, 4])
In [209]: np.unique(ints)
Out[209]: array([1, 2, 3, 4])
拿跟np.unique等價的純Python代碼來對比一下:
In [210]: sorted(set(names))
Out[210]: ['Bob', 'Joe', 'Will']
另一個函數(shù)np.in1d用于測試一個數(shù)組中的值在另一個數(shù)組中的成員資格,返回一個布爾型數(shù)組:
In [211]: values = np.array([6, 0, 0, 3, 2, 5, 6])
In [212]: np.in1d(values, [2, 3, 6])
Out[212]: array([ True, False, False, True, True, False, True], dtype=bool)
NumPy中的集合函數(shù)請參見表4-6辽幌。
4.4 用于數(shù)組的文件輸入輸出
NumPy能夠讀寫磁盤上的文本數(shù)據(jù)或二進制數(shù)據(jù)增淹。這一小節(jié)只討論NumPy的內(nèi)置二進制格式,因為更多的用戶會使用pandas或其它工具加載文本或表格數(shù)據(jù)(見第6章)舶衬。
np.save和np.load是讀寫磁盤數(shù)組數(shù)據(jù)的兩個主要函數(shù)。默認(rèn)情況下赎离,數(shù)組是以未壓縮的原始二進制格式保存在擴展名為.npy的文件中的:
In [213]: arr = np.arange(10)
In [214]: np.save('some_array', arr)
如果文件路徑末尾沒有擴展名.npy逛犹,則該擴展名會被自動加上。然后就可以通過np.load讀取磁盤上的數(shù)組:
In [215]: np.load('some_array.npy')
Out[215]: array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9])
通過np.savez可以將多個數(shù)組保存到一個未壓縮文件中梁剔,將數(shù)組以關(guān)鍵字參數(shù)的形式傳入即可:
In [216]: np.savez('array_archive.npz', a=arr, b=arr)
加載.npz文件時虽画,你會得到一個類似字典的對象,該對象會對各個數(shù)組進行延遲加載:
In [217]: arch = np.load('array_archive.npz')
In [218]: arch['b']
Out[218]: array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9])
如果要將數(shù)據(jù)壓縮荣病,可以使用numpy.savez_compressed:
In [219]: np.savez_compressed('arrays_compressed.npz', a=arr, b=arr)
4.5 線性代數(shù)
線性代數(shù)(如矩陣乘法码撰、矩陣分解、行列式以及其他方陣數(shù)學(xué)等)是任何數(shù)組庫的重要組成部分个盆。不像某些語言(如MATLAB)脖岛,通過*對兩個二維數(shù)組相乘得到的是一個元素級的積朵栖,而不是一個矩陣點積。因此柴梆,NumPy提供了一個用于矩陣乘法的dot函數(shù)(既是一個數(shù)組方法也是numpy命名空間中的一個函數(shù)):
In [223]: x = np.array([[1., 2., 3.], [4., 5., 6.]])
In [224]: y = np.array([[6., 23.], [-1, 7], [8, 9]])
In [225]: x
Out[225]:
array([[ 1., 2., 3.],
[ 4., 5., 6.]])
In [226]: y
Out[226]:
array([[ 6., 23.],
[ -1., 7.],
[ 8., 9.]])
In [227]: x.dot(y)
Out[227]:
array([[ 28., 64.],
[ 67., 181.]])
x.dot(y)等價于np.dot(x, y):
In [228]: np.dot(x, y)
Out[228]:
array([[ 28., 64.],
[ 67., 181.]])
一個二維數(shù)組跟一個大小合適的一維數(shù)組的矩陣點積運算之后將會得到一個一維數(shù)組:
In [229]: np.dot(x, np.ones(3))
Out[229]: array([ 6., 15.])
@符(類似Python 3.5)也可以用作中綴運算符陨溅,進行矩陣乘法:
In [230]: x @ np.ones(3)
Out[230]: array([ 6., 15.])
