R way -- P5
Tips
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讀取文件時瑞驱，
read.table(file = "filename" , sep = "\t" , header = T ),- 其中
sep是形式參數(shù)，用來指定字符的分隔符號。csv 文件是用逗號分隔的票彪，所以sep = ",",tsv和txt文件是以 制表符 分隔的，所以sep = "\t",如果有文件的是以空格分隔的，則sep = " " - 其中
header = T指的是導入數(shù)據(jù)時，第一行作為 列的名稱幸缕，具體數(shù)據(jù)從第二行開始 ，如果header = F指的是晰韵，第一行視為具體數(shù)據(jù)发乔。
- 其中
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colnames(a)#查看 a 的列名；rownames(a)#查看 a 的行名-
colnames(a)[1] <- "newname"#如果左上角第一個為空雪猪，R會自動補為x栏尚，用這個命令來修改成自己想要的名字
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b <- read.csv(file = "filename", sep = ",", header = T, row.names = 1)#這行代碼中最后的row.names = 1的意思是 第一列為行名。write.table(a, file = "filename2", sep = ",", quote = F)#導出數(shù)據(jù)框只恨。quote = F意思是 字符串不加雙引號 （默認格式帶有雙引號译仗，不影響讀入）這次沒有處理完的數(shù)據(jù)下次想接著用怎么辦?--學會保存和重新加載。保存的格式是
.RData坤次。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存鏡像文件
save(X,file="test.RData")#保存其中一個變量
load("test.RData")#再次使用 RData 時的加載命令X$列名#可以提取列（優(yōu)秀寫法，而且這個命令還優(yōu)秀到不用寫括號的地步斥赋，并且支持Tab自動補全哦缰猴，不過只能提取一列）-
a <-data.frame(case=paste("S",1:50),values=runif(50))# case和values 是列名。
plot(a$case,a$values)#根據(jù)這兩列的數(shù)據(jù)作圖
為了避免多次輸入變量a,可有更高效的方式-
attach(a) plot(case,values)#attach(a),就是將數(shù)據(jù)框名添加到搜索環(huán)境中疤剑，作圖時就只需輸入列名(連$都不用了)滑绒。detach（a）#做完之后，將a刪除出搜索環(huán)境隘膘。
局限性：兩個以上數(shù)據(jù)框的列名有沖突時疑故，同時attach會報錯。
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課后作業(yè)
原因可能是前文代碼中的x與保存文件是的x的大小寫不統(tǒng)一弯菊，造成找不到對象纵势。
所以在命名變量時，盡量使用大小寫不同的英文字母。
