scATAC:人類(lèi)基因組的染色質(zhì)可及性圖譜

標(biāo)題:A single-cell atlas of chromatin accessibility in the human genome
人類(lèi)基因組的染色質(zhì)可及性圖譜

Platform:sci-ATAC-seq
Donors: 15 human
Age: 25-67
Tissues:30 tissues
Nuclei:615,998
Celltypes: 111
cCREs:890,130

在線工具:
cis-element ATLAS [CATLAS] http://catlas.org/humanenhancer

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對(duì)過(guò)濾后得到的615,998個(gè)nuclei進(jìn)行分簇;
共識(shí)別到了30個(gè)細(xì)胞大簇肆捕;111個(gè)細(xì)胞亞簇


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主要研究?jī)?nèi)容
1.整合了人類(lèi)成年/胎兒組織的>1,300,000個(gè)細(xì)胞的染色質(zhì)開(kāi)放情況;
2.識(shí)別了在222個(gè)細(xì)胞類(lèi)型中的1,200,000個(gè)候選順式調(diào)控元件;
3.胎兒/成年階段細(xì)胞類(lèi)型特異性候選調(diào)控元件夭苗;
4.對(duì)復(fù)雜性狀和疾病的非編碼bian

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