R語言與醫(yī)學(xué)統(tǒng)計圖形-【23】ggplot2坐標(biāo)系轉(zhuǎn)換函數(shù)

ggplot2繪圖系統(tǒng)——坐標(biāo)系轉(zhuǎn)換函數(shù)

包括餅圖、環(huán)狀條圖蜻势、玫瑰圖、戒指圖鹉胖、坐標(biāo)翻轉(zhuǎn)握玛。

  • 笛卡爾坐標(biāo)系(最常見)。
  • ArcGIS地理坐標(biāo)系(地圖)甫菠。
  • Cartesian坐標(biāo)系挠铲。
  • polar極坐標(biāo)系。

利用ploar坐標(biāo)系繪圖

coord_polar函數(shù)及參數(shù):

coord_polar(theta = 'x', #x/y
            start = 0, #0-12淑蔚,起始點市殷,對應(yīng)時鐘刻度
            direction = 1) #1/-1,順時針/逆時針

1. 餅圖

#餅圖
a <- ggplot(data = subset(diamonds,color=="E"),aes(factor('E'),
                                                   fill=cut))+geom_bar()
b <- ggplot(data = subset(diamonds,color=="E"),aes(factor('E'),
                                                   fill=cut))+geom_bar()+
  coord_polar()
c <- ggplot(data = subset(diamonds,color=="E"),aes(factor('E'),
                                                   fill=cut))+geom_bar()+
  coord_polar(theta = 'y')
grid.arrange(a,b,c,ncol=3)
image.png

去掉餅圖中心的空白刹衫,只需將條形圖的標(biāo)準(zhǔn)寬度設(shè)為1醋寝。還需去掉極坐標(biāo)刻度、標(biāo)簽等多余的顏色带迟。

a=ggplot(data = subset(diamonds,color=="E"),aes(factor('E'),fill=cut))+
  geom_bar(width = 1)+ #設(shè)標(biāo)準(zhǔn)寬度
  coord_polar(theta = 'y')

b=a+theme(axis.text = element_blank(), #去刻度標(biāo)簽
          axis.title = element_blank(), #去標(biāo)題
          axis.ticks = element_blank(), #去刻度
          panel.background = element_blank(), #去背景
          panel.grid = element_blank()) #去網(wǎng)格線

grid.arrange(a,b,ncol=2)
image.png

2. 環(huán)形條圖

示例比較下音羞。

a <- ggplot(diamonds,aes(cut))+
  geom_bar(width = 1,fill='deeppink1',color='black')
b <- a+coord_polar(theta = 'y')
grid.arrange(a,b,ncol=2)
image.png

細(xì)節(jié)的修飾。

data=data.frame(group=c("A","B","C","D"),
                value=c(33,62,56,67))
ggplot(data,aes(x=group,y=value,fill=group))+
  geom_bar(width = 0.85,stat = 'identity')+
  coord_polar(theta = 'y')+
  labs(x='',y='')+
  ylim(c(0,75))+
  #添加條柱標(biāo)簽
  geom_text(hjust=1,size=3,aes(x=group,y=0,
                               label=group,color=group))+
  theme(legend.position = 'none',
        axis.text.y=element_blank(),
        axis.ticks = element_blank())
image.png

3. 南丁格爾玫瑰圖和戒指圖

玫瑰圖

dsmall <- diamonds[sample(nrow(diamonds),1000),]
ggplot(dsmall,aes(color,fill=cut))+
  geom_bar(width = 0.9)+ #使玫瑰圖之間留下空隙
  scale_fill_brewer(palette = 'Oranges')+
  coord_polar(start = 1)+#為更好找到注釋的橫坐標(biāo)
  theme(axis.title = element_blank(),
        panel.background = element_blank(),
        axis.text = element_blank(),
        axis.ticks = element_blank())+
  annotate('text',label=levels(dsmall$color),
           x=1:7,y=plyr::count(dsmall,vars = 'color')[,2]+2, #后續(xù)會講更方便的位置參數(shù)
           fontface='bold')
image.png

戒指圖

#戒指圖
dat=data.frame(count=c(10,60,30),category=c('A',"B","C"))
dat$fraction=dat$count/sum(dat$count)
dat=dat[order(dat$fraction),]
dat$ymax=cumsum(dat$fraction)
dat$ymin=c(0,head(dat$ymax,n=-1))

ggplot(dat,aes(fill=category,ymax=ymax,ymin=ymin,
               xmax=5,xmin=3))+ #戒指粗細(xì)
  geom_rect()+
  coord_polar(theta = 'y')+
  xlim(c(0,5))+ #此范圍要包含(xmin,xmax)
  theme(panel.grid = element_blank(),
        axis.text = element_blank(),
        axis.ticks = element_blank(),
        axis.title = element_blank())+
  annotate("text",x=0,y=0,label='Ring plot',
           color='forestgreen',fontface='bold')+
  annotate("text",x=c(4,4,4),y=c(0.05,0.25,0.7),
           label=c('A','C','B'))+ #戒指環(huán)每部分添加文字
  labs(title = '')+
  theme(legend.position = 'none')
image.png

坐標(biāo)軸翻轉(zhuǎn)

coord_flip函數(shù)仓犬,x和y軸互換嗅绰。

a <- ggplot(dsmall,aes(color,price))+
  geom_boxplot(fill='darkgreen')+
  coord_flip()

b <- ggplot(dsmall,aes(carat))+
  geom_histogram(fill='hotpink',color='black')+
  coord_flip()+
  scale_x_reverse() #將x刻度翻轉(zhuǎn),僅適用連續(xù)型變量

grid.arrange(a,b,ncol=2)
image.png

若不翻轉(zhuǎn)x軸搀继,如下所示:


image.png
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