文章簡介
微生物組的熱度已經(jīng)持續(xù)幾年了吼过,目前熱度依舊不減绪商,感覺腸道微生物是一個可以影響機(jī)體任何地方的東西骂束,有人稱它為第二大腦耳璧,有關(guān)它的研究也是出了不少CNS,好了展箱,不再感慨了旨枯,反正也不是小編發(fā)的,哈哈~~~本次小編介紹的文章題名為“長白豬和梅花豬結(jié)腸內(nèi)微生物及微生物代謝差異研究”混驰。
背景
長白豬是引進(jìn)的外國豬種攀隔,是瘦肉型豬種,梅花豬是中國本地豬栖榨,具有脂肪沉積多等特點(diǎn)昆汹,作者估計也就想探究腸道微生物對脂肪沉積的影響吧。
試驗動物
以7頭長白斷奶豬和7頭梅花斷奶豬為試驗對象婴栽,在相同的情況下飼喂30天满粗,然后屠宰,收集結(jié)腸內(nèi)容物進(jìn)行16S測序和代謝物的廣篩和后期的靶向篩選愚争,收集結(jié)腸粘膜進(jìn)行PCR定量分析映皆。
試驗設(shè)計
結(jié)果
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代謝組數(shù)據(jù)的PCA和OPLS-DA分析挤聘;發(fā)現(xiàn)相同品種的代謝物數(shù)據(jù)聚到一起,說明不同品種的樣本重復(fù)性較好捅彻;非靶向代謝物篩選鑒定了401種差異代謝物檬洞,在MS/MS 數(shù)據(jù)庫注釋到71種具體的代謝物。
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代謝物注釋沟饥;注釋到了7個版塊添怔,其主要有氨基酸、脂肪酸代謝等途徑贤旷,部分注釋結(jié)果解釋:
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發(fā)現(xiàn)短鏈脂肪酸广料、膽汁酸在兩個品種中差異較大,對豐度差異較大代謝物靶向代謝分析幼驶,發(fā)現(xiàn)長白豬結(jié)腸中短鏈脂肪酸和次級膽汁酸含量顯著高于梅花豬艾杏,而梅花豬種初級膽汁酸含量高于長白豬。且如預(yù)期一樣盅藻,長白豬平均日增重高于梅花豬购桑。
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并對腸道粘膜中的短鏈脂肪酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因以及受體基因就行差異分析
- 最后對微生物進(jìn)行差異分析以及代謝組和微生物組的關(guān)聯(lián)分析:
鏈球菌、CF231氏淑、布氏菌勃蜘、衣原體和奈瑟菌與膽汁酸、短鏈脂肪酸和脂類代謝物為正相關(guān)關(guān)系假残,類桿菌缭贡、霍爾德曼氏菌屬和YRC22與膽汁酸、短鏈脂肪酸和脂類代謝物為正相關(guān)為負(fù)相關(guān)關(guān)系辉懒。
小結(jié)
主要是比較了兩個品種豬的結(jié)腸微生物以及代謝物差異阳惹,以及關(guān)鍵代謝物與宿主基因的表達(dá)的關(guān)系,腸道微生物差異可能與兩個豬的脂肪沉積有關(guān)眶俩。