距離第一篇簡書筆記（2019-8-20）已經(jīng)一年有余了茁肠，本來是想在一周年的時(shí)候?qū)懸黄穆窔v程的，后來一想匹颤，還是等到粉絲數(shù)破千的時(shí)候再寫更有意義。因?yàn)檎沁@些支持我的小伙伴們的激勵(lì)使得我一年多以來堅(jiān)持自學(xué)生信杠氢，并且記錄每一個(gè)我覺得值得記錄的知識(shí)另伍。

這是一篇有點(diǎn)長的學(xué)習(xí)感悟，和所有關(guān)注我的小伙伴們分享~

開始自學(xué)生信的原因

我的專業(yè)是生化分子温艇，是做純wet實(shí)驗(yàn)的堕汞，比如細(xì)胞培養(yǎng)，WB琐鲁，qPCR人灼，IHC，流式等等這些bench work奈泪，有時(shí)也殺殺老鼠灸芳。學(xué)習(xí)生信并不是我的愛好。不像很多小伙伴是因?yàn)橄矚g生信冯遂，或者因?yàn)橄肜蒙虐l(fā)文章從而去深入學(xué)習(xí)谒获。實(shí)際上我對(duì)高科技的東西并不精通，尤其是電腦。迫使我狠下心學(xué)習(xí)生信的原因很簡單：被人瞧不起儒洛。

莫名其妙的“自信”

我在2017年夏天畢業(yè)于國內(nèi)一所985學(xué)校琅锻，名字就不提了（怕給學(xué)校丟臉向胡。惊完。。）拇派。當(dāng)時(shí)畢業(yè)那年因?yàn)橐_(dá)到畢業(yè)要求凿跳，發(fā)了一篇現(xiàn)在已經(jīng)被踢出sci的“水刊”：oncotarget（當(dāng)時(shí)還是5點(diǎn)多分的雜志）。那時(shí)候指導(dǎo)我的課題的導(dǎo)師（并不是實(shí)驗(yàn)室里的大老板）對(duì)我博士的工作還是比較肯定的茧彤，并且我實(shí)驗(yàn)室大老板經(jīng)常給我們灌輸一種思想：“從我們實(shí)驗(yàn)室走出去的學(xué)生都是非常優(yōu)秀的疆栏，咱們實(shí)驗(yàn)室是training的很好的！”珠洗。所以就給了我一種錯(cuò)覺博助，覺得自己畢業(yè)之后，無論去哪兒都能hold住任何環(huán)境蛔糯，都能秒殺所有競爭者窖式。然而現(xiàn)實(shí)卻結(jié)結(jié)實(shí)實(shí)的給了我一個(gè)耳光。

初來US

2017年博士畢業(yè)的時(shí)候淮逻，我不知道RNA-seq是干嘛用的阁簸，只是聽說好像很火的樣子；我看不懂ChIP-seq的峰圖筛严，我不知道什么是ATAC-seq饶米，我更不知道什么是GEO车胡，什么是TCGA數(shù)據(jù)庫照瘾。我不懂這些技術(shù)的原理析命，更不要說去分析數(shù)據(jù)。即使這樣队秩，我仍然覺得自己是“無敵”的昼浦。

博士畢業(yè)后第一份博后工作是US的一個(gè)研究所，老板是一個(gè)中國人鸟蟹。當(dāng)時(shí)剛?cè)サ臅r(shí)候發(fā)現(xiàn)老板貌似不缺錢使兔，生信的東西涉及的不多，聽說老板有“御用”的生信分析人員熊经，就是花點(diǎn)錢的事欲险。實(shí)驗(yàn)室里的同學(xué)們也沒有涉及到生信分析，所以我總覺得槐壳，生信這個(gè)東西我不需要了解喜每，反正只要老板有錢交給別人分析就行，我負(fù)責(zé)bench work就夠了枫笛。后來因?yàn)槟承┰蚋照眨坏揭荒甑臅r(shí)候我辭掉了這個(gè)工作，來到了現(xiàn)在的實(shí)驗(yàn)室做博后海诲。

