看到很多公司招人的目的是幫助他們構(gòu)建分析流程寂屏,另一方面织咧,之前的自己的腳本也挺混亂的剃执,有必要整理,于是最近開始看了流程構(gòu)建工具雅任,于是有了這個文集风范。
在流程構(gòu)建的工具中,snakemake應(yīng)該是最出名的沪么。不過乌企,我偶然看到了nextflow,感覺它的生態(tài)不錯成玫,同時加酵,我搜索了一下拳喻,nextflow的中文教程感覺不夠系統(tǒng),基本都是git clone一個nf-core的數(shù)據(jù)猪腕,展示一下冗澈,感覺對于小白來說并不友好。另外一個問題是陋葡,維護(hù)nextflow的是一個歐洲的lab亚亲,其官方文檔的英語讀起來感覺味道不是很對,因此腐缤,我打算官方的文檔翻譯成中文捌归,方便更多人學(xué)習(xí)。同時也記錄一下自己遇到的問題岭粤。
挖個坑惜索,后續(xù)想看看snakemake有沒有比較系統(tǒng)的中文教程,如果沒有的話剃浇,自己也學(xué)一下巾兆,然后整合到這里來。