Ubuntu14.04下安裝NCL6.3.0過程

今天在windows7系統(tǒng)下安裝ubuntu系統(tǒng),同時安裝一些專業(yè)軟件类嗤,其中在ubuntu下安裝的NCL是比較費腦筋的一項工作糊肠,在此分享一下安裝過程和可能遇到的問題。

一遗锣、序言

首先NCL的安裝主要分為兩個步驟货裹,第一步是適合操作系統(tǒng)版本的NCL下載,第二步是NCL的安裝精偿,那么針對這兩個步驟官網(wǎng)都有非常詳細的介紹弧圆,分別是第一步下載(Download NCL binaries and/or source code)第二步安裝(Install NCL/NCAR Graphics from a precompiled binary),鑒于英文閱讀的難度笔咽,下面我用中文詳細的講一下操作步驟和問題搔预。

二、NCL下載

NCL下載官網(wǎng)的原文說明如下(直接粘貼原文):

  1. Go to www.earthsystemgrid.org
  2. Click on "NCL: NCAR Command Language" (bottom middle of page).
  3. Click on "NCL Version 6.3.0" or the version you're interested in.
  4. Click on whether you want an OPeNDAP binary, a non OPeNDAP binary, or source code. If you don't know what OPeNDAP is, then you probably don't need it.
  5. Click on "Download Options".
  6. Click on the name of the file you want to download, and it should automatically download to your machine.

具體翻譯如下

  1. 訪問網(wǎng)站www.earthsystemgrid.org
  2. 點擊網(wǎng)站上的 "NCL: NCAR Command Language"(位置在主頁下面的中部)
  3. 點擊"NCL Version 6.3.0" 或者其他你感興趣的版本
  4. 點擊OPeNDAP binary叶组、non OPeNDAP binary或者source code的其中一個拯田,如果你并不知道OPeNDAP是什么的話,那你可能并不需要它(意思就是選擇non OPeNDAP binary)
  5. 點擊 "Download Options"
  6. 點擊你想下載文件的名字甩十,就會自動下載到你的機器上面了

值得關(guān)注的是步驟4和步驟6中要面臨選擇版本的問題船庇。
第4步 OPeNDAP,個人意見是如果你和我一樣不知道什么是OPeNDAP侣监,那就選“not OPeNDAP-enabled”版本好了鸭轮,或者去了解一下OPeNDAP的含義再做決定。
第9步 很關(guān)鍵橄霉,筆者此時遇到的選項如下:

這里寫圖片描述
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仔細比較這幾個選擇窃爷,主要區(qū)別在于三點:

  1. 系統(tǒng)版本;
  2. gcc版本(gcc是一套由GNU開發(fā)的編程語言編譯器,支持多種語言按厘,詳見維基百科-gcc詞條医吊,沒興趣了解也沒關(guān)系);
  3. 處理器類型(即i686刻剥,x86_64遮咖,64bit等選項)。

前面給出的鏈接包含了如何了解自己系統(tǒng)版本和gcc版本的提示造虏,即輸入以下三條命令:

uname -m
cat /etc/issue
gcc –-version

如下圖所示,之后所有的終端指令也都是在這個命令框里輸入麦箍,搜索terminal即可找到

這里寫圖片描述
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分別能夠獲取自己系統(tǒng)的處理器類型(筆者為x86_64)漓藕,系統(tǒng)版本(筆者為Ubuntu14.04)以及gcc版本(14.04附帶版本為4.8.4)。第一點沒問題挟裂,第二點NCL官方也有說明:

If your flavor of Linux or “bitness” doesn’t match, then you can
usually use one of the other ones. For example, if you have a CentOS
or Fedora system, then try a RedHat binary. If you have a Ubuntu
system, try a Debian binary.

對于Ubuntu享钞,應(yīng)當(dāng)選擇Debian版本。問題是诀蓉,14.0.4自帶的gcc版本為4.8栗竖,而這里最大只有472,且官網(wǎng)有如下要求:

If your version of gcc doesn’t match any in the list, then use a
version of gcc that is lower or just slightly higher (for example, if
you have gcc 4.4.6, you can probably use a gcc 4.4.5 binary).

含義就是說ubuntu的gcc版本要比下載的NCL要求的低或者高一點渠啤,也就是說我的電腦版本是4.8大于472(也就是4.7.2)狐肢,這樣安裝了可能有問題,雖然沒有試過在高版本gcc下使用NCL到底會不會出現(xiàn)問題沥曹,但保險起見份名,我們最好還是將系統(tǒng)的gcc版本從4.8降至4.7。筆者在這個問題上耗費了半天時間妓美,查閱到了很多復(fù)雜的方法都不順利且不明所以僵腺,最后發(fā)現(xiàn)可以通過一個簡便的方法安裝低版本的gcc并將其更改為系統(tǒng)默認(rèn)的版本(需要計算機聯(lián)網(wǎng))。

解決方法如下
1壶栋、在ubuntu終端中輸入:

sudo apt-get install gcc-4.7

sudo命令表示需要特殊權(quán)限辰如,在輸入后可能系統(tǒng)要求輸入用戶密碼,其實就是安裝Ubuntu時設(shè)定的密碼贵试,亦即開機密碼琉兜。輸入密碼時屏幕沒有反應(yīng),不用管它锡移,輸完敲回車便可呕童。在此之后如果發(fā)生權(quán)限問題,應(yīng)該都可以在命令前加上sudo再試試淆珊。此時計算機開始在服務(wù)器源中下載4.7版本的gcc夺饲。下載完畢后,到gcc目錄下會發(fā)現(xiàn)多了gcc-4.7的相關(guān)文件夾(輸入gcc -v可查看gcc的目錄位置)。
如果遇到了

