【轉(zhuǎn)發(fā)】人類B細胞的基因功能評估:健康和腫瘤細胞中基于CRISPR/Cas9的基因編輯和基于mRNA的基因表達

B淋巴細胞亦可簡稱B細胞,是來源于骨髓(bone-marrow)的多能干細胞谚赎,所以稱為B細胞淫僻。其分化過程可分為前B細胞、不成熟B細胞壶唤、成熟B細胞雳灵、活化B細胞、漿細胞等五個階段闸盔。成熟的B細胞主要存在于淋巴結(jié)皮質(zhì)淺層和脾臟的紅髓和白髓的淋巴小結(jié)內(nèi)悯辙。B細胞在抗原刺激下可分化為漿細胞,漿細胞可合成和分泌抗體(免疫球蛋白)迎吵,主要執(zhí)行機體的體液免疫(humoralimmunity)躲撰。近年來,隨著生命科學和醫(yī)學行業(yè)的興起击费,人類對于疾病與健康更加關(guān)注拢蛋,對于直接關(guān)乎機體的免疫功能的B細胞而言,其研究愈加火熱蔫巩。

眾所周知谆棱,B細胞很難操縱快压,在靜息狀態(tài)下特別脆弱,這使得調(diào)節(jié)其基因內(nèi)源性表達或誘導轉(zhuǎn)基因過度表達變得非常困難垃瞧。人類B細胞可以通過使用病毒載體進行操縱蔫劣,然而該方法有諸多缺點。為了便于研究人類B細胞在健康和疾病環(huán)境中的基因功能个从,迫切需要穩(wěn)健的遺傳操作方案脉幢。近日,意大利錫耶納大學嗦锐,醫(yī)學嫌松、外科和神經(jīng)科學學院的 Federica Nardi和Laura Pezzella等人在European Journal of Immunology期刊上發(fā)表了題為Assessing gene function in human B cells: CRISPR/Cas9-based gene editing and mRNA-based gene expression in healthy and tumor cells 的技術(shù)報道類研究論文筹燕。在本研究中犁苏,作者建立了分別從健康人和血液病患者分離出的原代B細胞中進行高通量mRNA驅(qū)動的轉(zhuǎn)基因表達和基于CRISPR/Cas9的基因敲除流程∷露基于靜息狀態(tài)下的人體B細胞進行電穿孔實驗的穩(wěn)健操作方案菊值,克服了B細胞難操縱的障礙外驱,這將顯著加速B細胞研究的潛力。

mRNA在傳遞中作為質(zhì)粒轉(zhuǎn)染的一種無毒替代物腻窒,已應用于一系列脆弱的原代細胞昵宇。體外重組純化的Cas9和合成的sgRNA形成的核糖核蛋白(RNP)復合物的電穿孔是一種易于設計的CRISPR/Cas9基因編輯。

在本次實驗中儿子,研究人員使用NEPA21基因轉(zhuǎn)染系統(tǒng)對來源于健康人和血液病患者分離出的原代B細胞進行電穿孔實驗并將攜帶綠色熒光蛋白的mRNA導入到細胞內(nèi)瓦哎,用以觀察基因的表達和轉(zhuǎn)染效率。研究人員設置了12次電穿孔條件柔逼,最佳的條件使的在電轉(zhuǎn)后B細胞的存活率>90%蒋譬,mRNA的轉(zhuǎn)染效率>90%(圖1A–C)。解凍冷凍保存的B細胞也觀察到相似的電穿孔效率(>90%)愉适,但其細胞存活率稍低(85%)犯助,從而證實電穿孔條件與細胞冷凍保存條件相容。蛋白質(zhì)過度表達可以通過調(diào)節(jié)mRNA劑量輕松控制(圖1D)维咸,通常在電穿孔后96小時通過綠色熒光蛋白反應才能檢測到結(jié)果(圖1E)剂买。我們還檢測了通過尿苷-上半尿苷替代導致mRNA免疫原性降低的mRNA結(jié)構(gòu)的化學修飾是否會對B細胞轉(zhuǎn)染效率產(chǎn)生積極影響。然而癌蓖,我們沒有觀察到使用含尿苷的mRNA的顯著優(yōu)勢瞬哼。

隨著電轉(zhuǎn)技術(shù)在B細胞的應用與發(fā)展,研究人員建立了一條分子生物學實驗線租副,允許以高通量的方式過度表達編碼大量轉(zhuǎn)基因的mRNA坐慰。研究者們建立了一個5步法程序,以產(chǎn)生以96孔格式編碼任何給定轉(zhuǎn)基因的mRNA(圖1F)用僧。它包括(1)基因特異性引物的自動設計讨越,(2)從任何合適模板擴增轉(zhuǎn)基因的第一個PCR反應两残,(3)將純化的PCR產(chǎn)物Gibson連接到含有體外轉(zhuǎn)錄所需元素的修飾的dRNA2支架上[2]

