Western Blot(WB)胳螟,蛋白免疫印跡法昔馋,一句話,定性糖耸、定量檢測蛋白表達的一種經(jīng)典秘遏、有效的技術(shù)方法。
將電泳分離的細胞或組織蛋白轉(zhuǎn)移到PVDF膜上嘉竟,用特定抗體結(jié)合蛋白抗原邦危,再結(jié)合標記的二抗,以化學發(fā)光的方式可視化地將蛋白表達情況呈現(xiàn)在人們面前舍扰,是幾乎每一位生物汪或科研汪的“必懷利器”倦蚪。Western Blot的Protocol那么多,然鵝边苹,沒有一款是適合你自己的陵且。辛辛苦苦做了兩天,還不包括前期的細胞培養(yǎng)个束、蛋白提取等等慕购,顯影結(jié)果一現(xiàn),立馬想哭暈在廁所播急,我的小心臟啊......
我也經(jīng)歷了不分晝夜的虐心歷程,為了得到一條滿意的條帶售睹,潛心做Western Blot一月余桩警,有時在暗室(浸泡在老鼠味兒和飼料味兒中)一連曝光兩個小時,出來后連午飯都不想吃了昌妹,終于捶枢,終于,終于飞崖,喜極而泣袄檬濉!
先上幾幅我做的Western Blot結(jié)果:
引用一位師兄的話:“跑的Western跟磚一樣”」掏幔現(xiàn)將個人做Western的心得體會分享給大家蒜鸡。
實驗虐我千百遍胯努,我待實驗如初戀
言歸正傳,做好Western需要注意各種細節(jié)逢防。工欲善其事叶沛,必先利其器嫉称,首先還是從蛋白提取開始談起答姥。
壹:蛋白提取
一减细、細胞蛋白的提取
1.收樣前3min先配制細胞裂解液(現(xiàn)配現(xiàn)用)盈滴,RIPA:蛋白酶抑制劑:磷酸酶抑制劑=99:1:1渣触。6孔板收集蛋白每孔需200ul川无,計算用量拒炎。以收集六孔蛋白為例孤钦,按比例加入RIPA 1200ul悦昵,蛋白酶抑制劑12ul肴茄,磷酸酶抑制劑12ul,混勻后置于冰上旱捧。(我使用的試劑RIPA裂解液(中)独郎,蛋白酶抑制劑混合物(100×),蛋白磷酸酶抑制劑混合物(100×)均購自康為世紀公司)
2.棄掉舊的培養(yǎng)基枚赡,PBS洗三遍氓癌。
3.每孔加入200ul剛配好的裂解液,立即置于冰上贫橙,在搖床上裂解30min贪婉。
4. 30min后在冰上將6孔板中的細胞收集至EP管中(盡可能多地刮掉細胞)。
5. 14000g卢肃,15min(4℃)離心疲迂,取上清于EP管中即為提取的蛋白(最好用進口Axygen EP管,后文解釋原因)莫湘。
注:2~4步也可先用胰酶收集細胞尤蒿,離心,PBS洗三次幅垮,再向EP管中加入裂解液腰池,置于冰上搖床裂解30min。我也嘗試過這種方法忙芒,相比而言示弓,上一種方法簡便并節(jié)約時間,但可能會損失一些細胞呵萨,可根據(jù)實際情況選擇奏属。
二、組織蛋白的提取
(全程在冰上操作)
1.將動物組織(腦潮峦、肺等)取出后分裝成三份或更多(一份WB囱皿,一份qPCR勇婴,一份備用),取出后立即存于-80℃铆帽。(注:取完一塊組織后立即凍存于-80℃咆耿,反復凍存樣品對待測蛋白有影響,最好用新鮮樣品實驗)
2.配制細胞裂解液(現(xiàn)配現(xiàn)用)爹橱,組織:RIPA=1mg:10ul萨螺,可根據(jù)實際情況調(diào)整。RIPA:蛋白酶抑制劑:磷酸酶抑制劑=99:1:1愧驱。配好后置于冰上慰技。
