scRNA---Day8(scater)

續(xù)昨

可視化：

按示例數(shù)據(jù)選取前6個(gè)基因圃伶，一般實(shí)驗(yàn)中選取marker基因：

6geneplot.png

6plot.png

降維

1. runPCA()

2. t-distributed stochastic neighbour embedding (t-SNE)

   
   
   multiplot.png

PCAplot.png

plateplot.png

Trf-gplot.png

Trfplot.png

Trf-sizeplot.png

tsneplot.png

tsne-Trfplot.png

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數(shù)據(jù)圖不好看，主要是為了理解流程走代碼

• 人面猴

  序言：七十年代末侨核，一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市，隨后出現(xiàn)的幾起案子，更是在濱河造成了極大的恐慌，老刑警劉巖吹截，帶你破解...

  沈念sama閱讀 219,188評(píng)論 6贊 508
• 死咒

  序言：濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件瘦陈，死亡現(xiàn)場(chǎng)離奇詭異凝危，居然都是意外死亡，警方通過查閱死者的電腦和手機(jī)晨逝，發(fā)現(xiàn)死者居然都...

  沈念sama閱讀 93,464評(píng)論 3贊 395
• 救了他兩次的神仙讓他今天三更去死

  文/潘曉璐 我一進(jìn)店門蛾默，熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來，“玉大人捉貌，你說我怎么就攤上這事支鸡。” “怎么了趁窃？”我有些...

  開封第一講書人閱讀 165,562評(píng)論 0贊 356
• 道士緝兇錄：失蹤的賣姜人

  文/不壞的土叔 我叫張陵牧挣，是天一觀的道長(zhǎng)。 經(jīng)常有香客問我醒陆，道長(zhǎng)瀑构，這世上最難降的妖魔是什么刨摩？ 我笑而不...

  開封第一講書人閱讀 58,893評(píng)論 1贊 295
• ?港島之戀（遺憾婚禮）

  正文 為了忘掉前任寺晌，我火速辦了婚禮世吨，結(jié)果婚禮上，老公的妹妹穿的比我還像新娘呻征。我一直安慰自己耘婚，他們只是感情好，可當(dāng)我...

  茶點(diǎn)故事閱讀 67,917評(píng)論 6贊 392
• 惡毒庶女頂嫁案：這布局不是一般人想出來的

  文/花漫 我一把揭開白布陆赋。 她就那樣靜靜地躺著沐祷，像睡著了一般。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪奏甫。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上戈轿，一...

  開封第一講書人閱讀 51,708評(píng)論 1贊 305
• 城市分裂傳說

  那天，我揣著相機(jī)與錄音阵子，去河邊找鬼思杯。 笑死，一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛挠进，可吹牛的內(nèi)容都是我干的色乾。 我是一名探鬼主播，決...

  沈念sama閱讀 40,430評(píng)論 3贊 420
• 雙鴛鴦連環(huán)套：你想象不到人心有多黑

  文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼领突，長(zhǎng)吁一口氣：“原來是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼暖璧！你這毒婦竟也來了？” 一聲冷哼從身側(cè)響起君旦，我...

  開封第一講書人閱讀 39,342評(píng)論 0贊 276
• 萬榮殺人案實(shí)錄

  序言：老撾萬榮一對(duì)情侶失蹤澎办，失蹤者是張志新（化名）和其女友劉穎，沒想到半個(gè)月后金砍，有當(dāng)?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體局蚀，經(jīng)...

  沈念sama閱讀 45,801評(píng)論 1贊 317
• ?護(hù)林員之死

  正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡，尸身上長(zhǎng)有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...

  茶點(diǎn)故事閱讀 37,976評(píng)論 3贊 337
• ?白月光啟示錄

  正文 我和宋清朗相戀三年恕稠，在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了琅绅。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片。...

  茶點(diǎn)故事閱讀 40,115評(píng)論 1贊 351
• 活死人

  序言：一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡鹅巍，死狀恐怖千扶，靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出，到底是詐尸還是另有隱情骆捧，我是刑警寧澤澎羞，帶...

  沈念sama閱讀 35,804評(píng)論 5贊 346
• ?日本核電站爆炸內(nèi)幕

  正文 年R本政府宣布，位于F島的核電站敛苇，受9級(jí)特大地震影響妆绞，放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏。R本人自食惡果不足惜，卻給世界環(huán)境...

  茶點(diǎn)故事閱讀 41,458評(píng)論 3贊 331
• 男人毒藥：我在死后第九天來索命

  文/蒙蒙 一摆碉、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望塘匣。 院中可真熱鬧，春花似錦巷帝、人聲如沸忌卤。這莊子的主人今日做“春日...

  開封第一講書人閱讀 32,008評(píng)論 0贊 22
• 一樁弒父案楞泼，背后竟有這般陰謀

  文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽(yáng)驰徊。三九已至，卻和暖如春堕阔，著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間棍厂，已是汗流浹背。 一陣腳步聲響...

  開封第一講書人閱讀 33,135評(píng)論 1贊 272
• 情欲美人皮

  我被黑心中介騙來泰國(guó)打工超陆， 沒想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留牺弹，地道東北人。 一個(gè)月前我還...

  沈念sama閱讀 48,365評(píng)論 3贊 373
• 代替公主和親

  正文 我出身青樓时呀，卻偏偏與公主長(zhǎng)得像，于是被迫代替她去往敵國(guó)和親谨娜。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子，可洞房花燭夜當(dāng)晚...

  茶點(diǎn)故事閱讀 45,055評(píng)論 2贊 355