科研最前沿 | 多組學技術揭示高級別膠質瘤的共同特征

期刊:Cancer Cell

IF:48.8 ?

發(fā)表時間:2024 Jul 8


文章簡介:

本研究通過整合單細胞轉錄組写烤、單細胞表觀組、蛋白質組學和代謝組等組學入录,探索了高級別膠質瘤(HGG)的多尺度信號傳導和腫瘤演變蜜笤,揭示了上游異質性改變匯聚到下游共同事件的機制点弯,強調了PTPN11信號在高級別膠質瘤中的核心作用嗤练。


樣本策略:

200名患者(212個GBM和16個IDH突變4級星形細胞瘤)的228個腫瘤樣本(包括28個復發(fā)腫瘤)以及18個正常大腦樣本和14個腦轉移樣本榛了,其中包括30例進行了單細胞測序的樣本。

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應用技術:

10x Genomics 3’scRNA-seq煞抬,10x Genomics Multiome霜大,WES,WGS革答,蛋白質組战坤、磷酸化蛋白質組和代謝組等。


研究亮點:

(1)揭示了代謝組和糖蛋白組數(shù)據(jù)中的驅動相互作用蝗碎,并識別了腫瘤復發(fā)的潛在標記物。

(2)發(fā)現(xiàn)TERTp旗扑、PTENTERTp/EGFR的變異產(chǎn)生了相似的分子特征蹦骑。

(3)PTPN11信號通路在HGG中扮演著關鍵角色,將EGFR臀防、PDGFR和IDH1等信號通路聯(lián)系到下游效應分子眠菇。

(4)異檸檬酸脫氫酶基因(IDH)突變的HGG具有較低的缺氧特征和降低的AMPKA活性。


研究意義:

這項研究在多層面擴展了我們對HGG腫瘤發(fā)展和演變的理解袱衷,并為開發(fā)新的治療方法提供了潛在的靶點捎废。


文獻原文(DOI):10.1016/j.ccell.2024.06.004


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