使用conda安裝
##創(chuàng)建cworld環(huán)境螟左,安裝相關(guān)依賴(**注意版本要求**)
conda create -n cworld -y
conda activate cworld
conda install python=2.7.9 numpy=1.11.3 matplotlib=1.5.3 spicy=0.19.0 h5py=2.7.1 pysam=0.15.3 scikit-learn=0.18.1 bedtools=2.30.0 -y
##安裝GD模塊凸克,使用下面命令查看自己是否已安裝GD模塊及其版本信息
perl -MGD -e 'print $GD::VERSION ."\n";'
##若提示未安裝沃但,運(yùn)行下方命令進(jìn)行安裝
##前往--https://github.com/libgd/libgd/releases 下載最新版本libgd的安裝包libgd-2.3.2.tar.gz并提取文件進(jìn)行安裝
cd libgd-2.3.2
./configure
make
sudo make install
##安裝GD模塊
sudo cpan install GD
##若提示未安裝libcpanplus-perl司蔬,則按提示先安裝
sudo apt install libcpanplus-perl
##成功安裝跃赚,再安裝GD模塊
sudo cpan install GD
##此時(shí)再運(yùn)行下方命令查看,成功顯示版本信息
perl -MGD -e 'print $GD::VERSION ."\n";'
2.73
##前往--https://github.com/dekkerlab/cworld-dekker 下載最新版本安裝包
cd cworld-dekker-master
perl Build.PL
##若提示未安裝Build模塊
sudo cpan install MODULE::Build
安裝成功之后再執(zhí)行命令
perl Build.PL
./Build
sudo ./Build install
安裝成功
后續(xù)可以運(yùn)行相應(yīng)腳本