11月7日 本地blast (二)

參考
http://blog.csdn.net/flyfrommath/article/details/52945586
http://blog.shenwei.me/local-blast-installation/

安裝blast軟件到服務(wù)器上

1.下載打包好的文件ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/

選擇一個你需要的

2.上傳到服務(wù)器上
使用scp命令


上傳中

3.解壓軟件

tar -zxvf ncbi-blast-2.7.1+-x64-linux.tar.gz

藍色這個文件是解壓好的

4.設(shè)置路徑魏滚,使得哪里都可以使用
我的服務(wù)器上是在自己目錄下面

cd
ls -all
vim .bash_profile

增加一行

export PATH=$PATH:/public/home/you/path/to/ncbi-blast-2.7.1+/bin

使其生效

source .bash_profile

OK镀首,檢查一下

blastn -version

出現(xiàn)這個說明裝好了

OK 鼠次,軟件裝好了,明天配置本地庫

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