召喚Linux

Linux

• 本質(zhì)上是個(gè)操作系統(tǒng)症汹，和Windows，Mac性質(zhì)一樣
• 操作靠鍵盤輸入命令行來(lái)實(shí)現(xiàn) 我們常用的Windows主要是靠鼠標(biāo)點(diǎn)擊實(shí)現(xiàn)操作烂完，方便快捷
• 采用目錄結(jié)構(gòu)焕议，目錄相當(dāng)于windows的文件夾逮京，linux系統(tǒng)沒有C/D/E/F盤，文件系統(tǒng)呈樹狀嘱根。
  所以別被后頭什么路徑髓废、目錄之類的名詞唬住，這些東西實(shí)質(zhì)上就是一個(gè)個(gè)的文件夾
• 整個(gè)系統(tǒng)并不智能该抒，但是很忠實(shí)慌洪，不會(huì)自作主張，你輸入什么凑保，它就會(huì)做什么冈爹。
  系統(tǒng)的智能化程度賊低，在Windows中鼠標(biāo)移動(dòng)單擊這樣的操作欧引，在linux中都尼瑪需要通過輸入命令來(lái)實(shí)現(xiàn)
• 更具體的可以看看這里

學(xué)生信的為啥都要用linux

• 生物軟件基于linux频伤，系統(tǒng)開源、免費(fèi)芝此，不需要圖形界面憋肖，有效節(jié)約資源。
• 命令行模式可以批量癌蓖、高效地處理文件瞬哼，滿足數(shù)據(jù)分析的要求。
• 說白了就是現(xiàn)在硬件技術(shù)比較不過關(guān)租副，用那些花哨的系統(tǒng)運(yùn)行多半會(huì)死機(jī) 所以量子計(jì)算機(jī)快點(diǎn)出世吧

怎樣召喚linux--關(guān)于阿里云服務(wù)器

• 阿里云免費(fèi)服務(wù)器請(qǐng)點(diǎn)擊這里
  用戶名和密碼直接用淘寶的坐慰， 畢竟都姓馬 或者自己注冊(cè)也行，免費(fèi)試用一個(gè)月

• 點(diǎn)免費(fèi)領(lǐng)取=》登陸=》最下面支付寶圖標(biāo)（點(diǎn)擊使用支付寶掃碼登陸）=》實(shí)名認(rèn)證=》返回領(lǐng)取
  在"免費(fèi)套餐"的個(gè)人版中選擇“云服務(wù)器ECS”，后點(diǎn)擊右側(cè)的“免費(fèi)領(lǐng)取”
  具體是下面這樣子滴

• 彈出窗口“補(bǔ)充產(chǎn)品信息”结胀，選擇“華北2”赞咙，在操作系統(tǒng)中選擇CentOS/7.4 64位（CentOS為L(zhǎng)inux常用操作系統(tǒng)），之后把服務(wù)協(xié)議勾上糟港，點(diǎn)擊“立刻運(yùn)行”
  具體是下面這樣子滴

• 在新彈出的界面中點(diǎn)擊右上“控制臺(tái)”
  
  
  之后在控制臺(tái)界面的左側(cè)工具欄中點(diǎn)擊“云服務(wù)器ECS”（圖標(biāo)為三道橫杠）

• 在“概述”中點(diǎn)擊 “我的資源-華北2-云服務(wù)器1”攀操，下跳至“實(shí)例”

• “實(shí)例”中顯示“實(shí)例ID/名稱”，下面左側(cè)第一行是實(shí)例ID秸抚，第二行是實(shí)例名稱

  • 實(shí)例名稱可以直接修改（點(diǎn)擊“名稱”后面的“畫筆”標(biāo)志速和，完成重命名）
  • 登錄密碼的修改需要點(diǎn)擊右側(cè)“更多”=》密碼/密鑰=》重置密碼，然后重新設(shè)置遠(yuǎn)程登錄密碼
    
    
  • 實(shí)例ID的修改 其實(shí)也可以不改 需要點(diǎn)擊右側(cè)“更多”=》實(shí)例設(shè)置=》修改信息剥汤，然后重新設(shè)置ID
    
    
    

• 修改完成后一定要重啟颠放，一定要重啟，一定要重啟吭敢，修改才會(huì)生效

  • 重啟需點(diǎn)擊右側(cè)“更多”=》實(shí)例狀態(tài)=》重啟碰凶，點(diǎn)擊之后要等一會(huì)兒重啟才能完成，重啟完成后鹿驼，就可以遠(yuǎn)程登錄了
  • PS：需要注意的是“IP地址”欄中顯示的公共地址（公）欲低，這個(gè)在下面會(huì)用到
    

怎樣登錄服務(wù)器

• 在Windows系統(tǒng)下，登錄使用的是putty的終端（terminal）畜晰，putty在百度自行下載

• 首次遠(yuǎn)程登陸的用戶名是root用戶砾莱，也就是管理員用戶登陸

• 點(diǎn)擊putty的終端，在Host Name (or IP address)中輸入之前阿里云root的公網(wǎng)IP舷蟀，點(diǎn)擊open恤磷，之后會(huì)彈出一個(gè)對(duì)話框，選擇yes野宜，之后就正式進(jìn)入工作界面
  

