今天主要學(xué)習(xí)以下主要內(nèi)容:
- 什么是linux衡瓶,什么是服務(wù)器?
- 為什么學(xué)生信要用linux剩瓶?
- 怎樣召喚linux--阿里云服務(wù)器
- 怎樣登錄服務(wù)器--xshell和terminal
- linux有哪些最基本的操作?
生信星球-公眾號(hào)
生信寶典linux常用命令
- pwd:列出當(dāng)前目錄的完整路徑辐脖,明確你在哪狭莱;
- cd :跳轉(zhuǎn)到其他目錄僵娃,兩個(gè)好用的cd命令,"cd -" 跳回最近一次的目錄腋妙,"cd .." 退回上一層目錄默怨;
- ls:列出當(dāng)前目錄內(nèi)容,最好加上 -l -rt 參數(shù)骤素,會(huì)更加清晰匙睹,目的是明確目錄下都有什么;
- mkdir:創(chuàng)建目錄济竹;
- rm:刪除文件或者目錄痕檬;
- mv:重命名文件或者目錄;
- cat:打開(kāi)文本文件规辱,內(nèi)容輸出到屏幕谆棺;
-less -SN:打開(kāi)文本文件,這個(gè)是查看文本文件更合適的方式罕袋;- head -n:查看文件前n行改淑;
- tail -n:查看文件尾n行;
- wc -l:計(jì)算文本文件的行數(shù)浴讯;
- ”|“: 管道操作朵夏;
- grep命令;
- awk命令榆纽;
- sed命令仰猖;
- sort命令;
- du -sh ./: 檢查當(dāng)前目錄所占空間大心巫选饥侵;
- bc -l:?jiǎn)?dòng)Terminal下的計(jì)算器,可以在這里進(jìn)行簡(jiǎn)單的數(shù)學(xué)運(yùn)算衣屏,輸入"quit"就可以退出躏升;
- chmod:修改文件或者目錄權(quán)限;
練習(xí):
學(xué)習(xí)linux如何安裝軟件:
了解conda--“l(fā)inux的應(yīng)用商店”
-
服務(wù)器下載精華版--miniconda(生信相關(guān))
- 百度/谷歌搜索“miniconda 清華”進(jìn)入:
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda - 用wget命令下載:復(fù)制的下載鏈接
- 百度/谷歌搜索“miniconda 清華”進(jìn)入:
-
安裝和配置miniconda
- ls命令得到“查詢(xún)結(jié)果”
- bash “查詢(xún)結(jié)果”
- 激活:
source ~/.bashrc
- 添加鏡像:
- conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
- conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
- conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
- conda config --set show_channel_urls yes
- 使用miniconda下載和卸載軟件
備注:學(xué)習(xí)自動(dòng)補(bǔ)全功能:打出cd+tab鍵狼忱,好用