R語言ggplot2做簇狀柱形圖并添加誤差線的一個(gè)完整示例

本文是回到B站關(guān)注者的提問龄恋,他的問題如下

原始數(shù)據(jù)存儲在一個(gè)excel文件里聋亡,這個(gè)excel文件里有三個(gè)子表格汰蓉,每一個(gè)子表格的數(shù)據(jù)如下:

image.png

總的數(shù)據(jù)格式

image.png

現(xiàn)在的需要是做如下的圖

image.png

接下來就介紹如何利用原始數(shù)據(jù)到最終的圖的ggplot2的代碼

首先是將3個(gè)子表格的數(shù)據(jù)整理到一張表格里

比如這里我新建了一個(gè)子表格sheet4,數(shù)據(jù)最終的格式如下

image.png

接下來R語言里操作

首先是讀取數(shù)據(jù)

library(readxl)
df<-read_excel("prac.xlsx",
               sheet = "sheet4")
df

將寬格式轉(zhuǎn)換為長格式

library(tidyverse)
df %>% 
  pivot_longer(!var4) -> new_df
new_df

定義誤差線函數(shù)

這里用到的是標(biāo)準(zhǔn)誤

ebtop<-function(x){
  return(mean(x)+sd(x)/sqrt(length(x)))
}
ebbottom<-function(x){
  return(mean(x)-sd(x)/sqrt(length(x)))
}

ggplot2作圖

library(ggplot2)

ggplot(data=new_df,aes(x=name,y=value,fill=var4))+
  stat_summary(geom = "bar",fun = "mean",
               position = position_dodge(0.9))+
  stat_summary(geom = "errorbar",
               fun.min = ebbottom,
               fun.max = ebtop,
               position = position_dodge(0.9),
               width=0.2)+
  scale_y_continuous(expand = expansion(mult = c(0,0.1)))+
  theme_bw()+
  theme(panel.grid = element_blank())+
  scale_fill_manual(values = c("#e20612","#ffd401","#00b0eb"),
                    name="")+
  labs(x="XXXXX",y="YYYYY")
image.png

調(diào)整不同分組之間的順序

new_df$name<-factor(new_df$name,
                    levels = c("var2","var3","var1"))

ggplot(data=new_df,aes(x=name,y=value,fill=var4))+
  stat_summary(geom = "bar",fun = "mean",
               position = position_dodge(0.9))+
  stat_summary(geom = "errorbar",
               fun.min = ebbottom,
               fun.max = ebtop,
               position = position_dodge(0.9),
               width=0.2)+
  scale_y_continuous(expand = expansion(mult = c(0,0.1)))+
  theme_bw()+
  theme(panel.grid = element_blank())+
  scale_fill_manual(values = c("#e20612","#ffd401","#00b0eb"),
                    name="")+
  labs(x="XXXXX",y="YYYYY")
image.png

調(diào)整組內(nèi)柱子之間的順序

new_df$var4<-factor(new_df$var4,
                    levels = c("group2",
                               "group3",
                               "group1"))
ggplot(data=new_df,aes(x=name,y=value,fill=var4))+
  stat_summary(geom = "bar",fun = "mean",
               position = position_dodge(0.9))+
  stat_summary(geom = "errorbar",
               fun.min = ebbottom,
               fun.max = ebtop,
               position = position_dodge(0.9),
               width=0.2)+
  scale_y_continuous(expand = expansion(mult = c(0,0.1)))+
  theme_bw()+
  theme(panel.grid = element_blank())+
  scale_fill_manual(values = c("#e20612","#ffd401","#00b0eb"),
                    name="")+
  labs(x="XXXXX",y="YYYYY")
image.png

這里新學(xué)到一個(gè)知識點(diǎn)是珊佣,柱子默認(rèn)是不貼底的康铭,如果要貼底使用函數(shù)scale_y_continuous(expand = expansion(mult = c(0,0.1)))

mult對應(yīng)的兩個(gè)值一個(gè)是控制下面惯退,一個(gè)是控制上面,貼底就設(shè)置為0 就可以了

公眾號推文由獲取數(shù)據(jù)和代碼的方式

歡迎大家關(guān)注我的公眾號

小明的數(shù)據(jù)分析筆記本

小明的數(shù)據(jù)分析筆記本 公眾號 主要分享:1从藤、R語言和python做數(shù)據(jù)分析和數(shù)據(jù)可視化的簡單小例子催跪;2、園藝植物相關(guān)轉(zhuǎn)錄組學(xué)夷野、基因組學(xué)懊蒸、群體遺傳學(xué)文獻(xiàn)閱讀筆記;3悯搔、生物信息學(xué)入門學(xué)習(xí)資料及自己的學(xué)習(xí)筆記骑丸!

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市,隨后出現(xiàn)的幾起案子通危,更是在濱河造成了極大的恐慌铸豁,老刑警劉巖,帶你破解...
    沈念sama閱讀 206,126評論 6 481
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件黄鳍,死亡現(xiàn)場離奇詭異推姻,居然都是意外死亡,警方通過查閱死者的電腦和手機(jī)框沟,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 88,254評論 2 382
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門藏古,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來,“玉大人忍燥,你說我怎么就攤上這事拧晕。” “怎么了梅垄?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 152,445評論 0 341
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵厂捞,是天一觀的道長。 經(jīng)常有香客問我队丝,道長靡馁,這世上最難降的妖魔是什么? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 55,185評論 1 278
  • 正文 為了忘掉前任机久,我火速辦了婚禮臭墨,結(jié)果婚禮上,老公的妹妹穿的比我還像新娘膘盖。我一直安慰自己胧弛,他們只是感情好,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 64,178評論 5 371
  • 文/花漫 我一把揭開白布侠畔。 她就那樣靜靜地躺著结缚,像睡著了一般。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪软棺。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上红竭,一...
    開封第一講書人閱讀 48,970評論 1 284
  • 那天,我揣著相機(jī)與錄音喘落,去河邊找鬼德崭。 笑死,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛揖盘,可吹牛的內(nèi)容都是我干的眉厨。 我是一名探鬼主播,決...
    沈念sama閱讀 38,276評論 3 399
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼兽狭,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼憾股!你這毒婦竟也來了鹿蜀?” 一聲冷哼從身側(cè)響起,我...
    開封第一講書人閱讀 36,927評論 0 259
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤服球,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎茴恰,沒想到半個(gè)月后,有當(dāng)?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體斩熊,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 43,400評論 1 300
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡往枣,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 35,883評論 2 323
  • 正文 我和宋清朗相戀三年,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了粉渠。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片分冈。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 37,997評論 1 333
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡,死狀恐怖霸株,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出雕沉,到底是詐尸還是另有隱情,我是刑警寧澤去件,帶...
    沈念sama閱讀 33,646評論 4 322
  • 正文 年R本政府宣布坡椒,位于F島的核電站,受9級特大地震影響尤溜,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏倔叼。R本人自食惡果不足惜,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 39,213評論 3 307
  • 文/蒙蒙 一宫莱、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望丈攒。 院中可真熱鬧,春花似錦梢睛、人聲如沸肥印。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 30,204評論 0 19
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽。三九已至腹鹉,卻和暖如春藏畅,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間,已是汗流浹背功咒。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 31,423評論 1 260
  • 我被黑心中介騙來泰國打工愉阎, 沒想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道東北人力奋。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 45,423評論 2 352
  • 正文 我出身青樓榜旦,卻偏偏與公主長得像,于是被迫代替她去往敵國和親景殷。 傳聞我的和親對象是個(gè)殘疾皇子溅呢,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 42,722評論 2 345

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容