(4) ,第二次PCR擴增與轉(zhuǎn)基因C末端的FLAG標簽融合的體外轉(zhuǎn)錄模板把跨,以及(5)mRNA的體外合成。這種方法可以快速沼死、廉價地生產(chǎn)出純化的mRNA為電穿孔做準備着逐。為了進行實驗驗證,可以通過使用抗Flag標簽抗體(圖1G)進行免疫印跡來方便地驗證轉(zhuǎn)基因過表達意蛀,經(jīng)驗證耸别,mRNA電穿孔B細胞可用于任何體外或體內(nèi)檢測。

圖1:人體B細胞中基于mRNA的轉(zhuǎn)基因過表達县钥。(A)B細胞電穿孔后的活力和轉(zhuǎn)染效率秀姐。用5μg GFP mRNA和100μL體積的B細胞進行電穿孔實驗,并在AIM-V中培養(yǎng)過夜若贮。最佳設置以黃色突出顯示省有。(B)流式細胞儀分析結(jié)果和(C)B細胞的活力和轉(zhuǎn)染效率,按最佳設置(n=6次實驗)進行谴麦。(D) 使用不同劑量的GFP mRNA進行B細胞電穿孔的示例蠢沿,顯示轉(zhuǎn)基因過度表達如何通過mRNA劑量進行微調(diào)。(E) 電穿孔后24和96小時mRNA電穿孔B細胞中綠色熒光蛋白信號的流式細胞術(shù)分析匾效。面板(D)和(E)是代表至少三個獨立實驗舷蟀。(F) 體外進行mRNA合成及擴增的工作流程。(G)體外mRNA的產(chǎn)生和免疫印跡的示例圖(IB)電穿孔后24小時面哼,在B細胞中檢測到的FLAG標記的轉(zhuǎn)基因野宜。

此外,為了開發(fā)B細胞中KO基因的管道魔策,研究人員優(yōu)化了培養(yǎng)實現(xiàn)穩(wěn)健的B細胞增殖的條件匈子,這是實現(xiàn)基于Cas9的基因編輯的高效性所必需的,對于活力和增殖能力低的B細胞(如CLL細胞)來說尤其具有挑戰(zhàn)性代乃。我們觀察到B細胞對細胞擁擠效應特別敏感旬牲,必須以不超過1—2×105個細胞/mL的密度進行電轉(zhuǎn)。在通過BCR搁吓、CD40和IL-4/IL-21刺激B細胞以及對培養(yǎng)物基中細胞板數(shù)的優(yōu)化原茅,使我們能夠在5-6天內(nèi)對所有測試樣本實現(xiàn)三到五輪細胞分裂。

為了通過CRISPR/Cas9方法建立B細胞KO基因的方案堕仔,如圖2A所示的流程擂橘。研究人員用較穩(wěn)定的聚谷氨酸RNPs電穿孔B細胞,并使其在電穿孔后5-6天內(nèi)增殖摩骨,這通常使我們在大量人群中獲得>70%的基因KO(圖2B和C)通贞。KO表型可在電穿孔后第3天觀察到朗若,并在B細胞內(nèi)擴增后進一步增強(圖2D和E)。靶向CD19基因被證明是有用的內(nèi)部控制昌罩,可通過流式細胞術(shù)進行簡單評估(圖2B)哭懈,而敲除細胞周期調(diào)節(jié)因子CDC5L(可導致B細胞分裂停滯)可作為B細胞增殖試驗的對照(圖2F)【ビ茫總之遣总,我們的結(jié)果表明,為了在靜息B細胞中實現(xiàn)CRISPR/Cas9高靶向效率轨功,有必要且足夠的使用優(yōu)化的電穿孔(NEPA21基因高效轉(zhuǎn)染系統(tǒng))條件來遞送Cas9 RNP旭斥,然后培養(yǎng)B細胞以誘導其增殖。

圖2:人體B細胞中基于Cas9 RNP的KO基因古涧。(A) 人體B細胞中基于CRISPR/Cas9的基因編輯工作流程垂券。(B) 代表性實驗和(C)顯示RNP切除后第5天B細胞表面受體CD19(n=10)或ILT3/LILRB4(n=6)KO的實驗總結(jié)。(D) 電穿孔后72小時和120小時羡滑,B細胞中CD19 KO的分析菇爪。(E)面板D中: CD19染色組織覆蓋情況。(F)CDC5L KO后阻斷B細胞增殖啄栓。數(shù)據(jù)點為平均值±SD娄帖。(D–F)所示數(shù)據(jù)代表五個(D,E)和三個(F)獨立實驗**p<0.01昙楚,****p<0.0001(Mann–Whitney檢驗)

