一、Miniconda是什么邢疙?
Miniconda是一款生信相關(guān)的應(yīng)用商店庇勃。
二、Miniconda的安裝
1脊阴、安裝前首先在xshell中使用uname -a
命令查看服務(wù)器是多少位的
2握侧、cd biosoft
進(jìn)入昨天建立的目錄
3、wget
加鏈接下載
4嘿期、source ~/.bashrc
激活
5品擎、conda
出現(xiàn)很多信息證明激活成功
6、添加鏡像
# 使用清華鏡像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
三备徐、Miniconda的使用
1萄传、conda list
查看軟件列表
2、conda search
搜索軟件
3蜜猾、conda install fastqc -y
安裝軟件
4秀菱、conda remove fastqc -y
卸載軟件
5、conda info --envs
查看環(huán)境