本次分享一篇利用GEO镰踏、TCGA數(shù)據(jù)挖掘發(fā)了4.7 分SCI論文,論文發(fā)表在lung cancer?上沙合,該期刊影響因子:4.7奠伪,屬于非OA期刊,難度可以堪比5-8分的OA期刊灌诅,這種專(zhuān)業(yè)的非OA期刊都是有固定發(fā)文量的芳来,純生信數(shù)據(jù)挖掘可以發(fā)在這樣的期刊說(shuō)明是非常棒的。
文章題目:Identification of a novel gene expression signature associated with overall survival in patients with lung adenocarcinoma: A comprehensive analysis based on TCGA and GEO databases(DOI: 10.1016/j.lungcan.2020.09.014)
文章的分析內(nèi)容都是常規(guī)TCGA數(shù)據(jù)差異分析篩選差異基因猜拾、GO即舌、KEGG富集分析、單因素Cox回歸分析挎袜、多因素Cox回歸分析顽聂、計(jì)算風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分、生存分析盯仪,所有的圖形都很一般紊搪,沒(méi)有特別漂亮的。
像這種常規(guī)沒(méi)有結(jié)合任何研究熱點(diǎn)的GEO+TCGA數(shù)據(jù)挖掘全景,1-3分OA期刊的SCI滿天飛耀石,而偏偏這篇純生信數(shù)據(jù)挖掘可以發(fā)在4.7分的非OA期刊。為什么要強(qiáng)調(diào)非OA爸黄?因?yàn)镺A期刊發(fā)文量大滞伟,容易被認(rèn)為在“灌水”。有三十幾個(gè)OA期刊被個(gè)別有名氣的單位列入經(jīng)費(fèi)不予支持與鼓勵(lì)的名單炕贵,其中就包含一個(gè)8分多的OA期刊梆奈。同時(shí)一些基金評(píng)審專(zhuān)家可能對(duì)一些聲譽(yù)不好的OA期刊反感,特別是在名單內(nèi)的期刊称开。
這篇文章之所以能發(fā)表在一個(gè)4.7分的非OA期刊亩钟,主要是因?yàn)橄旅孢@些亮點(diǎn)之處:
1乓梨、常規(guī)差異分析都是tumor比上normal,但是作者進(jìn)行創(chuàng)新:early stage 比上normal清酥,advanced stage 比上early stage
2扶镀、多因素Cox回歸的結(jié)果非常好
3、有多套GEO數(shù)據(jù)進(jìn)行獨(dú)立驗(yàn)證模型总处,并且驗(yàn)證結(jié)果都非常好
4狈惫、遇上對(duì)的審稿人(也不能百分百排除運(yùn)氣成分)