isoseq3官網(wǎng):但是后面有polish這一步
IsoSeq/isoseq-clustering.md at master · PacificBiosciences/IsoSeq · GitHub
IsoSeq_SA3nUP
比上面的pipeline更為簡潔泻轰,并且對后續(xù)分析有交待陕靠。
另一個參考的pipeline:https://ucdavis-bioinformatics-training.github.io/2020-september-isoseq/liz/bioconda/2-bioconda