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編者按:
microRNA是一種長度為22~25nt的內(nèi)源性非編碼RNA,其在蛋白編碼基因轉(zhuǎn)錄后水平發(fā)揮重要的負(fù)調(diào)節(jié)作用郊供。是近20年來科學(xué)界研究熱點踪古。根據(jù)其在腫瘤發(fā)生發(fā)展中作用,miRNA大致可分為促癌性miRNA與抑癌性miRNA诀豁。
膽囊,是一個位于右肋下肝臟后方的梨形囊袋狀器官窥妇,頸部連膽囊管舷胜,膽囊管向上連接肝總管,向下連接膽總管(解剖結(jié)構(gòu)見下圖)活翩;膽囊具有儲存和濃縮膽汁的功能烹骨,常見的膽囊相關(guān)疾病包括膽結(jié)石、膽囊炎材泄、膽囊息肉及膽囊癌等沮焕。膽囊癌(GBC)是最常見的膽道惡性腫瘤,也是第七大最常見的胃腸道癌癥拉宗。流行病學(xué)調(diào)查顯示峦树,GBC的發(fā)生率為2.5/10^5人辣辫。盡管發(fā)病率相對較低,但與GBC相關(guān)的死亡率仍高于其他癌癥魁巩。且就診時患者往往處于晚期急灭,失去手術(shù)機(jī)會,晚期膽囊癌的預(yù)后很差歪赢,5年生存率僅為5%化戳。因此,尋找一種新的治療方法對中晚期膽囊癌來說是至關(guān)重要的埋凯,這其中就包括miRNA在膽囊癌中的基礎(chǔ)研究点楼。
今天給大家?guī)淼氖巧虾=煌ù髮W(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院劉穎斌教授團(tuán)隊2017年在nature子刊Cell Death and Differentiation雜志上發(fā)表的MicroRNA-29c-5psuppresses gallbladder carcinoma progression by directly targeting CPEB4 andinhibiting the MAPK pathway 研究論文。
文章從運用miRNA芯片分析膽囊癌組織與癌旁組織(NAT)各miRNA表達(dá)差異開始白对,鑒定出miRNA-29c-5p在膽囊癌組織中表達(dá)明顯下調(diào)掠廓,然后臨床分析了其與膽囊癌患者預(yù)后及臨床病例特征存在關(guān)聯(lián),進(jìn)而在體內(nèi)外實驗中證明miR-29c-5p在膽囊癌細(xì)胞增殖中起重要作用甩恼,且通過減少上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化抑制膽囊癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移與侵襲蟀瞧,最后得出MicroRNA-29c-5p通過直接靶向CPEB4和抑制MAPK途徑來抑制膽囊癌的進(jìn)展的結(jié)論。
Results解讀:
作者首先運用miRNA芯片分析比較GBC組織和NAT的miRNA表達(dá)譜悦污。結(jié)果顯示13種miRNA的水平發(fā)生了顯著變化(“> 2倍”),其中包括11個下調(diào)的miRNA和2個上調(diào)的miRNA(圖1a)钉蒲。與NAT相比切端,GBC組織中miR-29c的表達(dá)最顯著下調(diào),表明miR-29c是腫瘤發(fā)生的關(guān)鍵介質(zhì)顷啼。作者通過qRT-PCR檢測40對GBC組織及其相應(yīng)的NAT的miR-29C-3P和-5p的表達(dá)水平踏枣。和miRNA芯片數(shù)據(jù)一致,與NAT相比钙蒙,腫瘤組織中的miR-29c-5p表達(dá)顯著下調(diào)(P = 0.018茵瀑;圖1b)。然而躬厌,miR-29c-3p的表達(dá)沒有顯著下降(P = 0.774;?圖1c)马昨,因此作者在隨后的研究中重點關(guān)注miR-29c-5p。與非轉(zhuǎn)移性GBC患者相比烤咧,發(fā)生轉(zhuǎn)移的GBC患者具有更低的miR-29c-5p表達(dá)水平(P <0.001偏陪;圖1d),可能暗示了miR-29c-5p參與GBC的轉(zhuǎn)移煮嫌。
