送給lxh小姐姐
每日任務(wù)
一、linux的App Store
1.認(rèn)識(shí)miniconda
2.下載miniconda
二宇弛、miniconda的安裝、配置
1.怎么安裝miniconda
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
2.激活
source ~/.bashrc
3.鏡像
# 使用清華鏡像# conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda conda config --set show_channel_urls yes
三源请、miniconda的使用
1.查看當(dāng)前所有軟件列表
conda list
2.搜索軟件
conda search fastqc
3.安裝軟件
conda install fastqc -y
4.卸載軟件
conda remove fastqc -y
#注：-y表示自動(dòng)安裝
四枪芒、conda環(huán)境
1.查看當(dāng)前有哪些環(huán)境
conda info --envs
#注前面帶*是默認(rèn)
2.創(chuàng)建rnaseq安裝fastqc、trimmomatic生信軟件
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
3.檢查軟件環(huán)境是否搭建好
conda info --envs
4.激活rna-seq環(huán)境
conda activate rna-seq
五谁尸、卸載安裝上的conda重新再來一遍
rm -r biosoft
- 重新再來一遍孰能生巧
- 報(bào)錯(cuò)了主動(dòng)查找原因
- 不灰心舅踪，不放棄
