TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)學(xué)習(xí)之其他數(shù)據(jù)庫(kù)

1. GTEX數(shù)據(jù)庫(kù)：正常人的各個(gè)組織的轉(zhuǎn)錄表達(dá)和基因型

數(shù)據(jù)一般來(lái)源于意外死亡的正常人人體組織
做TCGA數(shù)據(jù)分析時(shí)一般會(huì)拿GTEX的數(shù)據(jù)作為正常對(duì)照

GTEX數(shù)據(jù)庫(kù)

2. UCSC Xena：在線探索TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中30多種癌癥的數(shù)據(jù)

缺點(diǎn)：只能探索單個(gè)基因

Xena

3. firehose

把所有的分析整理好了放在網(wǎng)站中


firehose
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