很久以前倾芝，有個掃煙囪的小男孩，名叫湯姆箭跳，他受盡了師傅格林先生的虐待晨另。一天，他跟隨師傅去哈特荷佛莊園掃煙囪谱姓，無意中闖入了約翰爵爺女兒愛麗小姐的閨房借尿，被誤當成了小偷遭到追捕。在水仙女的暗中保護下屉来，湯姆來到了小溪邊路翻，沉睡到水中，變成了水孩子茄靠。
湯姆一覺醒來茂契，發(fā)現(xiàn)自己可以在水里自由自在地游來游去。他從小溪經(jīng)過江河游到大海慨绳，同水中各種稀奇古怪的動物打交道掉冶，好不容易找到了其他水孩子，并隨他們一起來到水孩子們的家——圣白蘭登仙女島脐雪。
島上居住著成千上萬被水仙女收留的水孩子厌小。湯姆太調(diào)皮，一直欺負小動物战秋，還把石子放進鸿笛牵葵的嘴里讓它當晚飯。相貌丑陋卻心地善良的懲惡仙女把他喚過去脂信，將一顆石子塞進他的嘴里懲罰他癣蟋。她告訴湯姆，若他做個好孩子吉嚣，她的妹妹一美麗的揚善仙女就會注意到他梢薪，還會抱抱他，親親他尝哆，教他怎樣做人。
湯姆饞嘴甜攀，偷吃了懲惡仙女放在櫥里的海糖果秋泄，受到了懲罰，渾身長滿了尖刺规阀。懲惡仙女讓同樣變成水孩子的愛麗小姐來教湯姆學習恒序，就這樣不知不覺過了七年。仙女告訴湯姆谁撼，要成為一個頂天立地的男子漢歧胁，就要學學愛麗，去不喜歡的地方，幫助不喜歡的人喊巍。
于是屠缭，湯姆獨自一人，開始遠行崭参，到“天外天”去尋找呵曹、幫助他不喜歡的師傅格林先生。他在海燕和海鷗的幫助下何暮，來到閃光城奄喂，在黑漆漆的海底整整游了七天七夜，穿過那扇從不打開的白城門海洼，到達善良鯨魚安息的和平池跨新，找到了讓舊動物重生變成新動物的慈愛婆婆，并得知了去“天外天”的路坏逢。
在前往“天外天”的路上玻蝌，湯姆經(jīng)歷的冒險一次比一次離奇。他去過壞書堆積如山的廢紙國词疼、顛倒是非的流氓島俯树、水中撈月的愚人城，還有從早到晚只會唱同一首歌“功課我沒學會呀贰盗，考試先生來了呀”的可憐蘿卜們住的大頭娃娃島许饿，他懂得了很多道理。
最后舵盈，在獨立自主的警棍的陪伴下陋率，湯姆來到了“天外天”關押格林先生的三百四十五號煙囪監(jiān)牢，用寬容之心拯救了格林的靈魂秽晚。在仙女們的感化瓦糟、教育和引導下，湯姆歷經(jīng)千辛萬苦赴蝇，終于戰(zhàn)勝了自己菩浙，成為了一個真正的男子漢，回到了魂牽夢縈的仙女島句伶。