• 界面中顯示login as：在后面輸入你的用戶名（也就是root）
  

  
  接著會(huì)讓你輸入密碼扫步，直接將之前設(shè)置的遠(yuǎn)程登錄密碼敲進(jìn)去就行
  • PS：在密碼的輸入過程中，密碼本身是不會(huì)在界面上顯示的匈子，不要懷疑系統(tǒng)停運(yùn)或是鍵盤壞了之類的河胎，直接把密碼正確輸完，然后敲回車就能進(jìn)去
    密碼輸入完成是下面這個(gè)樣子滴虎敦，注意綠色光標(biāo)前面已經(jīng)變成了[root@MiMiMi]游岳，表示你現(xiàn)在在一個(gè)叫做MiMiMi的root目錄 文件夾下
    

linux的基本操作

• 這里開始就是重頭戲了，幾種常見的linux命令 主要是文件夾建立刪除其徙，文件建立刪除修改之類的
• 此處事先說明胚迫，重啟程序能夠解決絕大多數(shù)問題，包括但不局限于輸入錯(cuò)誤唾那、電腦卡死什么的
  如果有什么是重啟程序搞不定的访锻，建議重啟電腦

  • pwd：print working directory，指打印（顯示）當(dāng)前路徑期犬，可以理解為Windows中的顯示當(dāng)前文件夾河哑，當(dāng)前路徑是/root
    PS：在# 后輸入pwd，然后回車龟虎，會(huì)顯示/root璃谨，表示打印當(dāng)前路徑 顯示當(dāng)前文件夾 完成，下面的綠色光標(biāo)表示你依然在root@MiMiMi路徑下進(jìn)行操作
    

  • mkdir：make directory鲤妥，指創(chuàng)建空目錄（路徑）佳吞，可以理解為在root這個(gè)總目錄 文件夾 下創(chuàng)建新的目錄 文件夾，輸入時(shí)為mkdir+空格+目錄名 文件夾名稱旭斥，輸入后沒報(bào)錯(cuò)則表明創(chuàng)建成功
    PS：在#后輸入mkdir biosoft容达，然后回車，會(huì)在root目錄（文件夾）下創(chuàng)建一個(gè)名為biosoft的新目錄文件夾
    PPS：可以同時(shí)創(chuàng)建復(fù)數(shù)個(gè)新目錄
    

  • ls：顯示列表垂券，顯示當(dāng)前目錄下 文件夾中 的所有內(nèi)容，包括目錄 文件夾 及文件羡滑，直接輸入ls即可
    PS：在#后輸入ls菇爪，然后回車，就會(huì)顯示當(dāng)前目錄下的所有目錄及文件
    下圖中藍(lán)色文字為前面創(chuàng)建的5個(gè)目錄
    

  • rm：remove柒昏，指刪除操作凳宙，刪除文件和目錄 文件夾 的指令不相同
    刪除文件：rm+空格+文件名
    刪除空目錄：rmdir+空格+目錄名
    刪除有內(nèi)容的目錄：rm+空格+-r+目錄名
    PS：在刪除有內(nèi)容的目錄時(shí)，系統(tǒng)會(huì)逐個(gè)提問你是否刪除目錄职祷，是否刪除目錄里的文件 賊麻煩氏涩，全部輸入yes就OK

    • 下圖中，原本在root@MiMiMi目錄下有biosoft, del, project, src, tmp五個(gè)空目錄有梆，通過輸入rmdir del/是尖，刪除了del目錄，所以再次顯示的時(shí)候就只剩下了biosoft, project, src, tmp四個(gè)目錄
      
    • 下圖中泥耀，原本在root@MiMiMi目錄下有biosoft, project, src, tmp四個(gè)空目錄以及 home.txt 這一個(gè)文件饺汹，通過輸入rm home.txt，刪除了文件home.txt痰催，所以再次顯示的時(shí)候就只剩下biosoft, project, src, tmp四個(gè)目錄；
      注意在輸入rm home.txt 之后，系統(tǒng)提示是否remove這個(gè)文件纤垂，輸入yes
      
    • 下圖中损肛，原本在root@MiMiMi目錄下有biosoft, project, src, tmp四個(gè)目錄，其中src目錄下又有一個(gè)名為 hello.txt 的文件缝裁，通過輸入 rm -r src扫皱，刪除了src目錄，所以再次顯示的時(shí)候就只剩下biosoft, project, tmp三個(gè)目錄
      注意在輸入rm -r src之后，系統(tǒng)會(huì)依次提示是否進(jìn)入src目錄（descend into direct 'src'?）啸罢，是否刪除src目錄下的hello.txt 文件（remove regular file 'src/hello.txt'?）编检，以及是否刪除src目錄（remove direct 'src'?），全部輸入yes
      

