shell作為交互界面
source
source被稱為點(diǎn)命令悲靴，用于重新執(zhí)行剛修改的初始化文件source filename
source ~/ .bashrc bashrc用戶變量，包含bash shell的所有bash信息
conda安裝
1. 清華conda鏡像源找到Anaconda/Minconda安裝包
注意conda版本和系統(tǒng)
conda
2. conda安裝和激活
conda安裝
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.11.0-Linux-x86_64.sh
在shell中激活conda
source ~/.bashrc
輸入conda后顯示conda信息則說明conda環(huán)境激活成功
conda
3. 修改conda channel
config ：Modify configuration values in .condarc. 修改conda設(shè)置
conda --add cha 添加鏡像
# 使用中科大的鏡像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
conda info 可以查看channel信息莫其，看到鏡像成功添加
conda info
conda使用
conda list
可查看當(dāng)前服務(wù)器上所安裝程序
conda軟件安裝
conda install 加上程序名稱
conda remove 加上軟件名稱
conda環(huán)境創(chuàng)建
conda create --name + python版本 +軟件名稱
可能在運(yùn)用不同程序的時(shí)候會(huì)出現(xiàn)某些必須環(huán)境程序不兼容的情況，可以通過創(chuàng)建conda環(huán)境分開安裝以解決問題
conda info --env查看當(dāng)前conda環(huán)境
conda environment
可以看到已經(jīng)創(chuàng)建了一個(gè)新的環(huán)境rna-seq乱陡，默認(rèn)env為base (加了 *）
激活新環(huán)境
conda activate
image.png
