1. 創(chuàng)建文件夾
mkdir mamba
2.下降mamba文件
curl -L https://micro.mamba.pm/api/micromamba/linux-64/latest -o micromamba.tar.bz2
3. 解壓
tar -xvjf micromamba.tar.bz2
4.配置環(huán)境變量
./micromamba shell init -s bash -p /public/home/ypyue/mamba/
or
./micromamba shell init -s bash -p /public/home/ypyue/mamba/bin/
source .bashrc
5. 設(shè)置源箱残，將以下內(nèi)容保存到~/.mambarc 即可研乒。
channels:
- defaults
show_channel_urls: true
default_channels:
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2
custom_channels:
conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
pytorch-lts: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
補加兩個channel：
micromamba config append channels conda-forge
micromamba config append channels bioconda
創(chuàng)建環(huán)境 python=2.7 并安裝軟件
micromamba create -n ChIP-seq python=2.7
micromamba activate mamba/envs/ChIP-seq/
micromamba install fastp
打包conda環(huán)境
1. 用 conda-pack 打包環(huán)境 (pack 命令可以pip安裝)
conda pack -n R3.5 -o R35.1.tar.gz
2. 解壓環(huán)境
在env 目錄下創(chuàng)建一個目錄（直接mkdir創(chuàng)建不需要micromamba or conda 創(chuàng)建環(huán)境）乏盐，解壓這個打包的環(huán)境到一個指定的目錄：
mkdir R3.5
tar -xzvf ../../R35.1.tar.gz -C ./R3.5/
(R3.5) (base) [ypyue@login02 envs]$ ls
R3.5
3. 設(shè)置環(huán)境變量
在解壓后的環(huán)境中佳窑，運行 conda-unpack 來修正路徑：
pwd
/public/home/ypyue/mamba/envs #找出完整路徑
source /public/home/ypyue/mamba/envs/R3.5/bin/activate #激活環(huán)境
conda-unpack #修正路徑 非常重要不然報錯。
