初步使用Rstudio繪制Heatmap


初步用R做聚類分析熱圖(heatmap)

原始數(shù)據(jù)如下圖:


導(dǎo)出到 txt,會(huì)得到一個(gè)以制表符\t 分割每一行的文本文檔恃逻;


下載安裝好R環(huán)境蕊程,安裝好Rstudio萝招;

打開(kāi)Rstudio,在console處依次輸入命令:

rt<-read.table("F://nano2.txt",header=T,sep="\t")

(對(duì)應(yīng)修改為文件實(shí)際地址)

nano <- c("#00FF00",rep("#0000FF",4),rep("#CC00FFFF",5),rep("#00FFFF",2))

(對(duì)應(yīng)自己有不同種基因存捺,用多少?gòu)堫伾瑀ep為重復(fù)的一個(gè)指令)

heatmap(as.matrix(rt[,2:ncol(rt)]),labRow = rt[,1],cexRow = 0.7,cexCol = 0.9,ColSideColors = nano)

(設(shè)置矩陣?yán)L制熱圖曙蒸,分別設(shè)置注釋標(biāo)簽等的大小數(shù)值調(diào)整即可)

按回車執(zhí)行命令捌治;即可得到熱圖;


按Export即可導(dǎo)出熱圖纽窟。

最后編輯于
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末肖油,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市,隨后出現(xiàn)的幾起案子臂港,更是在濱河造成了極大的恐慌森枪,老刑警劉巖视搏,帶你破解...
    沈念sama閱讀 212,718評(píng)論 6 492
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現(xiàn)場(chǎng)離奇詭異县袱,居然都是意外死亡浑娜,警方通過(guò)查閱死者的電腦和手機(jī),發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 90,683評(píng)論 3 385
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門式散,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來(lái)筋遭,“玉大人,你說(shuō)我怎么就攤上這事暴拄±焯希” “怎么了?”我有些...
    開(kāi)封第一講書人閱讀 158,207評(píng)論 0 348
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵乖篷,是天一觀的道長(zhǎng)响驴。 經(jīng)常有香客問(wèn)我,道長(zhǎng)撕蔼,這世上最難降的妖魔是什么豁鲤? 我笑而不...
    開(kāi)封第一講書人閱讀 56,755評(píng)論 1 284
  • 正文 為了忘掉前任,我火速辦了婚禮罕邀,結(jié)果婚禮上畅形,老公的妹妹穿的比我還像新娘。我一直安慰自己诉探,他們只是感情好日熬,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 65,862評(píng)論 6 386
  • 文/花漫 我一把揭開(kāi)白布。 她就那樣靜靜地躺著肾胯,像睡著了一般竖席。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上敬肚,一...
    開(kāi)封第一講書人閱讀 50,050評(píng)論 1 291
  • 那天毕荐,我揣著相機(jī)與錄音,去河邊找鬼艳馒。 笑死憎亚,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛,可吹牛的內(nèi)容都是我干的弄慰。 我是一名探鬼主播第美,決...
    沈念sama閱讀 39,136評(píng)論 3 410
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開(kāi)眼,長(zhǎng)吁一口氣:“原來(lái)是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼陆爽!你這毒婦竟也來(lái)了什往?” 一聲冷哼從身側(cè)響起,我...
    開(kāi)封第一講書人閱讀 37,882評(píng)論 0 268
  • 序言:老撾萬(wàn)榮一對(duì)情侶失蹤慌闭,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎别威,沒(méi)想到半個(gè)月后躯舔,有當(dāng)?shù)厝嗽跇?shù)林里發(fā)現(xiàn)了一具尸體,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 44,330評(píng)論 1 303
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡省古,尸身上長(zhǎng)有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 36,651評(píng)論 2 327
  • 正文 我和宋清朗相戀三年粥庄,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片衫樊。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 38,789評(píng)論 1 341
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡飒赃,死狀恐怖,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出科侈,到底是詐尸還是另有隱情载佳,我是刑警寧澤,帶...
    沈念sama閱讀 34,477評(píng)論 4 333
  • 正文 年R本政府宣布臀栈,位于F島的核電站蔫慧,受9級(jí)特大地震影響,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏权薯。R本人自食惡果不足惜姑躲,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 40,135評(píng)論 3 317
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望盟蚣。 院中可真熱鬧黍析,春花似錦、人聲如沸屎开。這莊子的主人今日做“春日...
    開(kāi)封第一講書人閱讀 30,864評(píng)論 0 21
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽(yáng)奄抽。三九已至蔼两,卻和暖如春,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間逞度,已是汗流浹背额划。 一陣腳步聲響...
    開(kāi)封第一講書人閱讀 32,099評(píng)論 1 267
  • 我被黑心中介騙來(lái)泰國(guó)打工, 沒(méi)想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留档泽,地道東北人俊戳。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 46,598評(píng)論 2 362
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長(zhǎng)得像馆匿,于是被迫代替她去往敵國(guó)和親抑胎。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 43,697評(píng)論 2 351

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容

  • 對(duì)于乙肝這個(gè)詞甜熔,我感到很陌生,只記得在小學(xué)時(shí)突倍,村里組織所有的小孩兒打乙肝疫苗腔稀,我也隨波逐流的跟著打疫苗盆昙,除此之外,...
    艾尚萱閱讀 215評(píng)論 0 0
  • 文|余語(yǔ)于隅 這一篇文字焊虏,是草湯讓寫的淡喜。 至于寫什么,怎么寫诵闭,沒(méi)想好炼团,那也不要緊,就按照著想到什么寫什么疏尿、想到哪里...
    余語(yǔ)于隅閱讀 406評(píng)論 6 6
  • 不管是在專柜瘟芝、免稅店、tb旗艦店都有買過(guò)褥琐,我也算是K星人家的老粉了锌俱,身邊的朋友要是想嘗試他們家的都會(huì)來(lái)問(wèn)一下我的使...
    檬昔駱駱閱讀 1,100評(píng)論 2 6
  • 細(xì)細(xì)的雨,緩緩的風(fēng)敌呈。剪完頭發(fā)的我贸宏,被這場(chǎng)雨堵在了門前,坐在門前看著雨磕洪,聽(tīng)著風(fēng)吭练,甚是愉悅。 想了想析显,便把手機(jī)拿了...
    木子妍心閱讀 151評(píng)論 0 0