被現(xiàn)實(shí)打了耳光

剛來到新實(shí)驗(yàn)室的時(shí)候檩互，我仍然覺得自己“好牛逼”闸昨，現(xiàn)在想想很好笑，就像個(gè)白癡一樣饵较。這個(gè)新實(shí)驗(yàn)室老板是個(gè)歐洲人循诉，沒有那么多錢，實(shí)驗(yàn)室里人也不多茄猫，包括我在內(nèi)一共2個(gè)博后划纽，1個(gè)博士。剛進(jìn)來第2個(gè)月的時(shí)候勇劣，有一個(gè)申請博后獎(jiǎng)學(xué)金的talk比默，老板讓我去試試，當(dāng)時(shí)我對(duì)自己要做的課題還不是很熟悉（我覺得有一部分原因是英語不太好粘咖。因?yàn)橹暗哪莻€(gè)實(shí)驗(yàn)室里基本上都是中國人侈百，現(xiàn)在要全部說英語），所以在準(zhǔn)備這個(gè)talk的時(shí)候讽坏，我基本就是純靠背稿子例证。

后來這個(gè)talk講的還不錯(cuò)，因?yàn)楸车暮苁炀氄痛小５呛竺娴幕卮饐栴}部分把我學(xué)術(shù)上知識(shí)的匱乏暴露的一覽無遺漠秋。我不太記得當(dāng)時(shí)提問的是什么了，但是有一個(gè)單詞抵屿，我想這輩子都不會(huì)忘記它：barcode庆锦。當(dāng)時(shí)的我自然不會(huì)知道這個(gè)提問者說的barcode到底是個(gè)什么鬼。其實(shí)這并不是最讓我感到難受的事情轧葛。因?yàn)楹髞淼囊患侣悖屛覈?yán)重懷疑自己的水平，我到底是不是像大老板說的：“我們實(shí)驗(yàn)室的人是training的很好的”尿扯。講完talk后我和同學(xué)求晶、老板回到實(shí)驗(yàn)室衷笋，我聽到他們在另一個(gè)bench旁聊天芳杏，我清楚的聽到實(shí)驗(yàn)室里另一個(gè)博后跟老板說：“She didn't even know what the barcode is!” 當(dāng)時(shí)我的內(nèi)心是有點(diǎn)崩潰的，但是仍然覺得右莱，也許這個(gè)博后的水平確實(shí)異于常人的高蚜锨，才會(huì)說這樣的話。但是老板也沒有說我什么慢蜓，只是意思意思的說“講的不錯(cuò)”亚再。

后來最終促使我下定決心自學(xué)生信的，是我跟老板提換簽證的事情晨抡。當(dāng)時(shí)老板說換簽證需要證明這個(gè)實(shí)驗(yàn)室沒有你不行氛悬。而他不能給我證明。因?yàn)樗f：“I don't think you are irreplaceable.” 這句話對(duì)于我來說是非常傷自尊的耘柱。雖然從小沒得過什么三好學(xué)生如捅，也沒拿過什么大獎(jiǎng)，但是從來沒有一個(gè)老師這么直接的說我并不是不可替代的调煎。但事實(shí)也的確如此镜遣，實(shí)驗(yàn)室的3個(gè)人里我是最可以被取代的；甚至中午在飯廳吃飯的時(shí)候和隔壁實(shí)驗(yàn)室的同學(xué)閑聊士袄，發(fā)現(xiàn)只有我不會(huì)生信分析悲关。于是我為了以后給自己多一些選擇的余地，為了成為那個(gè)“不可代替”的人娄柳，非常非常不情愿的開始了學(xué)習(xí)生信寓辱。

開始學(xué)習(xí)