因為miR-29c-5p表達(dá)水平與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān),所以作者進(jìn)一步研究了miR-29c-5p表達(dá)對預(yù)測GBC轉(zhuǎn)移的診斷潛力抱虐。發(fā)現(xiàn)miR-29c-5p表達(dá)水平的ROC曲線(AUC)下面積為0.855(95%CI:0.733-0.977昌阿;圖1e)。miR-29c-5p表達(dá)水平的最佳臨界值(2-?ΔCT= 0.032)是基于ROC曲線分析選擇的;?因此,GBC組織中的miR-29c-5p表達(dá)水平被分為低表達(dá)組或高表達(dá)組懦冰。使用這些標(biāo)準(zhǔn)灶轰,分析了miR-29c-5p表達(dá)水平與GBC的臨床病理特征和預(yù)后之間的相關(guān)性。在具有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的GBC組織中刷钢,miR-29c-5p表達(dá)水平顯著降低(P <0.001笋颤;表1(未列))。
更有趣的是内地,生存分析表明伴澄,與miR-29c-5p低表達(dá)的患者相比,miR-29c-5p高表達(dá)的GBC患者的總生存期(OS)和無病生存期(DFS)更好(1-和3年OS:55.7%和33.4%阱缓,而 32.0和16.0%非凌,P = 0.040;1年和3年DFS:85.1和60.8%荆针,而 35.9和12.0%敞嗡,P = 0.002;圖1f和g)
為了檢測miR-29c在GBC發(fā)生中的生物學(xué)功能喉悴,作者測定了miR-29c-3p和-5p在5種GBC細(xì)胞系和正常膽管上皮細(xì)胞系中的表達(dá)水平(圖2a)。與腫瘤組織特征一致玖媚,GBC細(xì)胞表達(dá)的miR-29c-5p水平低于miR-29c-3p箕肃。隨后作者將miR-29c前體(pre-miR-29c)及其特異性抑制劑anti-miR-29c-5p引入了GBC-SD和NOZ細(xì)胞系。通過實時PCR證實了miR-29c-5p的不同表達(dá)水平(圖2b)
進(jìn)一步作者采用CCK8與克隆形成實驗評估m(xù)iR-29c-5p在GBC細(xì)胞增殖中的作用最盅。結(jié)果表明突雪,與pre-miR-NC細(xì)胞相比,pre-miR-29c細(xì)胞的增殖明顯減少涡贱,而與抗NC相比咏删,anti-miR-29c-5p細(xì)胞的增殖明顯增加(圖2c和d),與該miRNA在GBC細(xì)胞增殖中的抑制作用一致问词。
隨后作者發(fā)現(xiàn)過表達(dá)miR-29c-5p后活化的Chk1和Chk2督函,即p-Chk1(S-345)和p-Chk2(T68),表達(dá)增加(圖2e和補(bǔ)充圖S2B)激挪。據(jù)此推測miR-29c-5p通過激活Chk1/2并隨后引起G1期阻滯促進(jìn)自發(fā)性DNA損傷修復(fù)辰狡,從而阻止了腫瘤的進(jìn)展。接著作者做了體內(nèi)實驗垄分,用miR-29c-5pagomir治療2周后宛篇,腫瘤生長明顯被抑制(圖2f)。此外薄湿,免疫組化顯示miR-29c-5pagomir接種的腫瘤組織中E-cadherin表達(dá)增加叫倍,波形蛋白表達(dá)降低偷卧,Ki-67陽性細(xì)胞數(shù)量減少以及缺乏磷酸化的MEK(圖2h)。
傷口愈合試驗表明听诸,GBC細(xì)胞中miR-29c-5p表達(dá)的增加與傷口閉合明顯減慢有關(guān),而GBC細(xì)胞中miR-29c-5p表達(dá)的降低導(dǎo)致傷口閉合明顯增快(P <0.05蚕泽;圖3b)晌梨。Transwell實驗表明,pre-miR-29c細(xì)胞的侵襲性低于pre-miR-NC細(xì)胞须妻,而抗miR-29c-5p細(xì)胞的侵襲性高于抗NC細(xì)胞(P <0.001仔蝌;圖3a和補(bǔ)充圖S1C)。相應(yīng)的璧南,蛋白印跡實驗和免疫熒光(ICC)分析表明掌逛,miR-29c-5p的表達(dá)顯著增加了EMT相關(guān)基因E-鈣粘蛋白和β-連環(huán)蛋白的表達(dá),并降低了波形蛋白的表達(dá)(圖3c和d及補(bǔ)充圖S1E–F)司倚。
為了在體內(nèi)證實這些發(fā)現(xiàn)豆混,作者通過尾靜脈注射進(jìn)行了肺腫瘤轉(zhuǎn)移測定,以監(jiān)測裸鼠中NOZ細(xì)胞的轉(zhuǎn)移能力动知。如圖3e所示皿伺,對照組的肺部轉(zhuǎn)移率和轉(zhuǎn)移結(jié)節(jié)的數(shù)量顯著要高于經(jīng)miR-29c-5p agomir治療的小鼠。這些結(jié)果在體內(nèi)外實驗表明了miR-29C-5P通過減少上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)抑制GBC細(xì)胞的轉(zhuǎn)移和侵襲盒粮。
