LINUX sed命令的使用

• 命令格式

sed [options] 'command' file(s) 
sed [options] -f scriptfile file(s)

• sed常用命令

a\ 在當(dāng)前?下?插??本迟杂。 
i\ 在當(dāng)前?上?插??本。 
c\ 把選定的?改為新的?本。 
d 刪除抹锄，刪除選擇的?。 
D 刪除模板塊的第??。 
s 替換指定字符  
l 列表不能打印字符的清單斟湃。 
n 讀取下?個(gè)輸??，?下?個(gè)命令處理新的??不是?第?個(gè)命令檐薯。 
N 追加下?個(gè)輸??到模板塊后?并在?者間嵌??個(gè)新?凝赛，改變當(dāng)前?號(hào)碼。 
p 打印模板塊的?坛缕。 
P(?寫) 打印模板塊的第??墓猎。 
q 退出Sed。  
w file 寫并追加模板塊到file末尾祷膳。   
W file 寫并追加模板塊的第??到file末尾陶衅。   

• sed替換標(biāo)記

g 表??內(nèi)全?替換屡立。   
p 表?打印?直晨。   
w 表?把?寫??個(gè)?件搀军。   
x 表?互換模板塊中的?本和緩沖區(qū)中的?本。   
y 表?把?個(gè)字符翻譯為另外的字符（但是不?于正則表達(dá)式） 
\1 ?串匹配標(biāo)記 
& 已匹配字符串標(biāo)記

• sed元字符集

^ 匹配?開始勇皇，如：/^sed/匹配所有以sed開頭的?罩句。 
$ 匹配?結(jié)束，如：/sed$/匹配所有以sed結(jié)尾的?敛摘。 
. 匹配?個(gè)?換?符的任意字符门烂，如：/s.d/匹配s后接?個(gè)任意字符，最后是d兄淫。 
* 匹配0個(gè)或多個(gè)字符屯远，如：/*sed/匹配所有模板是0個(gè)或多個(gè)空格后緊跟sed的?。 
[] 匹配?個(gè)指定范圍內(nèi)的字符捕虽，如/[sS]ed/匹配sed和Sed慨丐。   

[^] 匹配?個(gè)不在指定范圍內(nèi)的字符，如：/[^A-RT-Z]ed/匹配不包含A-R和T-Z的?個(gè)字?開頭泄私，緊跟ed的?房揭。 

\(..\) 匹配?串，保存匹配的字符晌端，如s/\(love\)able/\1rs捅暴，loveable被替換成lovers。

& 保存搜索字符?來替換其他字符咧纠，如s/love/**&**/蓬痒，love這成**love**。 
\< 匹配單詞的開始惧盹，如:/\<love/匹配包含以love開頭的單詞的?乳幸。 
\> 匹配單詞的結(jié)束，如/love\>/匹配包含以love結(jié)尾的單詞的?钧椰。 
x\{m\} 重復(fù)字符x粹断，m次，如：/0\{5\}/匹配包含5個(gè)0的?嫡霞。 
x\{m,\} 重復(fù)字符x瓶埋，?少m次，如：/0\{5,\}/匹配?少有5個(gè)0的?诊沪。 
x\{m,n\} 重復(fù)字符x养筒，?少m次，不多于n次端姚，如：/0\{5,10\}/匹配5~10個(gè)0的?晕粪。

• 已匹配字符串標(biāo)記&

正則表達(dá)式 \w\+ 匹配每?個(gè)單詞，使? [&] 替換它渐裸，& 對(duì)應(yīng)于之前所匹配到的單詞：
echo this is a test line | sed 's/\w\+/[&]/g' 
[this] [is] [a] [test] [line]
所有以192.168.0.1開頭的?都會(huì)被替換成它?已加localhost：
sed 's/^192.168.0.1/&localhost/' file 
192.168.0.1localhost

• ?串匹配標(biāo)記\1

匹配給定樣式的其中?部分：
echo this is digit 7 in a number | sed 's/digit \([0-9]\)/\1/' 
this is 7 in a number
命令中 digit 7巫湘，被替換成了 7装悲。樣式匹配到的?串是 7，\(..\) ?于匹配?串尚氛，對(duì)于匹配到的第?個(gè)?串就標(biāo)記為 \1诀诊，依此類
推匹配到的第?個(gè)結(jié)果就是 \2，例如：
echo aaa BBB | sed 's/\([a-z]\+\) \([A-Z]\+\)/\2 \1/' 
BBB aaa

• 選定?的范圍：,（逗號(hào)）

所有在模板test和check所確定的范圍內(nèi)的?都被打釉乃弧：
sed -n '/test/,/check/p' file
打印從第5?開始到第?個(gè)包含以test開始的?之間的所有?：
sed -n '5,/^test/p' file
對(duì)于模板test和west之間的?属瓣，每?的末尾?字符串a(chǎn)aa bbb替換：
sed '/test/,/west/s/$/aaa bbb/' file

• 多點(diǎn)編輯：e命令

-e選項(xiàng)允許在同???執(zhí)?多條命令：
sed -e '1,5d' -e 's/test/check/' file
上?sed表達(dá)式的第?條命令刪除1?5?，第?條命令?check替換test讯柔。命令的執(zhí)?順序?qū)Y(jié)果有影響抡蛙。如果兩個(gè)命令都是替換
命令，那么第?個(gè)替換命令將影響第?個(gè)替換命令的結(jié)果魂迄。
和 -e 等價(jià)的命令是 --expression：
sed --expression='s/test/check/' --expression='/love/d' file

• 示例

>gi|1002620271|ref|NC_029525.1| Coturnix japonica isolate 7356 chromosome 10, Coturnix japonica 2.0, whole genome shotgun sequence
TACTCCCCAAGAA
通過sed命令溜畅，將其更改為
>NC_029525.1
TACTCCCCAAGAA
命令如下：
sed 's/^[^ ]*[|]\([^|]*\)[|].*$/>\1/' original.fasta > updated.fasta
命令拆解：
該命令通過貪婪匹配匹配倒數(shù)第二個(gè)|，為了保險(xiǎn)采用[|],[|]限定匹配內(nèi)容极祸，最后\1調(diào)用匹配行的子串
貪婪匹配符："." "+" "*"
非貪婪匹配："?"

http://man.linuxde.net/sed