?最后近速,為了使該方法適用于高通量篩選程序,研究者們建立了30 μL電穿孔體積的電穿孔條件堪旧,其中所有試劑和細胞數(shù)量按比例縮小削葱。這種方案降低了對細胞和試劑的消耗,同時實現(xiàn)基因過度表達和基因KO的高效率淳梦。因此析砸,本研究中的方法學流程闡明了一種可擴展的方法就是利用體外生產(chǎn)的mRNA或合成的靶向RNA序列評估不同來源的靜息人類B細胞的基因功能。該流程的優(yōu)點包括在不影響細胞的存活率和不需提前擴增的情況下爆袍,能夠以高通量方式評估人的原代B細胞中的基因功能首繁,并且可以直接在大量人群中進行應用。還提出了另一個工作流程陨囊,就是類似的方案也適應于其他電穿孔系統(tǒng)弦疮,并最終適應其他類型的脆弱原代免疫細胞。

論文鏈接

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/eji.202149784

參考文獻

1蜘醋、Nardi, F., Pezzella, L., Drago, R., Di Rita, A., Simoncelli, M., Marotta, G., Gozzetti, A., Bocchia, M. and Kabanova, A. (2022), Assessing gene function in human B cells: CRISPR/Cas9-based gene editing and mRNA-based gene expression in healthy and tumor cells. Eur. J. Immunol., 52: 1362-1365.?https://doi.org/10.1002/eji.202149784

2胁塞、 Vriens, K. et al., Nature. 2019. 566: 403–406.

3、B淋巴細胞_百度百科 (baidu.com)

-END-

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末啸罢,一起剝皮案震驚了整個濱河市编检,隨后出現(xiàn)的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌扰才,老刑警劉巖允懂,帶你破解...
    沈念sama閱讀 218,941評論 6 508
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現(xiàn)場離奇詭異衩匣,居然都是意外死亡累驮,警方通過查閱死者的電腦和手機,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 93,397評論 3 395
  • 文/潘曉璐 我一進店門舵揭,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來,“玉大人躁锡,你說我怎么就攤上這事午绳。” “怎么了映之?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 165,345評論 0 356
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵拦焚,是天一觀的道長。 經(jīng)常有香客問我杠输,道長赎败,這世上最難降的妖魔是什么? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 58,851評論 1 295
  • 正文 為了忘掉前任蠢甲,我火速辦了婚禮僵刮,結(jié)果婚禮上,老公的妹妹穿的比我還像新娘鹦牛。我一直安慰自己搞糕,他們只是感情好,可當我...
    茶點故事閱讀 67,868評論 6 392
  • 文/花漫 我一把揭開白布曼追。 她就那樣靜靜地躺著窍仰,像睡著了一般。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪礼殊。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上驹吮,一...
    開封第一講書人閱讀 51,688評論 1 305
  • 那天,我揣著相機與錄音晶伦,去河邊找鬼碟狞。 笑死,一個胖子當著我的面吹牛坝辫,可吹牛的內(nèi)容都是我干的篷就。 我是一名探鬼主播,決...
    沈念sama閱讀 40,414評論 3 418
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼竭业!你這毒婦竟也來了智润?” 一聲冷哼從身側(cè)響起,我...
    開封第一講書人閱讀 39,319評論 0 276
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤未辆,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎窟绷,沒想到半個月后,有當?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體咐柜,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 45,775評論 1 315
  • 正文 獨居荒郊野嶺守林人離奇死亡兼蜈,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點故事閱讀 37,945評論 3 336
  • 正文 我和宋清朗相戀三年,在試婚紗的時候發(fā)現(xiàn)自己被綠了拙友。 大學時的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片为狸。...
    茶點故事閱讀 40,096評論 1 350
  • 序言:一個原本活蹦亂跳的男人離奇死亡,死狀恐怖遗契,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出辐棒,到底是詐尸還是另有隱情,我是刑警寧澤牍蜂,帶...
    沈念sama閱讀 35,789評論 5 346
  • 正文 年R本政府宣布漾根,位于F島的核電站,受9級特大地震影響鲫竞,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏辐怕。R本人自食惡果不足惜,卻給世界環(huán)境...
    茶點故事閱讀 41,437評論 3 331
  • 文/蒙蒙 一从绘、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望寄疏。 院中可真熱鬧,春花似錦顶考、人聲如沸赁还。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 31,993評論 0 22
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽艘策。三九已至,卻和暖如春渊季,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間朋蔫,已是汗流浹背。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 33,107評論 1 271
  • 我被黑心中介騙來泰國打工却汉, 沒想到剛下飛機就差點兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留驯妄,地道東北人。 一個月前我還...
    沈念sama閱讀 48,308評論 3 372
  • 正文 我出身青樓合砂,卻偏偏與公主長得像青扔,于是被迫代替她去往敵國和親。 傳聞我的和親對象是個殘疾皇子,可洞房花燭夜當晚...
    茶點故事閱讀 45,037評論 2 355

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容