接著上次課程繼續(xù)總結(jié)基因課上關(guān)于Linux的入門晴及。
1. 課程鏈接：生物信息入門之 Linux
2. 本次內(nèi)容
- 數(shù)據(jù)上傳箫章、下載烙荷；權(quán)限管理、用戶管理檬寂、目錄結(jié)構(gòu)终抽；軟件安裝、文件處理命令桶至。
3. 數(shù)據(jù)上傳和下載
數(shù)據(jù)的上傳和下載
3.1 上傳和下載數(shù)據(jù)
常用的上傳與下載見上圖，接下來會一一介紹用法。
3.2 FileZilla圖形界面FTP工具
FileZilla的兩種形式
- sftp：與自己服務(wù)器間傳輸數(shù)據(jù)
該種傳輸一般是基于SSH協(xié)議哈蝇，只需要使用登錄服務(wù)器的賬戶甫男，輸入ip地址，用戶名和密碼即可與服務(wù)器建立聯(lián)系女蜈，通過拖拽即可進(jìn)行數(shù)據(jù)的上傳于下載持舆。 - ftp：下載別人服務(wù)器上的數(shù)據(jù)
復(fù)制數(shù)據(jù)的ftp地址色瘩，很多公開數(shù)據(jù)不需要用戶名和密碼，可直接進(jìn)行下載逸寓，例如一些常用的基因組數(shù)據(jù)居兆。
3.3 使用FTP命令上傳下載數(shù)據(jù)
FTP上傳與下載數(shù)據(jù)
使用FTP命令可以直接在分析服務(wù)器上進(jìn)行數(shù)據(jù)的上傳和下載。
3.3.1上傳數(shù)據(jù)
- 連接命令：sftp用戶名@服務(wù)器ip地址 -p 端口號（輸入密碼進(jìn)行連接）
- pwd：查看遠(yuǎn)程服務(wù)器所在目錄
- lpwd：查看本地服務(wù)器所在目錄
- ls：查看遠(yuǎn)程服務(wù)器所在目錄文件
- lls：查看本地服務(wù)器所在目錄文件
- lcd Download：進(jìn)入本地服務(wù)器下載目錄
- get + 文件名：利用get命令下載文件
- lls：查看本地服務(wù)器所在目錄文件（已成功下載）
- exit：退出
3.3.2 下載數(shù)據(jù)
- 本地新建一個文件竹伸，vim test1.txt泥栖，準(zhǔn)備上傳至遠(yuǎn)程服務(wù)器
- 連接命令：sftp用戶名@服務(wù)器ip地址 -p 端口號（輸入密碼進(jìn)行連接）
- lls：查看本地服務(wù)器所在目錄文件
- pwd：查看遠(yuǎn)程服務(wù)器所在目錄
- put + 文件名：利用put命令上傳文件
- ls：查看遠(yuǎn)程服務(wù)器所在目錄文件（上傳成功）
3.4 wget從網(wǎng)頁下載數(shù)據(jù)
wget網(wǎng)頁下載數(shù)據(jù)
- 基本命令：wget + 下載地址（支持http和ftp協(xié)議）
- 支持?jǐn)帱c(diǎn)續(xù)傳：wget -c +下載地址；
- 批量下載：將要下載的地址放入一個文檔勋篓，-i選項(xiàng)：wget -i +下載地址文件聊倔。
3.5 scp跨服務(wù)器拷貝
scp跨服務(wù)器拷貝
- 拷貝命令：scp 用戶名@IP：源文件路徑 目標(biāo)文件夾
- 實(shí)例：scp lilei@ip地址：/home/lilei/test.txt ./
4. 用戶和權(quán)限管理
用戶與權(quán)限
4.1 理解用戶和權(quán)限
- 多人共用服務(wù)器的安全與高效：共享軟件和數(shù)據(jù)庫等，同時又有私密空間生巡。
- 用戶管理決定了有多少人共用這臺服務(wù)器耙蔑，他們之間如何分組；
- 權(quán)限管理決定了哪些人可以使用孤荣。
4.2 用戶管理（需要管理員權(quán)限）
用戶管理
- 切換賬號：su 用戶名（root系統(tǒng)管理員具有最高權(quán)限）
- 添加用戶分組：groupadd 組名
- 刪除用戶分組：groupdel 組名
- 添加用戶： useradd -m -g 主要分組 -s /bin/bash 用戶名 [-g（指定用戶所屬的主要分組甸陌，1個）；-G（指定用戶所屬的次要分組盐股，可幾個）钱豁；-m（是否創(chuàng)建用戶目錄）；-s /bin/bash（指定用戶使用的shell）]
- 刪除用戶： userdel 用戶名
- 修改用戶： usermod -g 主要分組 -s /bin/bash -m /home/用戶名 用戶名
- 查看用戶信息：id用戶名
- 設(shè)置修改密碼：passwd 用戶名
4.3 權(quán)限管理（一般默認(rèn)）
權(quán)限管理
- 用戶分類：u（屬主）疯汁；g（同組）牲尺；o（其他人）；
- 權(quán)限分類：r（可讀）幌蚊；w（可寫）谤碳；x（可執(zhí)行）;
- chmod修改權(quán)限：+（增加權(quán)限）；-（去除權(quán)限）溢豆；=（賦予權(quán)限）蜒简。
- 修改文件權(quán)限：chmod o-r 文件名（可修改第一位為u/g/o；第二位為+/-/=;第三位為r/w/x）
- x（可執(zhí)行權(quán)限）主要針對可執(zhí)行文件漩仙，如blastp搓茬。