3.將其中一份組織剪下約90mg于有鋼珠的震蕩勻漿器中勻漿。此勻漿器的蓋子或芯通常置于-20℃组砚,使用時取出吻商,操作應快捷,勻漿1min基本可保持溫度糟红。
4.將勻漿加入90ul現(xiàn)配的裂解液中艾帐,冰上搖床裂解30min。
5. 14000g盆偿,15min(4℃)離心柒爸,取上清于Axygen EP管中即為提取的蛋白。
貳:蛋白濃度測定
我采用的是康為世紀公司的BCA蛋白定量試劑盒測定提取蛋白濃度事扭,和說明書protocol差別不大捎稚,稍有不同,如下:
1.稀釋BSA標準品以制作標準曲線:取7支EP管求橄,每管加30ul生理鹽水今野,第一管加30ulBSA,混勻后再取30ul至第二管罐农,依次倍比稀釋条霜,最后一管不加為空白(即本底值)。則8個標準品的濃度分別為2ug/ul涵亏、1ug/ul宰睡、0.5ug/ul、0.25ug/ul溯乒、0.125ug/ul夹厌、0.0625ug/ul豹爹、0.03125ug/ul裆悄、0。
2. 5倍稀釋樣品蛋白:取六支EP管(6個樣品)臂聋,各管加40ul NS光稼,再分別取10ul樣品在各管中稀釋或南。
3.將8個標準品和稀釋待測樣品各加25ul于96孔板中。
4.配制BCA工作液:每個樣品做2個重復艾君,再加上8個標準品采够,一共20個孔,按22個孔算冰垄,以防加樣損失蹬癌。則需A液:200ul×22=4400ul,B液:4400ul/50=88ul虹茶,計算好所需體積后在一干凈試管中將A逝薪、B工作液混勻。
6.混勻后立即向各孔中加入200ul配制的BCA工作液蝴罪,37℃孵育30min董济。
7.酶標儀562nm下測定各樣品和BSA標準品的吸光度值,作出標準曲線要门,計算出待測樣品的濃度虏肾。
8.根據(jù)各樣品濃度計算1×loading buffer體積,將各樣品濃度調(diào)為一致欢搜;并計算5×loading buffer的體積封豪,加入各管中】癯玻混勻后沸水煮15min撑毛,冰上分裝,存于-20℃唧领。
Tips
1.前面提到收集蛋白于進口Axygen EP管中藻雌,是為了防止煮沸蛋白時EP管蓋子彈開,液體濺出而改變蛋白濃度斩个。
2.關(guān)于分裝體積胯杭,我提取的細胞蛋白調(diào)整濃度后約為1.5ug/ul,每次電泳上樣20ul受啥,所以分裝體積每管50ul做个,一次或兩次電泳即可用完,避免反復凍融滚局。
叁:Western Blot
一居暖、WB所需試劑
可提前配制:
1. 10×電泳緩沖液:
配制250ml 10×電泳液作為母液,依次稱取Tris 7.5g藤肢,甘氨酸36g太闺,SDS 2.5g,加雙蒸水至250ml嘁圈,常溫保存省骂。使用時用蒸餾水稀釋至1×蟀淮。
2. 1×電轉(zhuǎn)液:
配制500ml 1×電泳液,依次稱取Tris 2.9g钞澳,甘氨酸1.45g怠惶,SDS 0.185g,加雙蒸水400ml轧粟,待都溶解后再加入100ml甲醇策治,常溫保存。
配制的電泳液和電轉(zhuǎn)液可供多次Western使用兰吟。
注意:1.最后加入甲醇览妖,若先加甲醇,Tris揽祥、甘氨酸和SDS不易溶解讽膏。
2.溶解較慢時可用磁力攪拌器加快溶解。