為了探究miR-29c-5p抑制GBC細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制,作者首先研究了miR-29c-5p對凋亡的影響丹皱。miR-29c-5p細(xì)胞和對照細(xì)胞的凋亡指數(shù)分別為38.76和25%(相對于GBC-SD細(xì)胞妒穴,P <0.001),分別為24.3和4%(對于NOZ細(xì)胞摊崭,P <0.001讼油;對于NOZ細(xì)胞,P <0.001)(圖4a)呢簸。此外矮台,抗miR-29c-5p細(xì)胞的凋亡指數(shù)低于陰性對照細(xì)胞(圖4a)。如圖4b根时,用pre-miR-29c處理的細(xì)胞顯示綠色熒光增加瘦赫,表明線粒體功能喪失。這些結(jié)果表明蛤迎,miR-29c-5p通過線粒體依賴性機(jī)制誘導(dǎo)凋亡确虱。
通過分析與miR-29c-5p相關(guān)的差異表達(dá)基因,作者推測MAPK / ERK信號通路是miR-29c-5p抑制GBC腫瘤發(fā)生和轉(zhuǎn)移的主要途徑(圖4c)替裆。隨后作者對參與MAPK信號通路的蛋白質(zhì)的磷酸化狀態(tài)進(jìn)行了蛋白印跡分析蝉娜。與對照組細(xì)胞相比唱较,miR-29c-5p過表達(dá)的細(xì)胞MEK1/2扎唾,p44/42 MAPK和Akt在Ser473處磷酸化水平降低召川,而總蛋白水平則不受miR-29c-5p表達(dá)的影響。滅活的Akt隨后調(diào)節(jié)Bcl-2家族蛋白胸遇。結(jié)果荧呐,相對于對照細(xì)胞,在miR-29c-5p過表達(dá)的細(xì)胞中纸镊,caspase-9倍阐,caspase-3和PARP的后續(xù)切割均增加。當(dāng)miR-29c-5p在GBC細(xì)胞中被抑制時逗威,MEK1 / 2峰搪,ERK和Akt的磷酸化被逆轉(zhuǎn)(圖4d和補(bǔ)充圖S2A)。此外凯旭,當(dāng)使用MEK1 / 2抑制劑時概耻,miR-29C-5P阻斷MEK1 / 2和ERK的磷酸化的效果幾乎完全消失(圖4e和補(bǔ)充圖S2C)。這些結(jié)果表明罐呼,MAPK / ERK途徑可能參與了miR-29c-5p誘導(dǎo)的GBC細(xì)胞凋亡鞠柄。
(a)由兩個計算預(yù)測程序預(yù)測的潛在miR-29c-5p目標(biāo)厌杜。列出的它們之間的重疊(右)。(b)如材料和方法中所述構(gòu)建熒光素酶報道質(zhì)粒计螺。顯示了CPEB4的3'UTR內(nèi)的預(yù)測的miR-29c-5p結(jié)合位點的序列夯尽,包括野生型和突變體結(jié)合位點。將上述報告質(zhì)恋锹或模擬報告質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染到感染了pre-miR-29c的293 T細(xì)胞中后匙握,分析了相對熒光素酶活性(*** P <0.001)。Pre-miR-29c而非pre-miR-NC特異性地降低了CPEB4 -3'?-UTR-WT熒光素酶報道基因的表達(dá)谊娇。相反肺孤,在用CPEB4--3'?-UTR-Mut報道基因轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中未觀察到相對熒光素酶表達(dá)的變化(c)用抗miR-29c-5p,抗NC济欢,pre-miR-NC或pre-miR-29c感染的GBC-SD和NOZ細(xì)胞中CPEB4蛋白的蛋白質(zhì)印跡分析赠堵。總的來說,這些結(jié)果表明CPEB4是miR-29c-5p的直接靶標(biāo)法褥,并且可以被miR-29c-5p負(fù)調(diào)節(jié)茫叭。