于是我就從"pwd","cd","ls"這些最最基礎(chǔ)的命令開始學(xué)。而且只能抽出晚上的時(shí)間學(xué)習(xí)赤拒。所以學(xué)的一直很慢秫筏，而且沒有頭緒诱鞠。有時(shí)也在網(wǎng)上搜一些視頻（因?yàn)楦F所以看的都是免費(fèi)視頻），中文的英文的都有这敬，但是因?yàn)闀r(shí)間太零碎航夺，都是斷斷續(xù)續(xù)的學(xué)。好在學(xué)校里給博士生開的生信課是公開的崔涂，博后也可以去蹭課聽敷存，所以我就蹭了幾節(jié)課，由于實(shí)驗(yàn)的緣故堪伍，課也是去一次，落兩次觅闽。但是蹭課的過程里給我印象最深的帝雇，是真真切切的感受到國外的生物領(lǐng)域的教育模式。在我這個(gè)學(xué)校里蛉拙，除了生信專業(yè)的尸闸，其他只要與生物沾邊的專業(yè)的博士生，生信是必修課孕锄！是的吮廉，你沒看錯(cuò)，每個(gè)人必須參加畸肆，還要考試宦芦！我才知道為什么我周圍的人都會(huì)生信，因?yàn)檫@是他們必修課（不知道現(xiàn)在國內(nèi)學(xué)校的生物學(xué)博士生是不是都開設(shè)生信的必修課轴脐，當(dāng)時(shí)我讀博的時(shí)候是沒有生信課的）调卑。。大咱。另一個(gè)印象深刻的是在課堂上恬涧，為了讓每一個(gè)學(xué)生都能真正的跟上老師的步驟，除了臺(tái)上講課的老師碴巾，臺(tái)下也會(huì)坐著兩個(gè)老師溯捆，每運(yùn)行一行代碼，只要有人說“報(bào)錯(cuò)了”厦瓢，臺(tái)下的老師就會(huì)走到他身邊看看是什么問題提揍。非常的細(xì)心照顧到每一個(gè)學(xué)生。

其實(shí)真正讓我能踏實(shí)下來有整塊的時(shí)間學(xué)習(xí)生信旷痕，是由于疫情的shutdown碳锈，實(shí)驗(yàn)室關(guān)門，只能在家呆著欺抗。在家的三個(gè)月里售碳，幾乎學(xué)習(xí)了比之前半年學(xué)的還多的東西。最明顯的就是簡書的筆記數(shù)量，之前半年寫了大概不到30篇筆記贸人，而疫情停擺的三個(gè)月寫了將近50多篇學(xué)習(xí)筆記间景。學(xué)校也開設(shè)了免費(fèi)的網(wǎng)課，系統(tǒng)的講了R以及利用服務(wù)器進(jìn)行RNA-seq和ChIP-seq的完整流程艺智。課程都是錄制的倘要，聽不懂的地方還可以結(jié)束以后反復(fù)聽∈穑可以說封拧，這三個(gè)月是收獲最多的時(shí)間。

實(shí)際上夭问，自學(xué)了一些生信泽西，老板和我談?wù)n題的時(shí)候談?wù)摰母蛹?xì)致了，因?yàn)樗郧盎静缓臀矣懻撊魏侮P(guān)于生信分析的東西缰趋，他知道談了我也聽不懂捧杉。但是在work from home的后期，老板得知我一直在自學(xué)生信秘血，后來在討論課題的時(shí)候就會(huì)涉及到一些分析的東西了味抖，甚至有時(shí)候他會(huì)主動(dòng)給我講解一些軟件的用途、好的在線分析網(wǎng)站也會(huì)和我分享灰粮。