numpy.linalg中有一組標(biāo)準(zhǔn)的矩陣分解運算以及諸如求逆和行列式之類的東西。它們跟MATLAB和R等語言所使用的是相同的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)線性代數(shù)庫绍在,如BLAS门扇、LAPACK、Intel MKL(Math Kernel Library偿渡,可能有臼寄,取決于你的NumPy版本)等:
In [231]: from numpy.linalg import inv, qr
In [232]: X = np.random.randn(5, 5)
In [233]: mat = X.T.dot(X)
In [234]: inv(mat)
Out[234]:
array([[ 933.1189, 871.8258, -1417.6902, -1460.4005, 1782.1391],
[ 871.8258, 815.3929, -1325.9965, -1365.9242, 1666.9347],
[-1417.6902, -1325.9965, 2158.4424, 2222.0191, -2711.6822],
[-1460.4005, -1365.9242, 2222.0191, 2289.0575, -2793.422 ],
[ 1782.1391, 1666.9347, -2711.6822, -2793.422 , 3409.5128]])
In [235]: mat.dot(inv(mat))
Out[235]:
array([[ 1., 0., -0., -0., -0.],
[-0., 1., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 1., 0., 0.],
[-0., 0., 0., 1., -0.],
[-0., 0., 0., 0., 1.]])
In [236]: q, r = qr(mat)
In [237]: r
Out[237]:
array([[-1.6914, 4.38 , 0.1757, 0.4075, -0.7838],
[ 0. , -2.6436, 0.1939, -3.072 , -1.0702],
[ 0. , 0. , -0.8138, 1.5414, 0.6155],
[ 0. , 0. , 0. , -2.6445, -2.1669],
[ 0. , 0. , 0. , 0. , 0.0002]])
表達式X.T.dot(X)計算X和它的轉(zhuǎn)置X.T的點積。
表4-7中列出了一些最常用的線性代數(shù)函數(shù)溜宽。
4.6 偽隨機數(shù)生成
numpy.random模塊對Python內(nèi)置的random進行了補充吉拳,增加了一些用于高效生成多種概率分布的樣本值的函數(shù)。例如坑质,你可以用normal來得到一個標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)分布的4×4樣本數(shù)組:
In [238]: samples = np.random.normal(size=(4, 4))
In [239]: samples
Out[239]:
array([[ 0.5732, 0.1933, 0.4429, 1.2796],
[ 0.575 , 0.4339, -0.7658, -1.237 ],
[-0.5367, 1.8545, -0.92 , -0.1082],
[ 0.1525, 0.9435, -1.0953, -0.144 ]])
而Python內(nèi)置的random模塊則只能一次生成一個樣本值合武。從下面的測試結(jié)果中可以看出,如果需要產(chǎn)生大量樣本值涡扼,numpy.random快了不止一個數(shù)量級:
In [240]: from random import normalvariate
In [241]: N = 1000000
In [242]: %timeit samples = [normalvariate(0, 1) for _ in range(N)]
1.77 s +- 126 ms per loop (mean +- std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
In [243]: %timeit np.random.normal(size=N)
61.7 ms +- 1.32 ms per loop (mean +- std. dev. of 7 runs, 10 loops each)
我們說這些都是偽隨機數(shù)稼跳,是因為它們都是通過算法基于隨機數(shù)生成器種子,在確定性的條件下生成的吃沪。你可以用NumPy的np.random.seed更改隨機數(shù)生成種子:
In [244]: np.random.seed(1234)
numpy.random的數(shù)據(jù)生成函數(shù)使用了全局的隨機種子汤善。要避免全局狀態(tài),你可以使用numpy.random.RandomState票彪,創(chuàng)建一個與其它隔離的隨機數(shù)生成器:
In [245]: rng = np.random.RandomState(1234)
In [246]: rng.randn(10)
Out[246]:
array([ 0.4714, -1.191 , 1.4327, -0.3127, -0.7206, 0.8872, 0.8596,
-0.6365, 0.0157, -2.2427])
表4-8列出了numpy.random中的部分函數(shù)红淡。在下一節(jié)中,我將給出一些利用這些函數(shù)一次性生成大量樣本值的范例降铸。
4.7 示例:隨機漫步
我們通過模擬隨機漫步來說明如何運用數(shù)組運算在旱。先來看一個簡單的隨機漫步的例子:從0開始,步長1和-1出現(xiàn)的概率相等推掸。
下面是一個通過內(nèi)置的random模塊以純Python的方式實現(xiàn)1000步的隨機漫步:
