參考自 https://www.biostars.org/p/64346/
方法： 利用UCSC的bedToGenePred和genePredToGtf進(jìn)行轉(zhuǎn)換 下載可以用conda下載
bedToGenePred combined.bed /dev/stdout| genePredToGtf file /dev/stdin combined.gtf
#gtf第二列可以改個(gè)名字 下面就是改成new
sed -i 's/\/dev\/stdin/new/g' combined.gtf
