本文主要參照QIIME2中文手冊掷豺，并加入自己的一些理解https://forum.qiime2.org/t/qiime2-chinese-manual/838
1. 說下QIIME2是做什么的
QIIME2是用來做 ?16S擴(kuò)增子分析的。這款軟件發(fā)布于2017年7月，發(fā)布才一個(gè)月，算是比較新的技術(shù)蒜哀。主要應(yīng)用在以下幾個(gè)方面：通過宏基因組測序的方法碟婆，將腸道微生物與疾病進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析以揭示疾病與健康個(gè)體間的微生物差異；鑒定特定環(huán)境中的特定微生物發(fā)現(xiàn)耐受菌種及相關(guān)基因纯衍。可以研究物種的分類苗胀，研究與特定環(huán)境相關(guān)的代謝通路襟诸，以及通過不同樣品的比較研究微生物群落內(nèi)部、微生物與環(huán)境基协、微生物與宿主之間的關(guān)系歌亲。
安裝過程略過，詳細(xì)過程可以見http://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/75103929
（未完待續(xù)）
