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能夠利用通量平衡分析和進(jìn)化算法進(jìn)行微生物菌種模擬郁稍。
建立基于約束的模型需要兩個層次的代謝信息烙心。
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M通常被定義為反應(yīng)物我抠。因此，當(dāng)通量為正時决记，代謝物M是系統(tǒng)的輸出摧冀，而當(dāng)通量為負(fù)時，代謝物M是系統(tǒng)的輸入系宫。
在圖中索昂，一個小的網(wǎng)絡(luò)被表示為(a)由在基于約束的模型中常用的各種組件組成，如代謝物扩借、基因椒惨、反應(yīng)和排水。相應(yīng)的穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)(b)潮罪、反應(yīng)邊界(c)和基因蛋白規(guī)則(d)被顯示出來康谆。
首先，需要用代謝化學(xué)計量法來記錄在一個感興趣的代謝網(wǎng)絡(luò)中發(fā)生的所有化學(xué)反應(yīng)嫉到。第二項是對代謝系統(tǒng)的需求信息沃暗。這些需求包括非生長相關(guān)的維持需求、生物量合成和營養(yǎng)輸入屯碴。