In [247]: import random
.....: position = 0
.....: walk = [position]
.....: steps = 1000
.....: for i in range(steps):
.....: step = 1 if random.randint(0, 1) else -1
.....: position += step
.....: walk.append(position)
.....:
圖4-4是根據(jù)前100個隨機漫步值生成的折線圖:
In [249]: plt.plot(walk[:100])
不難看出桶蝎,這其實就是隨機漫步中各步的累計和,可以用一個數(shù)組運算來實現(xiàn)谅畅。因此登渣,我用np.random模塊一次性隨機產(chǎn)生1000個“擲硬幣”結(jié)果(即兩個數(shù)中任選一個),將其分別設(shè)置為1或-1毡泻,然后計算累計和:
In [251]: nsteps = 1000
In [252]: draws = np.random.randint(0, 2, size=nsteps)
In [253]: steps = np.where(draws > 0, 1, -1)
In [254]: walk = steps.cumsum()
有了這些數(shù)據(jù)之后胜茧,我們就可以沿著漫步路徑做一些統(tǒng)計工作了,比如求取最大值和最小值:
In [255]: walk.min()
Out[255]: -3
In [256]: walk.max()
Out[256]: 31
現(xiàn)在來看一個復(fù)雜點的統(tǒng)計任務(wù)——首次穿越時間仇味,即隨機漫步過程中第一次到達某個特定值的時間呻顽。假設(shè)我們想要知道本次隨機漫步需要多久才能距離初始0點至少10步遠(任一方向均可)雹顺。np.abs(walk)>=10可以得到一個布爾型數(shù)組,它表示的是距離是否達到或超過10芬位,而我們想要知道的是第一個10或-10的索引无拗。可以用argmax來解決這個問題昧碉,它返回的是該布爾型數(shù)組第一個最大值的索引(True就是最大值):
In [257]: (np.abs(walk) >= 10).argmax()
Out[257]: 37
注意英染,這里使用argmax并不是很高效,因為它無論如何都會對數(shù)組進行完全掃描被饿。在本例中四康,只要發(fā)現(xiàn)了一個True,那我們就知道它是個最大值了狭握。
一次模擬多個隨機漫步
如果你希望模擬多個隨機漫步過程(比如5000個)闪金,只需對上面的代碼做一點點修改即可生成所有的隨機漫步過程。只要給numpy.random的函數(shù)傳入一個二元元組就可以產(chǎn)生一個二維數(shù)組论颅,然后我們就可以一次性計算5000個隨機漫步過程(一行一個)的累計和了:
In [258]: nwalks = 5000
In [259]: nsteps = 1000
In [260]: draws = np.random.randint(0, 2, size=(nwalks, nsteps)) # 0 or 1
In [261]: steps = np.where(draws > 0, 1, -1)
In [262]: walks = steps.cumsum(1)
In [263]: walks
Out[263]:
array([[ 1, 0, 1, ..., 8, 7, 8],
[ 1, 0, -1, ..., 34, 33, 32],
[ 1, 0, -1, ..., 4, 5, 4],
...,
[ 1, 2, 1, ..., 24, 25, 26],
[ 1, 2, 3, ..., 14, 13, 14],
[ -1, -2, -3, ..., -24, -23, -22]])
現(xiàn)在哎垦,我們來計算所有隨機漫步過程的最大值和最小值:
In [264]: walks.max()
Out[264]: 138
In [265]: walks.min()
Out[265]: -133
得到這些數(shù)據(jù)之后,我們來計算30或-30的最小穿越時間恃疯。這里稍微復(fù)雜些漏设,因為不是5000個過程都到達了30。我們可以用any方法來對此進行檢查:
In [266]: hits30 = (np.abs(walks) >= 30).any(1)
In [267]: hits30
Out[267]: array([False, True, False, ..., False, True, False], dtype=bool)
In [268]: hits30.sum() # Number that hit 30 or -30
Out[268]: 3410
然后我們利用這個布爾型數(shù)組選出那些穿越了30(絕對值)的隨機漫步(行)今妄,并調(diào)用argmax在軸1上獲取穿越時間:
In [269]: crossing_times = (np.abs(walks[hits30]) >= 30).argmax(1)
In [270]: crossing_times.mean()
Out[270]: 498.88973607038122
請嘗試用其他分布方式得到漫步數(shù)據(jù)郑口。只需使用不同的隨機數(shù)生成函數(shù)即可,如normal用于生成指定均值和標(biāo)準(zhǔn)差的正態(tài)分布數(shù)據(jù):
In [271]: steps = np.random.normal(loc=0, scale=0.25,
.....: size=(nwalks, nsteps))
4.8 結(jié)論
雖然本書剩下的章節(jié)大部分是用pandas規(guī)整數(shù)據(jù)盾鳞,我們還是會用到相似的基于數(shù)組的計算犬性。在附錄A中,我們會深入挖掘NumPy的特點腾仅,進一步學(xué)習(xí)數(shù)組的技巧乒裆。