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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序:揭示肝母細(xì)胞瘤的細(xì)胞結(jié)構(gòu)和發(fā)育軌跡
本研究對五名肝母細(xì)胞瘤(HB)患者的腫瘤和遠(yuǎn)端肝組織樣品進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析膘壶,利用反卷積分析將單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組譜與神經(jīng)輔助化學(xué)療法治療后的HB隊列轉(zhuǎn)錄組相結(jié)合。通過建立早期人肝實質(zhì)發(fā)育的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜恶阴,探索HB腫瘤發(fā)生的細(xì)胞根和層次結(jié)構(gòu)暂幼。單細(xì)胞測序結(jié)果顯示糊肤,共注釋了七個不同的腫瘤細(xì)胞亞群病涨,并根據(jù)其組成建立了有效的HB亞型方法。進(jìn)一步揭示了HB腫瘤細(xì)胞層次結(jié)構(gòu)不僅與經(jīng)典的癌癥干細(xì)胞(cancer stem cell, CSC)模型相吻合疙描,同時還反映了早期人類肝實質(zhì)發(fā)育。本研究證明了一種基于腫瘤細(xì)胞亞群組成的新的HB亞型方法讶隐,并提出促進(jìn)染色質(zhì)轉(zhuǎn)錄(facilitates Chromatin Tranion, FACT)的抑制可能破壞HB中MYC和SSRP1之間的致癌陽性反饋回路起胰。
總之,本研究通過對HB腫瘤轉(zhuǎn)錄組的整體分析巫延,以及對HB腫瘤細(xì)胞及其發(fā)育對應(yīng)物的比較分析效五,全面的闡釋了HB腫瘤生成以及癌癥異質(zhì)性的細(xì)胞和分子基礎(chǔ)。
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單細(xì)胞測序揭示SGLT2抑制劑緩解青少年發(fā)病2型糖尿病腎小管代謝和mTORC1紊亂
青年發(fā)病型2型糖尿病(T2D)是世界范圍內(nèi)兒童和青少年糖尿病越來越常見的原因炉峰。與年輕發(fā)病的1型糖尿病(T1D)相比畏妖,它的臨床病程更嚴(yán)重,其特征是在青春期和青年期經(jīng)常出現(xiàn)糖尿病腎病(DKD)疼阔。鈉-葡萄糖共轉(zhuǎn)運(yùn)體-2 (SGLT2)抑制劑是一種非常有效的治療方法戒劫,它正在徹底改變T2D患者DKD的管理。但目前對鈉-葡萄糖共轉(zhuǎn)運(yùn)體-2 (SGLT2)抑制劑(SGLT2i)的分子機(jī)制仍不完全清楚婆廊。單細(xì)胞RNA測序和形態(tài)測量數(shù)據(jù)收集年齡在12-21歲的2型糖尿病年輕人(T2D)和健康對照組(HC)捐贈的腎活檢組織迅细。與HC相比,T2D患者肥胖淘邻,估計腎小球濾過率茵典、系膜和腎小球體積更高。10例T2D患者使用SGLT2i (T2Di(+))宾舅,6例未使用(T2Di(-))统阿。轉(zhuǎn)錄譜顯示SGLT2僅在近端小管(PT)簇表達(dá),T2Di(-)表達(dá)最高筹我。然而扶平,SGLT2i治療的轉(zhuǎn)錄改變在整個腎元段可見,特別是在遠(yuǎn)端腎元崎溃。SGLT2i治療與PT中糖酵解蜻直、糖異生、三羧酸循環(huán)通路轉(zhuǎn)錄本的抑制有關(guān)袁串,但在粗升肢中增強(qiáng)概而。