今天學(xué)習(xí)了Linux環(huán)境下通過(guò)使用miniconda(相當(dāng)于mac里的app store)下載生信相關(guān)軟件
D3.png
整個(gè)安裝過(guò)程比較順暢掌腰,沒有出什么問題
一、安裝
1催植、下載腳本
下載miniconda.png
2查邢、安裝miniconda
安裝miniconda.png
安裝成功~扰藕!
安裝成功.png
3邓深、激活miniconda
激活miniconda.png
上述便是miniconda的一個(gè)安裝簡(jiǎn)略過(guò)程芥备,激活步驟一定不能省略!萌壳!
二袱瓮、使用
1爱咬、查看列表
查看當(dāng)前所有軟件列表.png
2、搜素軟件fastqc
搜索軟件fastqc.png
3燎斩、安裝軟件
自動(dòng)安裝最新版fastqc.png
在這里栅表,命令的最后有一個(gè) -y 表示自動(dòng)安裝最新版軟件
4、卸載軟件fastqc
卸載fastqc.png
5谨读、搭建新環(huán)境(rna-seq)
不同的生信分析需求的軟件版本等不同劳殖,所以需要我們搭建不同的環(huán)境
建立conda環(huán)境.png
搭建完了之后哆姻,如果使用該環(huán)境,需要進(jìn)行激活
輸入
conda activate rna-seq
即可更改默認(rèn)環(huán)境.png
6矛缨、卸載新環(huán)境
刪除rna-seq環(huán)境.png