RS-fMRI統(tǒng)計(jì)分析及作圖入門

獲取統(tǒng)計(jì)圖

要做統(tǒng)計(jì)分析需要以下數(shù)據(jù)文件



第二個(gè)檢查空間變準(zhǔn)化效果,一張一張圖片打開,看配準(zhǔn)效果好不好耽梅,肉眼可見配的不好的就可以直接排除掉。細(xì)微的差錯(cuò)視自己的數(shù)據(jù)要求來抉擇胖烛。
第三個(gè)檢查頭動(dòng)效果眼姐,文件夾打開之后,看文本文檔“ExcluedeSubjects.txt”佩番,里面會(huì)給出頭動(dòng)大于3.0众旗, 2.5 ... 的都有哪個(gè)被試
可以把以上數(shù)據(jù)分別存入case/control組里面
接下來可以用RESTplus做t檢驗(yàn):
打開RESTplus —— statistics analysis —— Two sample t-test —— 添加分組,一定是先導(dǎo)入patient答捕,再倒入group(因?yàn)樽詈蟮慕Y(jié)果是patient-gruop) —— 可以選mask —— compute結(jié)束逝钥,可以得到一張統(tǒng)計(jì)圖

拿到統(tǒng)計(jì)圖之后怎么辦?

統(tǒng)計(jì)圖實(shí)際上就是為了看一下拱镐,兩組之間有差異的部分艘款。拿到統(tǒng)計(jì)圖之后,首先要做的是校正
GRF校正:打開Theory Correction —— 加入統(tǒng)計(jì)map —— 選擇mask(全腦的) —— t檢驗(yàn)選擇雙尾沃琅,f檢驗(yàn)選單尾 —— p寫0.001 哗咆,也可以0.005 —— run
在matlab的窗口里面會(huì)生成如下的結(jié)果



意思是要想通過多重比較校正,團(tuán)塊的大小必須大于261voxels
做完多重比較校正之后益眉,會(huì)生成以下文件晌柬,我們要用的是最后一個(gè)姥份,已經(jīng)轉(zhuǎn)換為了Z值



這個(gè)nii可以用RESTplus的view來查看
如果要用這個(gè)圖,可以進(jìn)行美化:
點(diǎn)擊template選擇CH2年碘,可以加上腦底板
可以取消勾選crosshair澈歉,就可以去掉兩掉坐標(biāo)軸

Misc里面可以 設(shè)置color bar,最小是2屿衅,最大20
Montarge可以選擇顯示幾層
cluster size里面輸入261
CI Reprot可以導(dǎo)出實(shí)驗(yàn)報(bào)告
之后再matlab命令框里面有:團(tuán)塊voxel大小埃难,團(tuán)塊峰值點(diǎn)坐標(biāo),

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