PMID：33425212
發(fā)表雜志：Oxidative Medicine and Cellular Longevity
知識點(diǎn)
- Redox：氧化還原反應(yīng)枣抱，在腫瘤的進(jìn)展過程中作用顯著敢伸。作者在GSEA中所示redox相關(guān)的通路音婶，發(fā)現(xiàn)
GO_CELL_REDOX_HOMEOSTASIS和GO_RESPONSE_TO_REDOX_STATE滴肿，共兩個(gè)redox相關(guān)的基因集错蝴。 - Redox-Related lncRNAs：Redox相關(guān)的lncRNA一喘，設(shè)置標(biāo)準(zhǔn)：
Pearson Correlation Test, |Cor| > 0.5 and p.adj < 0.001. - DERRlncRNAs：Differentially Expressed Redox-Related lncRNAs (DERRlncRNAs)绒瘦，差異表達(dá)的lncRNAs,
|logFC| > 1 and FDR < 0.05. - 內(nèi)部驗(yàn)證：作者將TCGA-KIRC病人闭树，按照1:1比例，隨機(jī)分為training和testing組丰歌，構(gòu)建預(yù)后模型姨蟋。
摘要
作者提取差異表達(dá)的氧化還原反應(yīng)相關(guān)的lncRNA，構(gòu)建并內(nèi)部驗(yàn)證預(yù)后模型立帖，并分析不同風(fēng)險(xiǎn)評分的病理特征眼溶。
整體思路
亮點(diǎn)
- Redox相關(guān)lncRNA切入點(diǎn)比較新穎
結(jié)果
1.模型構(gòu)建
作者通過差異分析+unicox+lasso+multiCox篩選了9個(gè)redox相關(guān)的lncRNA，在訓(xùn)練集中構(gòu)建預(yù)后模型晓勇。
Fig.1
Table 2
模型基因互作關(guān)系
Fig.6
Fig.2
2.模型驗(yàn)證
選用TCGA的內(nèi)部數(shù)據(jù)集進(jìn)行驗(yàn)證
Fig.3
3.模型周邊
3.1 Nomgram+C-index
對構(gòu)建的模型堂飞，計(jì)算Nomgram和C-index
Fig.4
3.2 模型GSEA富集分析+臨床相關(guān)性
Fig.5
Fig.7
參考鏈接：
Development and Validation of a Nine-Redox-Related Long Noncoding RNA Signature in Renal Clear Cell Carcinoma
