數(shù)據(jù)庫設計

  1. 病人信息表
  2. 樣品信息表
  3. 測序記錄表
  4. 基因位點表
  5. 變異信息表
  6. 測序變異表
  7. 套餐信息表
  8. 癌癥信息表
  9. 結(jié)構(gòu)變異信息
  10. 基因融合變異信息
  11. 藥物信息表
  12. 用藥信息表

分表字段及數(shù)據(jù)限制

病人信息表

  1. 姓名
  2. 年齡
  3. 性別
  4. ID
  5. 聯(lián)系電話
  6. 地址
  7. 醫(yī)院
  8. 醫(yī)生
  9. 原發(fā)癌癥 【外鍵】
  10. 分析套餐 【外鍵】

樣品信息表

  1. 采樣組織類型
  2. 采樣時間
  3. 樣品量
  4. 樣品單位
  5. 病人信息【外鍵】
  6. 備注

測序記錄表

  1. 測序ID
  2. OG ID
  3. CA-PM號
  4. R1
  5. R2
  6. 文件大小
  7. 樣品信息【外鍵】
  8. panel
  9. 測序時間(取測序read文件的最后修改時間)

基因位點表

  1. Chromesome
  2. Start
  3. End
  4. Ref
  5. 基因【外鍵】// 外鍵的目的是為了增加參照完整性約束总处,也可以不設定外鍵
  6. 最長轉(zhuǎn)錄組
  7. 外顯子編號

變異信息

  1. 基因位點【外鍵】
  2. Alt
  3. HGVS.c
  4. HGVS.p
  5. 突變類型
  6. rs number
  7. 千人基因組突變頻率
  8. 致病性預測(SIFT赂蠢,PolyPhen2等)

測序變異信息

  1. 測序記錄【外鍵】
  2. 變異信息 【外鍵】
  3. 突變頻率
  4. 測序深度
  5. 突變深度
  6. 分子標簽數(shù)

套餐信息表

  1. 套餐名稱
  2. 套餐價格
  3. 癌癥【外鍵】

套餐基因表

  1. 套餐ID【外鍵】
  2. 基因 【外鍵】

基因表

  1. 基因symbol
  2. 基因Entrez ID
  3. 基因ENSG ID
  4. 基因HGNC ID
  5. 基因全稱
  6. 基因詳細信息
  7. 備注

癌癥信息表

  1. 癌癥名稱
  2. 癌癥詳細信息
  3. ...更多信息

拷貝數(shù)變異表

  1. 基因 【外鍵】
  2. Start
  3. End
  4. 拷貝數(shù)
  5. 測序記錄【外鍵】

基因融合變異表

  1. 基因1【外鍵】
  2. Start1
  3. End1
  4. 基因2 【外鍵】
  5. Start2
  6. End2
  7. 測序記錄【外鍵】

藥物信息表

  1. 藥物中文名稱
  2. 藥物英文名稱
  3. 藥物批準文號
  4. 更多信息

藥物被批準用于哪些癌癥

  1. 藥物 【外鍵】
  2. 癌癥 【外鍵】

用藥信息表

  1. 變異【外鍵】
  2. 癌癥【外鍵】
  3. 藥物【外鍵】
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