學(xué)習(xí)小組Day6--孫大雅

對(duì)待R要高冷,拒絕可以拒絕的一切

1.高級(jí)的鏡像設(shè)置

不想每次打開(kāi)Rstudio都要運(yùn)行一遍鏡像配置嗽上,就需要用到R的配置文件.Rprofile

  • 首先用file.edit()來(lái)編輯文件:
    file.edit('~/.Rprofile')
  • 然后在其中添加好options代碼
# options函數(shù)就是設(shè)置R運(yùn)行過(guò)程中的一些選項(xiàng)設(shè)置
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #對(duì)應(yīng)清華源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #對(duì)應(yīng)中科大源
# 當(dāng)然可以換成其他地區(qū)的鏡像
  • 最后保存然后重啟Rstudio
    再運(yùn)行一下:
    options()$repos
    options()$BioC_mirror
    發(fā)現(xiàn)已經(jīng)配置好了办绝,省了手動(dòng)運(yùn)行的步驟

2.R包安裝

  • 第一種:CRAN網(wǎng)站
    install.packages(“”)
  • 第二種:Bioconductor網(wǎng)站
    BiocManager::install(“”)

3.R包加載

  • 兩者均可
    library()
    require()

(總結(jié))4.安裝加載三部曲:("dplyr")為例

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") 
install.packages("dplyr")
library(dplyr)

5.dplyr五個(gè)基礎(chǔ)函數(shù)

(示例數(shù)據(jù):test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),])

(1)新增列

mutate(變量,新增列名=新增內(nèi)容)

(2)篩選列

select(變量,篩選條件)

(3)篩選行

filter(變量,篩選條件)

(4)排序

  • 按某1列或某幾列對(duì)整個(gè)表格進(jìn)行排序
    arrange(變量,篩選條件)

(5)匯總

summarise(變量,篩選條件)

  • 結(jié)合group_by伊约,根據(jù)分組再匯總分析


6.dplyr兩個(gè)實(shí)用技能

(1)管道操作

  • %>% :向右操作符
    把左側(cè)準(zhǔn)備的數(shù)據(jù)或表達(dá)式姚淆,傳遞給右側(cè)的函數(shù)調(diào)用或表達(dá)式進(jìn)行運(yùn)行孕蝉,可以連續(xù)操作就像一個(gè)鏈條一樣
    %>%
    (cmd/ctr + shift + M)
    -所以上述的一串代碼可以變成簡(jiǎn)單的一串

(2)統(tǒng)計(jì)某列的unique值:count

count(變量,篩選條件)

7.dplyr處理關(guān)系數(shù)據(jù)

注意:2個(gè)表進(jìn)行連接,不要引入factor
載入數(shù)據(jù):

88.pn

(1)內(nèi)連腌逢,取交集

inner_join

(2)左連

left_join

(3)全連接

full_join

(4)半連接

  • 返回能夠與y表匹配的x表所有記錄
    semi_join

(5)反連接

  • 返回?zé)o法與y表匹配的x表的所記錄
    anti_join

(6)簡(jiǎn)單合并

  • 相當(dāng)于base包里的cbind()函數(shù)和rbind()函數(shù)
  • bind_rows()
    需要兩個(gè)表格列數(shù)相同
  • bind_cols()
    需要兩個(gè)數(shù)據(jù)框有相同的行數(shù)

下面進(jìn)行操作:
先準(zhǔn)備數(shù)據(jù)


再操作:



最后的最后:
今日的思維導(dǎo)圖:


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