現(xiàn)配現(xiàn)用:
分離膠拄丰、濃縮膠府树、5% BSA溶液(w/v)、5%牛奶(w/v)料按、1×TBST洗液奄侠、一抗和二抗,在WB步驟中詳細介紹载矿。
二垄潮、WB protocol
(一)清洗玻板和小燒杯:
戴好口罩和手套,選用1.0mm玻板闷盔,用試管刷和洗潔精仔細刷洗玻板弯洗,清水沖洗干凈》旯矗卡槽對齊卡好后置于軟橡膠墊片上牡整,夾緊,向板中加滿蒸餾水試板子是否漏液溺拱。觀察幾分鐘后若不漏液逃贝,將板子中水倒出,倒扣晾干迫摔。
(二)配膠:
1.配制8ml 10%分離膠沐扳,依次向小燒杯中加入蒸餾水3.04ml,30%丙烯酰胺2.7ml句占,1.5M?pH8.8 2.0ml沪摄,10%SDS 80ul,10%AP 80ul,TEMED 3.2ul卓起。加入TEMED混勻后立即灌膠,用1ml槍頭沿著玻板上沿從左至右輕輕將膠打入凹炸,以免膠濃度不均勻戏阅,避免氣泡產(chǎn)生。加完后換200ml槍頭從左至右更加小心加入蒸餾水水封啤它,以免沖散剛灌的分離膠奕筐。靜置,當水和膠之間出現(xiàn)一條水平的折線時变骡,即已凝固离赫。
2.待分離膠凝固后,將水封的蒸餾水倒出塌碌,可將濾紙條放于玻板角吸水加快殘留水流出渊胸,倒置。配制4ml 5%分離膠台妆,依次向小燒杯中加入蒸餾水2.7ml翎猛,30%丙烯酰胺670ml,0.5M?pH8.8 500ul接剩,10%SDS 40ul切厘,10%AP 40ul,TEMED 4ul懊缺。加入TEMED混勻后立即灌膠疫稿,同上用1ml槍頭從左至右輕輕加入濃縮膠,加滿后沖洗10孔梳子鹃两,水平輕輕插入濃縮膠中靜置待其凝固遗座。可將剩余的濃縮膠沿著梳子加入玻板中以完全密封俊扳。
3.此時员萍,可將之前分裝好的煮過的加入loading buffer的蛋白樣品、預染的蛋白maker 和一小支loading buffer 置于4℃融化拣度。
Little Trick
1.AP和TEMED均為神經(jīng)毒性碎绎、致癌物質(zhì),使用時需小心抗果。
2.灌膠時視線與膠面水平筋帖,注意操作,避免膠濺入眼睛中冤馏。
在一個月黑風高的夜晚日麸,北京時間22:00,我獨自一人在空蕩蕩的實驗室中配膠,剛好使用了一個槍頭口有問題的1ml藍槍頭代箭。說時遲那時快墩划,濃縮膠從槍頭口的小洞倏地噴到了我的眼睛中。我立即脫掉手套嗡综,洗干凈手乙帮,用大量清水沖洗眼睛,禱告眼睛別出什么問題极景。從此以后察净,每次灌膠我都戴上眼鏡。
3.常溫下半小時膠可凝固盼樟,若天氣寒冷或需加快凝固氢卡,可將其置于37℃孵箱中,15min左右即可凝固晨缴。
4.若第二天早上立即跑膠译秦,這樣就不耽誤午飯時間,可頭天晚上先把膠配好击碗,凝固后取下玻板诀浪,連夾子、梳子一同放入蒸餾水中延都,4℃過夜保存雷猪。
(三)電泳:
1.將玻板卡緊電泳槽中,先在內(nèi)槽加滿已配好的1×電轉(zhuǎn)液晰房,十幾分鐘后觀察是否漏液求摇,若漏液重新調(diào)整玻板,再次卡緊殊者,直至不漏液為止与境。否則,可能膠還沒跑完猖吴,電轉(zhuǎn)液就漏完了摔刁。
2.輕輕拔去梳子,第一孔加入5ul預染的蛋白maker 海蔽,2~7孔依次加入20ul待測蛋白樣品共屈,第8孔加入10ul提前融化的loading buffer。上樣時輕輕加入党窜,注意不要將樣品加入其他孔拗引,或加樣過快導致樣品溢出。