正在讀取軟件包列表... 完成
正在分析軟件包的依賴關(guān)系樹       
正在讀取狀態(tài)信息... 完成       
現(xiàn)在沒有可用的軟件包 gcc-4.7往声,但是它被其它的軟件包引用了擂找。
這可能意味著這個缺失的軟件包可能已被廢棄,
或者只能在其他發(fā)布源中找到
E: 軟件包 gcc-4.7 還沒有可供安裝的候選者

這樣的錯誤的話浩销,
解決方法: 在你的軟件源中添加源:

sudo gedit /etc/apt/source.list

添加:deb http://cz.archive.ubuntu.com/ubuntu lucid main
保存退出贯涎,再執(zhí)行一遍gcc-4.7安裝語句就可以安裝了,參考自sudo apt-get install E: 軟件包 * 還沒有可供安裝的候選者慢洋,
2塘雳、接下來添加gcc的配置管理,再選擇默認(rèn)的gcc版本:

sudo update-alternatives –install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-4.7 50
sudo update-alternatives –install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-4.8 40
sudo update-alternatives –config gcc

第一行后面的50表示優(yōu)先級普筹,數(shù)字越大败明,則對應(yīng)版本在第二行輸入后出來的結(jié)果中排位越靠前。輸入第三行之后太防,出來幾個選項妻顶,就會發(fā)現(xiàn)我們現(xiàn)在默認(rèn)使用的就是gcc-4.7了。
以上工作都完成后蜒车,gcc降級工作應(yīng)該就結(jié)束了讳嘱,準(zhǔn)備工作也已完成,此時輸入gcc –-version酿愧,出來的結(jié)果是4.7.3沥潭。

3、最后我們下載 ncl_ncarg-6.3.0.Linux_Debian7.8_x86_64_nodap_gcc472.tar.gz這個版本就ok了寓娩,完全符合要求

這里寫圖片描述
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三叛氨、NCL安裝

這里基本按照前文給出的NCL官網(wǎng)指導(dǎo)來做。
1棘伴、終端中輸入:

mkdir /usr/local/ncl-6.3.0

表示在/usr/local/目錄下新建一個名為ncl-6.3.0的文件夾寞埠。ncl壓縮包(這里指ncl_ncarg-6.3.0.Linux_Debian7.8_x86_64_nodap_gcc472.tar.gz)拷貝入該文件夾中。注意焊夸,usr文件夾為只讀仁连,因此在圖形界面上不好操作,需要在終端中進行阱穗,例如將壓縮包從home文件夾(我放在了home中饭冬,如果在其他文件夾要修改路徑)中移動到/usr/local/ncl-6.1.2文件夾中,可輸入:

mv /home/ncl_ncarg-6.3.0.Linux_Debian7.8_x86_64_nodap_gcc472.tar.gz /usr/local/ncl-6.3.0

接著輸入:

cd /usr/local/ncl-6.3.0

表示進入該文件夾揪阶。解壓剛剪切到該目錄中的壓縮包:

tar -zxvf ncl_ncarg-6.3.0.Linux_Debian7.8_x86_64_nodap_gcc472.tar.gz

接下來昌抠,是官網(wǎng)聲稱“Must”的一步:設(shè)置環(huán)境變量。輸入“cd”回到根目錄鲁僚,再輸入“l(fā)s -a”炊苫,查看給出的隱藏文件列表中以“.”開頭的文件裁厅,并按如下分類酌情處理:
From tcsh/csh (the file might be “.cshrc” or “.tcshrc”):

  setenv NCARG_ROOT /usr/local/ncl-6.1.2
  setenv PATH $NCARG_ROOT/bin:$PATH

From bash or ksh (the file might be “.bash_profile” or “.bashrc” or “.bash_profile”):

  export NCARG_ROOT=/usr/local/ncl-6.1.2
  export PATH=$NCARG_ROOT/bin:$PATH

From sh (the file might be “.bash_profile” or “.bashrc” or “.bash_profile”):

  NCARG_ROOT=/usr/local/ncl-6.1.2
  PATH=$NCARG_ROOT/bin:$PATH
  export NCARG_ROOT
  export PATH

筆者在列表中找到了“.bashrc”,因此適用第二種情況侨艾。注意执虹,官網(wǎng)沒有講清楚的是,在終端輸入這兩句命令是沒用的唠梨,重啟后再用NCL會提示“Command not found”袋励。我們要把這兩句寫入.bashrc文件中。因此我們要做的是輸入:

gedit ~/.bashrc

即在gedit(也可以使用vi)編輯器下將這兩句命令当叭,也就是

  export NCARG_ROOT=/usr/local/ncl-6.1.2
  export PATH=$NCARG_ROOT/bin:$PATH

加入到.bashrc文件中茬故,在文件末尾加入。
接下來要使環(huán)境變量生效蚁鳖,還需要在ubuntu終端執(zhí)行:

source .bashrc

此時NCL安裝完畢均牢,大功即將告成。官方提供了一個檢驗NCL是否安裝正確的方法才睹,即輸入:

  ng4ex gsun01n -clean

但這時仍可能報錯,提示缺少csh甘邀,還要再安裝csh(仍要聯(lián)網(wǎng)):

  sudo apt-get install csh

完成琅攘!再輸入ng4ex命令,畫出圖形松邪,如下圖坞琴,點擊鼠標(biāo)的話幾個圖形陸續(xù)演示,說明安裝成功逗抑。

這里寫圖片描述
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注:因為Ncl版本不同剧辐,本人在最后遇到ncl: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory錯誤,該錯誤的意思是缺少libgfortran3的安裝.
只要在最后輸入

sudo apt-get install libgfortran3  

即可邮府。

參考文章:Ubuntu12.04下安裝NCL6.1.2過程(轉(zhuǎn))

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