Author: Zongwei Zhou | 周縱葦
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Wang H, Zhou Z, Li Y, et al. Comparison of machine learning methods for classifying mediastinal lymph node metastasis of non-small cell lung cancer from 18F-FDG PET/CT images[J]. 2017, 7.
參考文獻(xiàn).
- 周縱葦.基于深度學(xué)習(xí)的醫(yī)學(xué)影像分類識別.大連理工大學(xué)本科畢業(yè)論文.2016.6
1. 數(shù)據(jù)擴(kuò)充（MATLAB）
詳細(xì)解說：
MATLAB處理大量三維圖像，Data Augmentation
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CrossValidation.m
描述：主函數(shù)
實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)擴(kuò)充，交叉驗(yàn)證课兄，通過旋轉(zhuǎn)，平移變換六水，得到不同的2.5D數(shù)據(jù)。
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RotParGio.m
描述：子函數(shù)
輸入：3d圖像辣卒，沿x,y,z軸旋轉(zhuǎn)的角度掷贾，patch的尺寸。
輸出：2.5D的三個圖[slide_x, slide_y, slide_z]荣茫。
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iSaveX.m
描述：子函數(shù)
CrossValidation.m程序中用了MATLAB并行運(yùn)算想帅，而parfor中不能直接用save()函數(shù)，因此這兒定義一個函數(shù)作為過渡啡莉。
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Zscore.m
描述：主函數(shù)
數(shù)據(jù)Z-Score處理港准，可做可不做憎乙，每個通道的數(shù)據(jù)減去平均值，再除以標(biāo)準(zhǔn)差叉趣。經(jīng)驗(yàn)顯示Z-Score后在CNN中訓(xùn)練的效果好。
Z-Score：x=(x-mean(x))/std(x).
2. 卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)（Python）
詳細(xì)解說：
簡易的深度學(xué)習(xí)框架Keras代碼解析與應(yīng)用
深度學(xué)習(xí)框架Theano利用GPU加速
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cnn.py
描述：主函數(shù)
包含CNN網(wǎng)絡(luò)的訓(xùn)練该押，測試的全過程疗杉。
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data.py
描述：子函數(shù)
實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)讀入，輸出的是正負(fù)樣本等分后的訓(xùn)練集和測試集蚕礼。
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CNNsoftmax.py
描述：主函數(shù)
用SVM和RF代替softmax烟具。
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ROC_Matlab.py
描述：主函數(shù)
計算出置信度，存到文件中奠蹬，再用MATLAB函數(shù)畫ROC曲線朝聋。