在T2Di(+)中,能量敏感哺乳動物雷帕霉素復(fù)合物1 (mTORC1)信號通路靶點(diǎn)的轉(zhuǎn)錄物恢復(fù)到所有管狀節(jié)段的HC水平囱修,與SGLT2i治療的糖尿病小鼠模型一致赎瑰。T2Di(+)中近端和遠(yuǎn)端小管磷酸化S6蛋白水平的降低證實了mTORC1通路活性的變化。研究者認(rèn)為SGLT2i治療通過抑制腎小管中的mTORC1信號通路來減輕糖尿病誘導(dǎo)的代謝紊亂破镰,從而對腎臟有益餐曼。研究者未來的研究方向包括設(shè)計一項嚴(yán)格的試驗压储,以檢查抑制SGLT2緩解T2D中DKD進(jìn)展的分子和代謝機(jī)制,以及確定本研究中觀察到的轉(zhuǎn)錄變化是否可以預(yù)測腎損傷和功能衰退的長期進(jìn)展源譬。
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和蛋白組揭示小鼠胰島細(xì)胞亞群特征在高脂喂養(yǎng)條件下的適應(yīng)性
胰島是調(diào)控機(jī)體血糖穩(wěn)態(tài)最重要的器官集惋,主要由其中的α、β和δ等內(nèi)分泌細(xì)胞發(fā)揮作用踩娘,肥胖誘導(dǎo)的2型糖尿病在糖尿病早期即開始出現(xiàn)胰島功能障礙刮刑,胰島α、β养渴、δ細(xì)胞激素分泌開始紊亂雷绢,胰島功能損傷的加劇,患者病情也會隨之逐漸惡化理卑。探究糖尿病早期細(xì)胞亞群組成的變化對2型糖尿病的精準(zhǔn)治療和預(yù)防具有十分重要的意義翘紊。
本文利用單細(xì)胞測序技術(shù)對高脂飲食誘導(dǎo)的肥胖小鼠模型的胰島進(jìn)行檢測,找到了能夠?qū)ⅵ撩赀搿ⅵ路薄ⅵ募?xì)胞亞群區(qū)分開的標(biāo)志物,其次在這些細(xì)胞的亞亞型分析中中捆,也發(fā)現(xiàn)ACE2鸯匹、CD81和GLUT2可作為表面標(biāo)志物分別區(qū)分成熟度和功能狀態(tài)不同的α、β和δ細(xì)胞亞群泄伪,如ACE2low的α細(xì)胞是表現(xiàn)出β樣細(xì)胞特征的成熟α細(xì)胞殴蓬。并應(yīng)用流式細(xì)胞術(shù)進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)高脂負(fù)荷對小鼠胰島各細(xì)胞亞群比例的影響,發(fā)現(xiàn)在高脂誘導(dǎo)的糖尿病早期蟋滴,低能且不成熟的ACE2low α細(xì)胞比例上升染厅,功能活躍且成熟的CD81low β細(xì)胞比例上升,成熟的GLUT2low δ細(xì)胞比例雖未發(fā)生改變但功能強(qiáng)化津函。在糖尿病發(fā)生過程中這些細(xì)胞的動態(tài)變化說明了胰島在高脂負(fù)荷下的強(qiáng)可塑性肖粮,通過抑制升血糖的α細(xì)胞功能,增強(qiáng)降血糖的β細(xì)胞功能和增加δ細(xì)胞對α尔苦、β的調(diào)控可以對抗代謝應(yīng)激調(diào)控血糖重回穩(wěn)態(tài)涩馆。
總之,該研究描述了肥胖引起的2型糖尿病早期胰島細(xì)胞各功能亞型圖譜允坚,以及細(xì)胞亞型在疾病進(jìn)程中的動態(tài)變化魂那,發(fā)現(xiàn)可能改變胰島亞群分布的手段,從而強(qiáng)化胰島的代謝適應(yīng)性功能或為糖尿病治療的新思路稠项。
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單細(xì)胞+空間轉(zhuǎn)錄組測序:揭示常駐巨噬細(xì)胞亞群在腎臟微環(huán)境中的分布
腎常駐巨噬細(xì)胞(KRMs)在穩(wěn)態(tài)和對急性腎損傷的反應(yīng)中起著重要作用涯雅。