3.插好正負極幌衣,注意檢查正負極不能插反矾削。調(diào)節(jié)電壓至80V(濃縮膠),跑0.5h后;將電壓調(diào)至100V(分離膠)哼凯,約1.5h后欲间,maker分離明顯,在膠底部出現(xiàn)一條藍色的buffer條帶断部,此時電泳完畢猎贴。使用完在實驗儀器使用本上做好登記。
注意:避免藍色條帶跑出分離膠家坎,這樣有可能目的蛋白也已經(jīng)跑出,所以在分離膠底部出現(xiàn)一條整齊水平的藍色條帶時吝梅,即停止電泳虱疏。
Little Trick
1.電泳時插好正負極后,從電泳槽底會有小氣泡上升苏携,氣泡的數(shù)目和上升速率與電壓大小呈正比做瞪。若小氣泡和往常不太一樣,觀察幾分鐘后還是如此右冻,則需檢查是否加錯了電泳液装蓬,或者電泳液配制有誤。
2.一般濃縮膠80V 0.5h纱扭,分離膠100~120V 1~1.5h牍帚,具體跑膠電壓和時間與目的蛋白大小、實驗儀器和實驗室環(huán)境都有關(guān)乳蛾,需多次探索最佳條件暗赶。若目的蛋白較小,則盡量縮短跑膠時間肃叶,并及時觀察maker位置蹂随,避免目的蛋白跑出。我分別實驗了濃縮膠80V 0.5h因惭,80V 1h岳锁,分離膠120V 1.5h,120V 1h蹦魔,100V 1.5h激率,100V 1h,110V 1.5h勿决,110V 1h柱搜,結(jié)果顯示在本實驗室實驗儀器下,我的目的蛋白及內(nèi)參在濃縮膠80V 0.5h剥险,分離膠100V 1.5h條件下聪蘸,分離效果最好。在此條件下,我做了幾次重復實驗健爬,結(jié)果均一致控乾。因此,總結(jié)出本實驗室此目的蛋白的最佳電泳條件娜遵。
3.電泳的好壞直接影響到目的蛋白的顯影情況蜕衡,尤其時磷酸化目的蛋白的二聚體,若電泳條件優(yōu)化设拟,結(jié)果可清晰顯出蛋白表達情況慨仿。所以探索最佳電泳條件是決定勝負關(guān)鍵一步。
4.電泳快結(jié)束時即可準備轉(zhuǎn)膜所需的濾紙和PVDF膜纳胧,浸泡在電轉(zhuǎn)液中镰吆。建議在第一次WB后分別剪好不同大小的硬紙片,標好面積和孔數(shù)(即樣品數(shù))跑慕,存好以后隨時使用万皿。
5.WB中夾取PVDF膜最好使用平頭鑷子,并夾住膜左上角核行,可最大程度減小對膜上蛋白的損害牢硅。
(四)切膠:
電泳結(jié)束后,取出玻璃板芝雪,稍微沖洗减余,洗凈電泳槽,放好惩系。輕輕撬開玻璃板佳励,根據(jù)maker位置和目的蛋白分子量大小在玻璃板上切膠,為了防止切歪蛆挫,可在玻璃板下墊上上述剪好的同切膠大小一致的硬紙片赃承。一般一塊膠需切下目的蛋白和內(nèi)參兩小塊膠,將切下的膠分別浸泡在電轉(zhuǎn)液中悴侵。
(五)轉(zhuǎn)膜:
1.根據(jù)每一塊切膠的大小剪6張同樣大小的濾紙和一張PVDF膜瞧剖,浸泡于電轉(zhuǎn)液中,可以提前準備好的硬紙片為模板剪可免。PVDF膜先經(jīng)甲醇活化20s后浸泡于電轉(zhuǎn)液中抓于。
