一. R包的安裝
從生信技能樹的‘史上最貼心R包安裝示范視頻’https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247487157&idx=1&sn=0540a2788eba7b5a96a6d4f907d92718&chksm=9b484e0eac3fc71864f0e1d5959ac5f768bd3289312c2d0776cbe663a888edd056b092175d5c&scene=21#wechat_redirect中給出的的鏈接進去,并安裝缕贡。
生信0基礎(chǔ)第一步超陆,下載R和Rstudio并且安裝在自己的電腦上面。官網(wǎng)鏈接是
R: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/
RStudio:https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/#download
這個挺好的蟀俊,直接給出了推薦我下載的版本
后續(xù)的步驟就是按照軟件提示,一步一步來订雾。由于是mac就不存在用戶名是中文的問題肢预,哈哈哈
二. Rstudio的使用
然后就是輸入代碼畫圖啦
1.plot
R中創(chuàng)建散點圖的基礎(chǔ)函數(shù)是plot(x,y),其中x和y是數(shù)值型向量洼哎,代表圖型中的(x,y)點烫映。----摘自于《R語言實戰(zhàn)》
2. rnorm
rnorm() 函數(shù)會隨機正態(tài)分布,然后隨機抽樣 或者取值 n 次
rnorm(50) 應(yīng)該是指隨機抽樣或者取值50個噩峦。
3. runif
R語言生成均勻分布隨機數(shù)的函數(shù)是runif()
句法是:runif(n,min=0,max=1) n表示生成的隨機數(shù)數(shù)量锭沟,min表示均勻分布的下限,max表示均勻分布的上限识补;若省略參數(shù)min族淮、max,則默認生成[0,1]上的均勻分布隨機數(shù)。
例1:
runif(5,0,1) # 生成5個[0,1]的均勻分布的隨機數(shù)
[1] 0.5993 0.7391 0.2617 0.5077 0.7199
runif(5) # 默認生成5個[0,1]上的均勻分布隨機數(shù)
[1] 0.2784 0.7755 0.4107 0.8392 0.7455
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4.plot(rnorm(50))
應(yīng)該指隨機取50個數(shù)切油,并做成散點圖
5. boxplot(irisSpecies,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))廂線圖
iris是一個R語言自帶的數(shù)據(jù)框蝙斜,通常用作示例。iris$Sepal.Length表示iris數(shù)據(jù)框的Sepal.Length這一列數(shù)據(jù)澎胡。以此類推孕荠。
三. Rstudio基本操作
## 1.用Rproject管理工作目錄
所謂工作目錄就是默認的讀取和儲存位置娩鹉,也就是說,R語言只能和一個文件夾進行互動稚伍,這個文件夾非常重要弯予,做不好就會導(dǎo)致你的腳本、文件槐瑞、圖片各種亂跑熙涤,找不到。
查看這一篇困檩,養(yǎng)成好習(xí)慣:
https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA
## 2.顯示文件列表
相當(dāng)于linux的ls
## 3. 加減乘除
## 4.賦值
賦值符號用<-祠挫,這是小于號加上減號,也可以按Alt加上減號
## 5.刪除變量(這個不熟悉)
## 6.列出歷史命令
history()
##7.清空控制臺
快捷鍵ctrl+l
哈哈哈悼沿,今天的東西終于是我會一點點的了等舔,但是我之前好像下載的是R,不是Rstudio。但是還是學(xué)起來很有信心糟趾,加油慌植,繼續(xù)!
哦义郑,對了蝶柿,文章里的圖和文字有部分來源于生信星球公眾號。