記住： 界筷弦、門肋演、綱、目奸笤、科惋啃、屬哼鬓、種
后三節(jié)：模式生物监右、構(gòu)成生物的四類分子、分子生物學的中心法則
模式生物
噬菌體--病毒--大腸桿菌--釀酒酵母--秀麗線蟲--果蠅--擬南芥--水稻--非洲爪蟾--斑馬魚--家鼠--人
構(gòu)成生物的四類分子
糖异希、脂肪酸健盒、核苷酸、氨基酸
小分子：單糖称簿、雙糖扣癣、脂肪酸、核苷酸憨降、氨基酸
大分子：【多糖父虑、淀粉、糖原授药、纖維素士嚎、】【核糖核酸RNA、脫氧核糖核酸DNA】悔叽、【蛋白質(zhì)】
單糖莱衩、雙糖和多糖
糖類是碳水化合物，
單糖包括葡萄糖娇澎、果糖笨蚁、半乳糖
麥芽糖由兩個葡萄糖組成，蔗糖是葡萄糖和果糖趟庄，乳糖由葡糖糖和半乳糖組成
脂肪酸
脂肪酸不能形成大分子括细，是脂肪、油戚啥、磷脂的結(jié)構(gòu)成分
分子生物學的中心法則
DNA復制奋单、DNA到mRNA的轉(zhuǎn)錄、mRNA的反轉(zhuǎn)錄與cRNA虑鼎、蛋白質(zhì)的剪接辱匿、蛋白質(zhì)折疊
數(shù)據(jù)庫
一級數(shù)據(jù)庫
直接來源于試驗獲得的原始數(shù)據(jù)键痛，只經(jīng)過簡單的歸類、整理和注釋
包括：一級核酸數(shù)據(jù)庫匾七、一級蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫絮短、一級蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫
數(shù)據(jù)庫記錄由原始序列數(shù)據(jù)、描述這些數(shù)據(jù)生物學信息的注釋組成
世界三大核酸序列數(shù)據(jù)庫：歐美日昨忆，美GenBank丁频，歐EMBL，日DDBJ
數(shù)據(jù)庫格式：文字注釋+內(nèi)容
GenBank和EMBL數(shù)據(jù)庫格式和內(nèi)容：
內(nèi)容：序列邑贴、序列的{名稱席里、長度、日期拢驾、說明奖磁、編號、版本號繁疤、特征表}咖为、物種的{來源、學名稠腊、分類學位置}躁染、相關(guān)文獻的{作者、題目架忌、刊物吞彤、日期}、堿基組成
GenBank格式：LOCUS RATOBESE
二級數(shù)據(jù)庫
在一級數(shù)據(jù)庫叹放、實驗數(shù)據(jù)和理論分析的基礎(chǔ)上饰恕，針對不同的研究內(nèi)容和需要，對生物學知識和信息進一步整理得到的數(shù)據(jù)庫许昨。
第五章 生物序列相似性搜索
相似性和同源性
相似性指一種很直接的數(shù)量關(guān)系（量化關(guān)系）懂盐；同源性指從一些數(shù)據(jù)中推斷出的兩個基因或蛋白質(zhì)序列具有共同祖先的結(jié)論，屬于質(zhì)的判斷糕档。序列的相似性和序的同源性有一定關(guān)系莉恼，一般來說序列間的相似性越高，同源性的可能就越高速那。
序列相似性比較：將待研究序列和DNA或蛋白質(zhì)序列庫進行比較俐银，用于確定該序列的生物屬性，找出與此序列相似的已知序列是什么端仰。
序列同源性比較：將待研究序列加入到一組與之同源捶惜，但是不同物種的序列中進行多序列同時比較，確定該序列和其他序列間的同源性大小荔烧。
Alignment：
序列對位排列吱七，對位排列是通過在序列中插入間隔的方法使所比較的序列長度達到一致汽久。
目的是尋找同原序列，對位排列的作用是使序列間的想似程度最大
全局排列踊餐，局部排列
Score
相似性積分景醇，打分矩陣作為序列相性測度，以便計算機自動處理序列對位排列問題吝岭。