aplot

Y叔開發(fā)派继，拼圖解決坐標(biāo)對(duì)齊的問題

extrafont

解決ggplot2繪圖導(dǎo)出pdf文件中文字體亂碼的問題 對(duì)應(yīng)的B站介紹視頻https://www.bilibili.com/video/BV1ke411p7B4?from=search&seid=18105130207805018028

rstatix

里面有一個(gè)函數(shù)sample_n_by()分組取樣，基本用法sample_n_by(iris,Species,size=3)，還有一些其他用來做數(shù)理統(tǒng)計(jì)的函數(shù)，比如t檢驗(yàn)犁跪，卡方檢驗(yàn)之類的调违，鑒定離群值的函數(shù)identify_outliers()幫助文檔提供的一個(gè)例子

demo.data <- data.frame(
  sample = 1:20,
  score = c(rnorm(19, mean = 5, sd = 2), 50),
  gender = rep(c("Male", "Female"), each = 10)
)
identify_outliers(demo.data,score)

還有函數(shù)is_outlier()直接輸入向量鑒定異常值

plantlist

查詢和處理植物學(xué)名的用R程序包，科學(xué)網(wǎng)介紹文章 http://blog.sciencenet.cn/blog-255662-846673.html
自己可能會(huì)用到輸入拉丁名然后獲取科屬信息這個(gè)功能
自己看論文的時(shí)候遇到拉丁名總會(huì)想知道中文名涛菠，不知道有沒有軟件可以實(shí)現(xiàn)翻譯拉丁文為中文名

pdftools

今天在 生信技能樹 公眾號(hào) 看到的推文 R語言奇淫巧技之pdftools包，操作pdf文件非常方便撇吞，用到的時(shí)候可以回過頭看這篇推文俗冻。

bioseq

公眾號(hào)文章 MEE:生物序列數(shù)據(jù)處理工具R包bioseq，主要功能是實(shí)現(xiàn)了DNA牍颈、RNA和氨基酸三種生物序列數(shù)據(jù)處理迄薄。

ggthreed

能夠繪制3d效果的餅圖
github鏈接 https://github.com/coolbutuseless/ggthreed

image.png

ggforce

繪制部分分離的餅圖 https://www.data-imaginist.com/2016/announcing-ggforce/

image.png

broom

Convert Statistical Objects into Tidy Tibbles
可以將統(tǒng)計(jì)分析的結(jié)果轉(zhuǎn)化為數(shù)據(jù)框，然后寫入到文件里

Superheat

復(fù)雜數(shù)據(jù)畫熱圖

ggvenn

韋恩圖 github鏈接 https://github.com/yanlinlin82/ggvenn

Cairo

導(dǎo)出pdf文件字體的問題

代碼

install.packages("Cairo")
library(Cairo)
library(ggplot2)
df<-iris
colnames(df)<-LETTERS[1:5]
library(extrafont)
fonts()
p1<-ggplot(df,aes(x=A,y=B))+
  geom_point(size=8,color="skyblue")+
  theme_bw()+
  annotate("label",x=7,y=2.2,label="Iris\nFontFamily")
ggsave(p1,filename = 'test.pdf',
       device = cairo_pdf,
       family='Times New Roman')

image.png

BRRR

在 賣萌哥 的簡書推送http://www.reibang.com/p/f83fee3e5a60發(fā)現(xiàn)的這個(gè)R包煮岁〖ケ危可以發(fā)出聲音應(yīng)用場(chǎng)景是如果R語言程序運(yùn)行時(shí)間比較長涣易，可以在結(jié)尾處加上一條命令，程序結(jié)束后可以用聲音來提醒自己冶伞。哈哈哈哈哈新症，自己試了一下，里面的聲音還挺好玩的响禽。

安裝方式

devtools::install_github("brooke-watson/BRRR")

現(xiàn)在好像內(nèi)置52種聲音徒爹，我自己都試了一遍。最開始想直接寫循環(huán)芋类，R直接自己退出了瀑焦。接下來想到能不能在循環(huán)的時(shí)候設(shè)置時(shí)間間隔？暫時(shí)還不知道如何實(shí)現(xiàn)梗肝。遂單條命令一個(gè)一個(gè)運(yùn)行榛瓮。

help(package="BRRR")
library(BRRR)
skrrrahh_list()
skrrrahh(sound = 1)
skrrrahh(sound = 2) #
skrrrahh(sound = 3)

patternplot

https://cran.r-project.org/web/packages/patternplot/vignettes/patternplot-intro.html
用額外的圖片填充圖片的背景

比如以上鏈接的圖片

image.png

image.png

ggpattern

github主頁 https://github.com/coolbutuseless/ggpattern

一些圖片

image.png

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小明的數(shù)據(jù)分析筆記本