我們的qRT-PCR分析顯示,與NAT相比半等,GBC組織中CPEB4的表達(dá)顯著上調(diào)(圖5d)揍愁,使用Pearson相關(guān)分析呐萨,我們計算了腫瘤樣品中miR-29c-5p與CPEB4 mRNA水平之間的顯著負(fù)相關(guān)(R = -0.571,P <0.001莽囤;圖5e和f)谬擦,使用線性回歸分析和配對t檢驗,對圖5d中使用的相同樣品朽缎,確定了miR-29c-5p和CPEB4表達(dá)水平之間的相關(guān)性惨远。(g)有代表性的IHC顯微照片,顯示在具有高或低miR-29c-5p表達(dá)的GBC組織中CPEB4蛋白的表達(dá)话肖。(i)使用Kaplan-Meier分析比較了高和低miR-29c-5p表達(dá)組與高和低CPEB4表達(dá)組之間40名GBC患者的OS率北秽。
我們使用一種補(bǔ)充方法來檢查CPEB4功能的獲得和喪失贺氓。具體來說,我們用缺少3'UTR的CPEB4表達(dá)載體敲低了GBC-SD細(xì)胞中CPEB4的表達(dá)或恢復(fù)了NOZ細(xì)胞中CPEB4的表達(dá)床蜘。CPEB4表達(dá)的恢復(fù)增強(qiáng)了表達(dá)miR-29c-5p的NOZ細(xì)胞的增殖和集落形成(圖6a和b)辙培。同樣,流式細(xì)胞儀分析表明CPEB4表達(dá)的恢復(fù)恢復(fù)了因miR-29c-5p過表達(dá)引起的細(xì)胞周期停滯(圖6c)悄泥。此外虏冻,CPEB4的恢復(fù)顯著減弱了miR-29c-5p介導(dǎo)的對GBC細(xì)胞遷移和侵襲的抑制作用(圖6d 和補(bǔ)充圖S5B)。通過蛋白質(zhì)印跡進(jìn)一步分析了MAPK / ERK信號通路中的候選蛋白質(zhì)弹囚。結(jié)果表明厨相,異位表達(dá)或敲低miR-29c-5p會影響p-MEK,p-ERK和p-AKT的水平鸥鹉,并且分別通過重新引入或抑制CPEB4來消除這些作用(圖6e)蛮穿。這些發(fā)現(xiàn)支持以下觀點:CPEB4代表GBC中miR-29c-5p的腫瘤抑制功能的潛在機(jī)制中的重要靶標(biāo)。
在多種腫瘤中,TGF-β是與炎癥和轉(zhuǎn)移相關(guān)的最有力的細(xì)胞因子之一灸异。然而在GBC中很少有功能性實驗報道m(xù)iRNA與TGF表達(dá)之間的相關(guān)性府适。作者研究了TGF-?β是否參與GBC的發(fā)病機(jī)制以及miR-29c-5p / CPEB4誘導(dǎo)的腫瘤轉(zhuǎn)移。為此肺樟,用TGF-?β處理了GBC細(xì)胞(補(bǔ)充圖S5A和D)檐春。有趣的是,發(fā)現(xiàn)TGF-?β治療可顯著降低miR-29c-5p的表達(dá)并增加CPEB4的水平mRNA么伯,提示TGF-?β負(fù)調(diào)控GBC細(xì)胞中的miR-29c-5p / CPEB4軸(圖7a和b)疟暖。接下來,作者檢測了miR-29c-5p模擬物是否可以抑制TGF-?β誘導(dǎo)的GBC轉(zhuǎn)移和侵襲。如所預(yù)期的俐巴,通過與pre-miR-29c一起孵育來減弱TGF-?β誘導(dǎo)的細(xì)胞增殖和遷移(圖7c和d以及補(bǔ)充圖S5C)骨望。這些結(jié)果通過針對幾種EMT相關(guān)蛋白的蛋白質(zhì)印跡分析進(jìn)一步證實(圖7e)。這些結(jié)果表明miR-29c-5p / CPEB4軸在TGF-?β誘導(dǎo)的腫瘤轉(zhuǎn)移中具有關(guān)鍵作用(圖7f)欣舵,并強(qiáng)烈支持以下結(jié)論:miR-29c-5p在介導(dǎo)炎癥和癌癥兩者之間的聯(lián)系中起重要作用擎鸠。
文獻(xiàn)總結(jié):
研究結(jié)果表明,miR-29c-5p在GBC中顯著下調(diào)邻遏。體內(nèi)外實驗表明TGF-β通過MAPK / ERK途徑誘導(dǎo)的miR-29C-5P的表達(dá)降低在膽囊癌細(xì)胞增殖與轉(zhuǎn)移中具有重要作用以及通過直接靶向CPEB4的轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo)上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化糠亩。這些結(jié)果為TGF-?β介導(dǎo)的GBC轉(zhuǎn)移的分子發(fā)病機(jī)理提供了新的機(jī)制研究,并為GBC的治療提供了潛在的新治療靶標(biāo)准验。
原文地址:https://www.nature.com/articles/cdd2016146
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