本研究通過單細(xì)胞RNA-Seq(scRNA-Seq)、空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)展运、流式細(xì)胞術(shù)和免疫熒光成像技術(shù)活逆,在雙側(cè)缺血腎損傷靜止期和19分鐘后定位精刷、表征和驗證KRM亞群。scRNA-Seq和空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)注釋了7個不同的KRM亞群蔗候,每個亞群都可以通過一個獨(dú)特的轉(zhuǎn)錄組特征來識別怒允,表明其不同的功能。隨后利用鑒定出2個cluster的特異性蛋白標(biāo)記物琴庵,使用流式細(xì)胞術(shù)或免疫熒光成像進(jìn)行分析误算。
結(jié)果顯示,損傷后迷殿,每個cluster的原始定位丟失;損傷后至少28天內(nèi)咖杂,KRM原來的空間分布沒有完全恢復(fù)庆寺。KRM定位的改變證實了急性損傷后局部免疫系統(tǒng)的失調(diào),并解釋了慢性腎臟疾病風(fēng)險增加的可能因素诉字。
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抗PD-1治療導(dǎo)致皮膚T細(xì)胞淋巴瘤超進(jìn)展的機(jī)制
原發(fā)性皮膚T細(xì)胞淋巴瘤(CTCL)是一類皮膚歸巢T細(xì)胞起源的惡性腫瘤懦尝,真菌樣(MF)和Sezary綜合征(SS)占該病的65%,晚期病人的全身多藥物化療反應(yīng)短暫導(dǎo)致預(yù)后較差壤圃。PD-1檢查點(diǎn)抑制劑療法在MF/SS患者治療的有效率為15%-38%陵霉,但有25%-31%的晚期病人在治療后出現(xiàn)進(jìn)展,因此非常有必要探討抗PD-1治療后的T細(xì)胞淋巴瘤進(jìn)展機(jī)制伍绳,來指導(dǎo)精確和安全的免疫治療踊挠。
本研究對一名在首次低劑量PD-1治療后出現(xiàn)淋巴瘤超進(jìn)展現(xiàn)象的晚期CTCL患者的血液進(jìn)行了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組及免疫組庫測序,探究PD-1單抗治療前后的腫瘤性T細(xì)胞和非腫瘤性T細(xì)胞反應(yīng)的變化冲杀,發(fā)現(xiàn)PD-1單抗治療導(dǎo)致腫瘤性T細(xì)胞顯著增殖活化效床,而對非腫瘤性T細(xì)胞則無太大影響,流式和單細(xì)胞實驗均證實了腫瘤性T細(xì)胞高表達(dá)PD-1权谁,通過TCR依賴的方式抑制腫瘤細(xì)胞增殖剩檀,而功能實驗也進(jìn)一步在PD-1單抗治療中解除了PD-1通路對下游信號的抑制作用,進(jìn)而促進(jìn)了腫瘤超進(jìn)展旺芽,然后為了解析PD-1的TCR依賴性增殖抑制作用的機(jī)制沪猴,對患者進(jìn)行了全基因組測序,發(fā)現(xiàn)患者腫瘤性T細(xì)胞中存在PRKCQ的顯著擴(kuò)增采章,而之前的研究表明其編碼蛋白PKCθ的538位蘇氨酸的磷酸化是TCR/NF-kB通路激活的關(guān)鍵运嗜,在病人組織中也發(fā)現(xiàn)治療后p-PKCθ水平的上調(diào),加入其抑制劑后能夠顯著抑制腫瘤的超進(jìn)展共缕。
總之洗出,該研究從單細(xì)胞水平闡釋了PD-1單抗導(dǎo)致CTCL進(jìn)展的機(jī)制,表明了PD-1在具有致癌性TCR通路激活的惡性T細(xì)胞中是重要的腫瘤抑制因子图谷,有利于提高T細(xì)胞淋巴瘤患者在抗PD-1/PD-L1治療中的臨床獲益翩活。
參考文獻(xiàn)?
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