2.在電轉(zhuǎn)儀上制作“三明治”結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)移膜,最下面放三層濾紙浇借,然后依次放PVDF膜捉撮,膠,三層濾紙妇垢,用玻璃棒輕輕趕走氣泡(注意上下三層濾紙之間不能接觸巾遭,否則易造成短路)肉康。蓋上蓋子,根據(jù)膜的總面積調(diào)整電流灼舍,電轉(zhuǎn)2h吼和。
3.在電轉(zhuǎn)的同時,可以配制以下液體骑素,事先根據(jù)膜的數(shù)量計算好所需體積:
以一塊膜為例炫乓,封閉5ml+稀釋一抗4ml+稀釋二抗4ml,需要13ml献丑,則配制15ml末捣。
5% BSA溶液(w/v):配制15ml 5% BSA溶液(w/v),稱取0.75g BSA晶體创橄,溶于15mlTBST中箩做,漩渦振蕩器混勻,現(xiàn)用現(xiàn)配筐摘,4℃保存(若目的蛋白為磷酸化蛋白時配制)卒茬。
5%牛奶(w/v):配制15ml 5%牛奶(w/v)船老,稱取0.75g脫脂奶粉咖熟,溶于15ml TBST中,漩渦振蕩器混勻柳畔,現(xiàn)用現(xiàn)配馍管,4℃保存。
1×TBST洗液:使用時將100×TBST用雙蒸水稀釋至1×薪韩,常溫保存确沸。
Little Trick
1.關(guān)于電轉(zhuǎn)膜,有些使用NC膜俘陷。我沒有嘗試過NC膜罗捎,但隔壁實驗室使用NC膜多次WB結(jié)果仍不理想,換用PVDF膜后有所改善拉盾。因此建議還是使用PVDF膜桨菜,可購買Millipore的PVDF膜,一卷有些貴捉偏,但是可以夠一個實驗室用好幾年哪倒得。最好不要在經(jīng)銷商購買分裝的的PVDF膜,另一實驗室一同學想著價格便宜也就只做幾次夭禽,就從試劑公司只買了100cm2的膜霞掺,結(jié)果這價格虛高不說,而且膜還是假的讹躯,直到做完實驗了才發(fā)現(xiàn)菩彬,蛋白樣品也浪費了缠劝。所以建議還是購買Millipore公司原裝的PVDF膜。
2.關(guān)于電轉(zhuǎn)方式挤巡,有些采用濕轉(zhuǎn)剩彬,有些采用半干轉(zhuǎn),兩種方式均可矿卑。個人覺得半干轉(zhuǎn)方便簡捷些喉恋。
(六)封閉:
1.電轉(zhuǎn)結(jié)束后,根據(jù)maker位置和目的蛋白及內(nèi)參大小剪膜母廷∏岷冢可在標有maker的一邊左上角剪一個小角,以清楚哪一條帶是1號樣品琴昆。
2.分別用已配好的5% BSA和5%牛奶封閉目的蛋白和內(nèi)參氓鄙,室溫搖床上孵育2h。根據(jù)盒子大小业舍,加入封閉液的量需沒過膜抖拦。
(七)孵育一抗:
1.配制p-STAT1一抗(SAB公司),1:500稀釋舷暮,加入上述配制的5% BSA 4ml态罪,再加入8ul p-STAT1一抗,混勻下面,現(xiàn)配現(xiàn)用复颈。
配制actin一抗(康為世紀公司),1:2000稀釋沥割,加入上述配制的5%牛奶4ml耗啦,再加入2ul actin一抗,混勻机杜,現(xiàn)配現(xiàn)用帜讲。
2.將PVDF膜從封閉液中取出,可用平頭鑷子小心放入塑料手套的手指中椒拗,加入一抗似将,封口,使膜完全浸泡在一抗中陡叠,放入冰箱玩郊,4℃過夜。我一般用封口膜做成小盒枉阵,置于大玻璃平皿中译红,放入PVDF膜,用槍從上到下向膜上加一抗兴溜,完全浸沒侦厚,之后和PCR上樣儀一同固定在搖床上耻陕,4℃孵育過夜。
