因?yàn)橹翱偸强吹交蛐酒坛冢恢辈恢肋@是個(gè)什么東西响迂。就花了半個(gè)下午時(shí)間仔細(xì)研究了一下，做了一點(diǎn)筆記细疚。
特別不嚴(yán)謹(jǐn)?shù)慕忉專夯蛐酒褪前言S多不同的探針按照一定的順序固定在固相載體上蔗彤，然后把樣本（經(jīng)過(guò)熒光標(biāo)記）倒上去雜交。雜交過(guò)后把未雜交的樣本洗掉疯兼，這樣就可以通過(guò)熒光的強(qiáng)度來(lái)半定量地得知每種探針對(duì)應(yīng)的基因的表達(dá)情況了然遏。
芯片的類型
- cDNA芯片（cDNA微陣列）
- Oligo芯片（寡聚核苷酸微陣列）
- 原位合成芯片
cDNA芯片（cDNA微陣列）
- 探針是cDNA
- 不同的cDNA長(zhǎng)短什么的都不一樣，雜交條件都不一致吧彪，所以雜交的時(shí)候誤差巨大待侵，克隆cDNA又非常麻煩，所以現(xiàn)在已經(jīng)基本淘汰了
Oligo芯片（寡聚核苷酸微陣列）
- 探針是人工設(shè)計(jì)的寡核苷酸
- 探針很貴姨裸，做得少不劃算秧倾，但做得多了芯片又是有保質(zhì)期的（寡聚核苷酸會(huì)降解）。甚至如果實(shí)驗(yàn)流程比較長(zhǎng)的話前后結(jié)果都會(huì)不一致
- （感覺就像你去工廠訂貨傀缩，人家開模費(fèi)用很高那先，雖然產(chǎn)品是做得越多越劃算，但有時(shí)候你自己用不了這么多赡艰，碰巧這種產(chǎn)品保質(zhì)期還很短售淡，這個(gè)時(shí)候就非常尷尬了）
原位合成芯片
- 探針是人工設(shè)計(jì)的寡核苷酸，但Oligo芯片是人工合成好探針慷垮，然后噴到基質(zhì)上去的揖闸，原位合成芯片是直接在基質(zhì)上合成探針的
- 均一性好，成本低
單通道和雙通道
- 單通道就是一套探針對(duì)一個(gè)樣本料身，結(jié)果就是基因的表達(dá)水平
- 雙通道就是一套探針對(duì)兩個(gè)樣本（標(biāo)記方法不同汤纸，競(jìng)爭(zhēng)雜交），結(jié)果是兩個(gè)樣本中同一基因的表達(dá)水平的差別（上調(diào)/下調(diào)）
- （我覺得不嚴(yán)謹(jǐn)?shù)卣f(shuō)惯驼，單通道和雙通道大概可以看做絕對(duì)量和相對(duì)量的差別吧）
芯片品牌
- Illumina
- Agilent
- Affymetrix
參考
- https://www.dxy.cn/bbs/newweb/pc/post/9162351
- http://muchong.com/t-9014981-1-authorid-2003142
- Bednár M. DNA microarray technology and application. Med Sci Monit. 2000 Jul-Aug;6(4):796-800. PMID: 11208413.
- https://www.biomart.cn/experiment/430/590/597/47439.htm
