終于加入生信星球的學(xué)習(xí)班啦，以前多次想過踏入生信的領(lǐng)域卻缺乏合適的時間與合適的契機(jī)谅年，感謝生信星球這個誠意滿滿的學(xué)習(xí)班
任務(wù)一. 如何學(xué)習(xí)生信?
一. 掌握搜索技巧
學(xué)會搜索是學(xué)習(xí)任何新知識的第一步
1. 搜索引擎推薦
2. 專業(yè)教程搜索
- 搜狗微信搜索-一鍵搜索所有公眾號文章带膜，不用一個一個公眾號里扒了
- 搜狗知乎-一鍵搜索知乎平臺上所有相關(guān)文章，知乎與公眾號是教程大戶
- 簡書-知識分享的好平臺术徊，教程巨多
- github-極客必上的平臺，終極神器
二. 學(xué)會溝通交流
與人交談一次,往往比多年閉門勞作更能啟發(fā)心智鲸湃。思想必定是在與人交往中產(chǎn)生,而在孤獨中進(jìn)行加工和表達(dá)赠涮。——列夫·托爾斯泰
1. 什么時候需要溝通交流
- 不是所有問題都要與他人溝通暗挑，自學(xué)能力是作為學(xué)習(xí)者的必備素養(yǎng)
- 但學(xué)習(xí)不是閉門造車笋除，如果反復(fù)自我嘗試仍無法解決問題，則要果斷溝通
2. 和誰進(jìn)行溝通交流
- 與水平比你低很多的人交流炸裆，恐怕很難會有收獲
- 與水平比你高許多的人交流垃它，但對方不一定會有耐心解答所有問題
- 因此，尋找與自己水平相當(dāng)?shù)娜藴贤ń涣魇亲詈线m的
3. 生信學(xué)習(xí)中如何進(jìn)行溝通交流
- 問題要結(jié)合上下文，盡量完整嗤瞎，最好圖文并茂
- 提出生信技術(shù)性問題，而非任何問題
任務(wù)二. 如何搭建學(xué)習(xí)平臺听系？
一. 相關(guān)軟件
- 瀏覽器：推薦谷歌Chrome瀏覽器（自用Firefox瀏覽器感覺也不錯）
- 電腦文件搜索：Windows系統(tǒng)自帶的搜索程序
- 快捷截圖軟件：snipaste（個人自用軟件FastStone Capture也非常好用）
- 電腦版微信：一方面?zhèn)魑募雌妫环矫鏈p少玩手機(jī)
二. 思維導(dǎo)圖
- 幕布
- xmind
三. 電子筆記-簡書markdown語言
「簡書」作為一款「寫作軟件」在誕生之初就支持了Markdown，Markdown 是一種「電子郵件」風(fēng)格的「標(biāo)記語言」
- 先設(shè)置markdown編輯器
-
新建一個文章-注意一定要在編輯界面中再點擊新建靠胜，否則無預(yù)覽選項
Inked2022-11-08_165023.jpg
Inked2022-11-08_165603.jpg - markdown語法是有自己一套編輯規(guī)則掉瞳，在簡書平臺上搜索即可找到入門教程如下：獻(xiàn)給寫作者的 Markdown 新手指南
小結(jié)
- 已掌握：生信學(xué)習(xí)的基本方法與平臺搭建
- 需加強(qiáng)：簡書中Markdown語言的熟練，比如代碼的引用
小練習(xí)-插入R語言代碼
S.OS<-Surv(time = N0_20201001_$OS,event = N0_20201001_$death)
cox.N0xian.EMLNs<-coxph(S.R0xian~N0_xianai$性別+N0_xianai$年齡分組+N0_xianai$大體分型+N0_xianai$腫瘤部位NEW+N0_xianai$吸煙+N0_xianai$手術(shù)方式ABCD+N0_xianai$pT病理類型ABC+N0_xianai$pT腫物大小cm賦值,N0_xianai$N2清掃個數(shù),data=N0_xianai)
Martin.N0xian.ETLNs<-residuals(cox.N0xian.ETLNs,type = "martingale",data=N0_xianai)
Figure.N0xian.EMLNs.martin<-ggplot(data = N0_xianai,aes(x=N0_xianai$全部清掃個數(shù),y=Martin.N0xian.ETLNs,colour=N0_xianai$是否死亡2))+geom_point(size=2.5,shape=1,alpha=.7)+xlab("ETLNs count")+ylab("Martingale Residuals")+theme_classic()+geom_smooth(se=FALSE,colour="black")+scale_color_discrete(guide=FALSE)+scale_x_continuous(breaks = seq(0,60,2),limits = c(0,60))+geom_hline(aes(yintercept=0),linetype="dashed")
ggsave(filename = "HR plot for ETLN.tiff",dpi = 600)