  • cd：change directory扰才，指進(jìn)入某一個(gè)目錄 相當(dāng)于Windows中的雙擊文件夾允懂，輸入時(shí)為cd+空格+目錄名
    cd - 指返回前一個(gè)目錄 相當(dāng)于Windows中的“返回”，輸入時(shí)為cd+空格+-
    cd ~ 指直接返回主目錄輸入時(shí)為cd+空格+~+空格+目錄名

    • 下圖中衩匣，原本處在root@MiMiMi目錄下蕾总，通過輸入 cd tmp，進(jìn)入了root@MiMiMi tmp 目錄下
      

    • 下圖中琅捏，原本處在root@MiMiMi tmp 目錄下生百，通過輸入 cd -，重新回到了root@MiMiMi目錄下
      

    • 下圖中柄延，原本處在root@MiMiMi tmp 目錄下蚀浆，通過輸入 cd ~，返回到了主目錄root@MiMiMi下
      

  • vi：visual搜吧，指新建文本文檔 終于不再是文件夾了
    文檔簡(jiǎn)歷后市俊，點(diǎn)擊“i”，就可以在文檔中輸入文字了
    內(nèi)容輸入結(jié)束后滤奈，點(diǎn)擊“ESC”摆昧，即可結(jié)束對(duì)文本的編輯
    之后輸入“：x”，就完成了對(duì)文檔的保存和退出

    • 下圖中蜒程，在輸入“vi hello_world.txt”之后绅你，下面出現(xiàn)了很多行的藍(lán)色~，顯示已經(jīng)在root@MiMiMi目錄下建立了文件 “ hello_world.txt”
      

    • 下圖中昭躺，在點(diǎn)擊“i“之后忌锯，就可以在“ hello_world.txt”文件中進(jìn)行編輯寫作了，這里寫了10行的miaomimi
      

    • 下圖中窍仰，在點(diǎn)擊“ESC”之后汉规，圖片中的 “--INSERT--” 消失，表明對(duì)文本的編輯結(jié)束了
      

      
      

    • 下圖中驹吮，在輸入 “:x” 后點(diǎn)擊回車针史，則界面由文本界面回到目錄界面，表明對(duì)該文檔的保存和退出工作已完成
      

      
      

  • cat：catenate碟狞，指查看并將內(nèi)容直接輸入到屏幕啄枕，輸入方法是 cat+空格+文件名
    head+文件名：默認(rèn)輸出前10行
    tail+文件名：默認(rèn)輸出后10行
    head+空格+-n+X+空格+文件名：輸出從開頭到第X行（這里注意head和-n之間必須有空格，-n和X之間的空格可有可無(wú)）

    • 下圖中族沃，在輸入cat hello_world.txt 之后频祝，屏幕上顯示了hello_world.txt文件的全部?jī)?nèi)容泌参，即10行的miaomimi
      

    • 下圖中，在輸入 head -n 5 hello_world.txt之后常空，屏幕上顯示了hello_world.txt文件中從頭至第5行的內(nèi)容沽一，即5行的miaomimi
      

  • cp：copy，指復(fù)制文件漓糙，輸入方法是cp+空格+文件名A+空格+文件名B

    • 下圖中铣缠，在輸入 cp hello_world.txt new_file.txt之后，顯示在root@MiMiMi目錄下的hello_world.txt文件被復(fù)制昆禽，且復(fù)制得到的新文件名為new_file.txt
      

  • mv：move蝗蛙，指將文件移入目錄文件夾，輸入方法是
    將文件移入目錄：mv+空格+文件名+空格+目錄名
    文件重命名：mv+空格+文件名+空格+新文件名

    • 下圖中醉鳖，root@MiMiMi目錄下原本有 hello_world.txt 和 new_file.txt 兩個(gè)文件捡硅，在輸入 mv new_file.txt home.txt 之后，root@MiMiMi目錄下的兩個(gè)文件變成了hello_world.txt 和 home.txt盗棵， 顯示原來(lái)的文件 new_file.txt 已經(jīng)被重命名為了 home.txt
      

    • 下圖中壮韭，root@MiMiMi目錄下原本有 hello_world.txt 和 home.txt 兩個(gè)文件，在輸入 mv home.txt tmp/ 之后纹因，root@MiMiMi目錄下文件就只剩下 hello_world.txt 了泰涂；通過輸入 cd tmp/ 進(jìn)入 tmp 目錄，再輸入 cat home.txt 辐怕，發(fā)現(xiàn) home.txt 文件中的內(nèi)容（10行miaomiaomiao），說明文件 home.txt 已經(jīng)被移入了 tmp 目錄
      

其它

• 大概就是這樣子了从绘，拖了一天多寄疏，好歹寫完了，我的標(biāo)準(zhǔn)是 沒有蛀牙僵井，畢竟牙都?jí)牧撕脦最w了 只要還有基本的理解力陕截，就應(yīng)該看得懂這份筆記
• PS：這里面的很多圖都是直接從生信星球截的，版權(quán)啥的就被深究了批什，反正小潔也沒法咬我农曲。另外，如果她看到了這一段就說明有好好看作業(yè)驻债，不然我就可以開開心心的吐槽她了