基于片斷的藥物設(shè)計（FBDD）技術(shù)當(dāng)前被廣泛用于發(fā)現(xiàn)新分子實體藥物腔剂。多個源于FBDD的分子已進入臨床階段，BRAF激酶抑制劑vemurafenib和Bcl-2抑制劑venetoclax也已經(jīng)被批準(zhǔn)上市用于腫瘤的治療往堡。最近JMC上發(fā)表的一篇綜述對2015年基于此策略的工作進行總結(jié)鹃祖，下面對該篇綜述進行簡要介紹宙搬。
文獻作者的篩選原則如下：
- 真正確認(rèn)文章工作所用的策略為FBDD葫掉。
- 片斷苗頭的分子量小于300，這與“片斷三規(guī)則（rule of three）”一致刨摩。
- 片斷苗頭必須源自可識別的篩選過程（比如寺晌，通過生物測試、生物化學(xué)方法澡刹、X-ray折剃、虛擬篩選或這些測試手段的任意組合），或者源自已知配體的分解像屋。
- 先導(dǎo)化合物的“效價強度/親和力（potency/affinity）”大于等于2 uM。而且相對于片斷边篮，potency/affinity應(yīng)提高100倍以上己莺。
- 文章發(fā)表時間在2015年內(nèi)。
通過對2015年發(fā)表的27篇FBDD文章進行統(tǒng)計戈轿，得到以下結(jié)論：
- 如圖A凌受，學(xué)術(shù)機構(gòu)、企業(yè)以及合作機構(gòu)中思杯，文章單位以企業(yè)為主胜蛉，占到了67%；
- 如圖B色乾，針對的靶點依次為激酶（33%）誊册、其它酶（30%）、蛋白-蛋白相互作用（PPI暖璧，18%）案怯、蛋白酶（15%）和GPCR（4%）；
- 如圖C澎办，有85%的文章使用了單晶結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)嘲碱；
- 如圖D，主要的活性篩選技術(shù)依次為Biochemical assay(28%)局蚀、Ligand observed NMR(17%)麦锯、Tm(17%)、Protein observed NMR(11%)等等琅绅。
文章分布情況
綜述作者還對27篇文章中化合物分子量扶欣、cLogP、化合物效能（efficiency）、pPotency-MW關(guān)系進行了統(tǒng)計分析宵蛀，如下圖所示昆著。
化合物性質(zhì)統(tǒng)計分析
持續(xù)關(guān)注這些統(tǒng)計數(shù)據(jù)的變化過程，對于了解FBDD技術(shù)的發(fā)展過程和方向具有重要的意義术陶。最后凑懂，附上15年FBDD工作的化合物結(jié)構(gòu)列表，感興趣的朋友可以去閱讀原文梧宫，深入了解接谨。
Fragment to Lead Publication from 2015-1
Fragment to Lead Publication from 2015-2
Fragment to Lead Publication from 2015-3
Fragment to Lead Publication from 2015-4
Fragment to Lead Publication from 2015-5
參考文獻：DOI: 10.1021/acs.jmedchem.6b01123
作者：鋤草人
