題目：通過WGNCA發(fā)現(xiàn)缺血性卒中相關(guān)LncRNA及其靶基因和相關(guān)信號通路
LncRNAs related key pathways and genes in ischemic stroke by weighted gene co-expression network analysis (WGCNA).
DOI：10.1016/j.ygeno.2020.01.001
數(shù)據(jù)來源：臨床外周血樣本：3對照萨蚕，3IS树叽，RNA-seq測序取lncRNA; GSE22255: 20對照输拇，20IS （進(jìn)行驗(yàn)證，但是數(shù)據(jù)中l(wèi)ncRNA很少臭增，失敗了）
分析方法：WGCNA，KEGG富集分析（OmicShare）竹习，PPI網(wǎng)絡(luò)（STRING）
結(jié)果：
1.構(gòu)建聚類樹（R^2設(shè)為0.9誊抛，β值取12）
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Eigengene adjacency熱圖
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模塊與性狀熱圖（挑選greenyellow模塊，因?yàn)榕cstroke中風(fēng)相關(guān)性為0.92整陌，并取模塊中MM和GS前10的lncRNA進(jìn)行下一步研究）
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KEGG富集分析（對10個lncRNA的565個靶基因進(jìn)行富集分析拗窃，在OmicShare中進(jìn)行）
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PPI網(wǎng)絡(luò)（對10個lncRNA的565個靶基因構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)確定hub gene)
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研究流程
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