被人質(zhì)疑

不止一個(gè)人對(duì)我說過仔涩，你一個(gè)做實(shí)驗(yàn)的學(xué)什么生信，這些分析就交給那些專業(yè)人士就好了~（這話我以前經(jīng)常說粘舟，還經(jīng)常用這句話反駁建議我學(xué)生信的“王院長”）這話沒錯(cuò)红柱，畢竟術(shù)業(yè)有專攻。但是如果你發(fā)現(xiàn)你身邊同樣都是做實(shí)驗(yàn)的同學(xué)居然還會(huì)敲敲代碼蓖乘，分析數(shù)據(jù)锤悄，你會(huì)感到壓力山大。那種危機(jī)感和緊迫感嘉抒，迫使你不得不去學(xué)習(xí)趕上他們零聚。另外，如果有同學(xué)即將博士畢業(yè)想出國做博后的些侍，一定關(guān)注過一些招聘網(wǎng)站隶症。在我畢業(yè)那一年的時(shí)候，招聘里很少要求會(huì)生信分析岗宣，除非他們招的就是生信分析崗位蚂会。而現(xiàn)在你再打開那些網(wǎng)站，我不敢說全部耗式，起碼80%以上的濕實(shí)驗(yàn)博后崗位胁住，在招聘要求里都會(huì)注明最好會(huì)生信分析/或者是會(huì)生信的很加分趁猴，來感受一下吧：

所以不要再說什么“我是做實(shí)驗(yàn)的，生信跟我沒關(guān)系”這種話（雖然這話我以前也經(jīng)常說）彪见，也不要再嘲笑別人為什么閑的沒事學(xué)生信了（實(shí)際上不是閑的沒事儡司，沒準(zhǔn)兒人家很忙的~）。機(jī)會(huì)是留給有準(zhǔn)備的人的余指，如果當(dāng)有一天捕犬，一個(gè)很好的工作機(jī)會(huì)擺在你面前，而你卻沒有能力抓住它的時(shí)候酵镜，后悔也來不及了碉碉。所以，你可以暫時(shí)不用它淮韭，但是你不能不會(huì)它誉裆，就是這個(gè)道理。

萬事開頭難

學(xué)習(xí)生信一年多一點(diǎn)的時(shí)間缸濒，我只能說我剛剛摸到了生信的邊兒，可能連“只是懂些皮毛而已”也算不上粱腻，因?yàn)閺膩頉]有報(bào)個(gè)班系統(tǒng)的去學(xué)庇配，很多原理也不懂，只是跑跑流程而已绍些。有時(shí)候評(píng)論里的留言和問題捞慌，也實(shí)在不敢盲目去回答，但是不得不說柬批，其中不乏一些很好的問題啸澡。但是出于不“誤人子弟”的想法，我也只挑了其中一部分進(jìn)行回答氮帐。有的留言里還很尊敬的稱呼我“老師”嗅虏，我實(shí)在不是什么老師，只是個(gè)自學(xué)生信的30出頭大齡未婚實(shí)驗(yàn)室打工仔上沐。但是大部分小伙伴們提的一些問題讓人不知道怎么回答（或者說皮服，你可以自己解決），這里我需要說明的是参咙，我發(fā)表的學(xué)習(xí)筆記里所有的代碼龄广，每一行都是我自己運(yùn)行過的，圖也都是我運(yùn)行后生成的蕴侧，所以如果有些小伙伴按照我的代碼運(yùn)行報(bào)錯(cuò)择同，還請仔細(xì)檢查一下你的代碼是否真的正確，你的文件格式是否正確净宵，畢竟對(duì)于我們這種初學(xué)者來說敲才，99.9%的報(bào)錯(cuò)在網(wǎng)上都可以搜索到解決方法裹纳。當(dāng)然我也很理解報(bào)錯(cuò)時(shí)的惱火，因?yàn)槲乙步?jīng)常按照網(wǎng)上的各種教程來練習(xí)归斤，不得不說你真的無法100%相信別人的代碼痊夭，因?yàn)閯e人的代碼在別人的電腦上運(yùn)行沒問題，不代表在你的電腦上也沒問題脏里。由于軟件版本或者各種原因她我，別人的代碼報(bào)錯(cuò)了簡直太正常了。剛開始的時(shí)候迫横，我也會(huì)向“王院長”抱怨為什么網(wǎng)上的代碼會(huì)有錯(cuò)番舆，“王院長”說那不是別人的問題，是你自己的問題矾踱，別人沒有義務(wù)向你保證那些代碼100%正確恨狈，你的糾錯(cuò)過程，才是你的學(xué)習(xí)過程呛讲。

