pybedtools文檔--篩選

1缕粹、BedTool.filter(func,?*args,?**kwargs)[source]

根據(jù)用戶定義的功能進(jìn)行特征的篩選噪生,使func對(duì)Bedtool目標(biāo)中的每一個(gè)特征進(jìn)行評(píng)估博其,返回那些在func中值是True的特征模蜡。

args 和**kwargs 直接傳遞給 *func.

直接返回一個(gè)BedTool目標(biāo)在內(nèi)存中,如果想要保存結(jié)果忍疾,需要使用.saveas()方法。

>>> a=pybedtools.example_bedtool('a.bed')

>>> subset=a.filter(lambdab:b.chrom=='chr1' and b.start<150)

>>> len(a),len(subset)

(4, 2)

因此就從原有的4個(gè)記錄中導(dǎo)出了2個(gè)符合要求的記錄

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
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