OncoBase: a platform for decoding regulatory somatic mutations in human cancers
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筆記：
TCGA 滤灯、ICGC查库、COSMIC somatic突變
clinVar 臨床突變
QTL：eQTL hQTL mQTL dQTL
體細(xì)胞突變頻率？待逞？秃励？挡篓？
3DIV、EpiTensor、JEME庄蹋、4DGeneome、GeneHancer-------Loop
Tss -- enhancer Tss -- Tss enhancer -- enhancer
chormHMM 用隱馬模型25個狀態(tài)確定區(qū)域活性
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SELER (Super enhancer associated lncRNA directed transcriptional regulation in human cancer)
筆記：
1迷雪、SE轉(zhuǎn)錄的lncRNA調(diào)控下游基因（順式）
2限书、SE與LncRNA結(jié)合在細(xì)胞核內(nèi)作用調(diào)控下游基因（反式）
Triplexator軟件找到DNA綁定RNA
例如：SE與LncRNA結(jié)合
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文章思路很新穎 但是細(xì)節(jié)方面沒有創(chuàng)新，應(yīng)該在結(jié)合區(qū)域繼續(xù)探索發(fā)現(xiàn)結(jié)合區(qū)域上TF等調(diào)控元件