另外禾怠，我在剛開始學(xué)習(xí)的時(shí)候，也會(huì)犯一個(gè)毛病贝搁，就是無論是什么報(bào)錯(cuò)吗氏，首先第一時(shí)間去問王院長：“這個(gè)怎么報(bào)錯(cuò)了呀！這是怎么回事袄啄妗弦讽？”王院長回復(fù)我的永遠(yuǎn)都是：“自己去百度，去google膀哲⊥”起初我很惱火，我自己查半天的事情你一句話解決了某宪，不是節(jié)省我很多時(shí)間嘛仿村？后來慢慢的我才明白，學(xué)習(xí)生信兴喂，不是敲幾行代碼奠宜，不是跑跑流程，不是ctrl+C和ctrl+V的事情瞻想，更重要的是學(xué)會(huì)“如何在眾多的資料里找到解決方法”压真。事實(shí)上，我們從小學(xué)讀到博士畢業(yè)蘑险，最后能保留在你腦子里的東西滴肿，不是哪一首詩詞，不是哪一個(gè)公式佃迄，而是你的學(xué)習(xí)能力泼差。這個(gè)過程很痛苦贵少，但是每當(dāng)你自己通過努力，解決了一個(gè)小問題的時(shí)候堆缘，你會(huì)非常有成就感滔灶。再后來，遇到問題吼肥，我第一時(shí)間不再找王院長了录平，學(xué)會(huì)了怎么關(guān)鍵詞搜索，解決了很多小問題缀皱。

學(xué)習(xí)的路是漫長而艱辛的斗这，為了自己的以后增加籌碼，你永遠(yuǎn)不知道啤斗，機(jī)會(huì)在什么時(shí)候向你敞開大門表箭。剛開始決定學(xué)習(xí)的那一刻，是痛苦的钮莲。因?yàn)橛形冯y情緒在作祟免钻。還沒有開始，就已經(jīng)被自己想象的困難打倒了崔拥〖颍“開始做”，是唯一可以消除恐懼的方法握童。所以，別輕易認(rèn)輸叛赚，別總對(duì)自己說沒有辦法澡绩。

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絮叨了好多，不bb了俺附。最后肥卡，非常感謝這一年多來關(guān)注我的小伙伴們~你們是我的動(dòng)力，也是支持我繼續(xù)堅(jiān)持學(xué)習(xí)的能量來源事镣。我會(huì)繼續(xù)學(xué)習(xí)生信步鉴，繼續(xù)分享所有我覺得值得分享的東西。送給你們一句我的座右銘：

努力去做璃哟，別辜負(fù)生命的另一種可能氛琢。

看到最后的小伙伴當(dāng)然有surprise獎(jiǎng)勵(lì)了~

分享一些我自己在最初學(xué)生信的時(shí)候看的啟蒙教程，和一些剛剛收集還沒有來得及看的經(jīng)典生信好書随闪，供和我一樣的小白學(xué)習(xí)（都是免費(fèi)的哦阳似，因?yàn)橹来蟛糠中』锇槎际菍W(xué)生，沒什么積蓄铐伴。想要的小伙伴可以簡信給我撮奏，發(fā)給你們百度網(wǎng)盤鏈接和提取碼（原來鏈接本來是有的俏讹，被簡書鎖定了，沒法發(fā)布畜吊，所以請直接聯(lián)系我）泽疆。