(八)次日刨沦,回收一抗诗宣,做好標記,-20℃保存想诅,可再使用3~4次召庞。將膜放入1×TBST中,搖床上清洗三次来破,每次10min篮灼。
(九)孵育二抗:
1.配制具有種屬特異性的HRP標記的二抗(抗鼠或抗兔),1:2000稀釋徘禁,加入上述配制的5%牛奶4ml诅诱,再加入2ul 二抗,混勻送朱,現(xiàn)配現(xiàn)用娘荡。
2.TBST洗完膜后,加入二抗驶沼,室溫搖床上孵育2h炮沐。
(十)顯影:
1.二抗孵育完后,回收商乎,-20℃保存央拖。1×TBST搖床上洗膜三次祭阀,每次10min鹉戚。
2.一條目的蛋白即一張膜需要100ul發(fā)光液A和100ul發(fā)光液B,根據(jù)膜數(shù)計算用量专控,提前4℃混合好發(fā)光液A和B抹凳。
3.到暗室中加混合好的發(fā)光液,在膠片左上角剪一小角(和PVDF膜一致)伦腐,曝光膠片赢底,可分別不同時長曝光,如15s柏蘑,30s幸冻,1min,5min等咳焚,然后在顯影液和定影液中顯影洽损,放入自來水中。出暗室后革半,將膠片掛起晾干碑定。
也可用Bio-rad凝膠成像系統(tǒng)照相流码,選擇不同的曝光時間成像。
Little Trick1.需通過不同曝光時間探索某蛋白最佳曝光時間延刘,多次重復實驗即可采用此曝光時長漫试。我最開始也是在暗室中顯影,后來用Bio-rad凝膠成像系統(tǒng)照相碘赖,對比結(jié)果發(fā)現(xiàn)后者的結(jié)果更加清晰明顯驾荣,背景也更加干凈,之后就一直用成像儀曝光照相了普泡。
2.夾取膠片可用普通鑷子秘车,但也只夾膠片左上角,避免損害膠片上曝光的蛋白條帶劫哼。
3.膠片左上角maker一側(cè)一定要剪一小角或做其它標記叮趴,才可在顯影后明顯對應各個樣品。
4.若暗室曝光权烧,可能內(nèi)參蛋白發(fā)光液剛加上就出現(xiàn)很亮的條帶眯亦,這時最長曝光15s已經(jīng)足夠。
(十)膜重生:
若顯影效果不好般码,可將膜重生妻率,再次顯影,省去了配膠板祝、電泳和電轉(zhuǎn)等步驟宫静。
1.加4ml蛋白印跡膜再生液,室溫搖床30min券时。
2. 1×TBST洗3次孤里,每次10min。
3.5% BSA或5%牛奶封閉2h橘洞。
4.一抗4℃孵育過夜捌袜。
5.次日1×TBST洗三次,每次10min炸枣。
6.二抗孵育2h虏等。
7.1×TBST洗三次,每次10min适肠,曝光成像霍衫。
(本實驗室使用的100×TBST、二抗和白印跡膜再生液均購自康為世紀公司)
但是我實驗幾次膜重生后的結(jié)果并不理想侯养,所以還是乖乖從頭開始做WB敦跌。
Western Blot只是眾多科研技術(shù)方法中的滄海一粟,只要肯探索沸毁,肯總結(jié)峰髓,終會守得云開見月明傻寂。
真理本身就是不斷探索、不斷重復的過程携兵。
科研也就是一件幸福有意思的事疾掰,不是嗎?
最后
祝愿大家
都能跑出漂亮的條帶
都能擁有自己的“個性化Protocol”
都能年年發(fā)paper
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