前述，我們推了一份教程，《QTLseq數據分析国章，鼠標點點，復現 Nature Plant 番茄論文結果》豆村，其中詳細較少了如何使用 TBtools 的系列插件液兽，在本地筆記本電腦上完成 BSAseq 或 QTLseq 數據分析。從原始測序數據fastq文件開始掌动，到最后的 QTL 位點四啰。
在該教程中，我們基本重現了數據來源論文的分析結果粗恢，但也同時發(fā)現定位出來的位點與實際位點有偏移拟逮，大體原因如下：
其一，使用的參考基因組序列版本不對适滓，查看后敦迄，得到確認，所以偏移量直接從 5Mb 縮小到 2Mb
其二，盡管縮小罚屋，但仍然存在坐標偏移苦囱，于是審視了流程，發(fā)現如下
當然脾猛，這個事情就這樣了撕彤。不過我還是不死心，因為你不去確認一下到底是不是使用的數據問題猛拴，就會留下這個疑問羹铅。于是我直接上了所有數據，花多了兩天的計算時間愉昆。結果如下
前述只使用一部分數據的結果（混池17:21）职员，位置明顯偏移到60Mb+
此處我們使用全部數據的結果（混池35:35），那么到文稿驗證的基因位置多了一個關鍵峰值跛溉，大概在 59Mb+ 的位置焊切。
Emmm，完美芳室。所以BSAseq混池的樣品专肪，還是要足夠多才好。
