??一直以為蛋白編碼基因被轉(zhuǎn)錄加工成熟后會(huì)很快（感覺(jué)應(yīng)該是以秒計(jì)）進(jìn)行翻譯，但實(shí)際上并不是腔彰。今天分享的這項(xiàng)研究叫编，則是通過(guò)開(kāi)發(fā)nRibo-seq（Nascent Ribo-Seq），解析RNA從轉(zhuǎn)錄到翻譯的時(shí)間——滯后時(shí)間霹抛。針對(duì)小鼠巨噬細(xì)胞的分析表明搓逾，其滯后時(shí)間約20-22min；而小鼠胚胎干細(xì)胞的滯后時(shí)間則達(dá)到了35-38min杯拐，不同細(xì)胞中霞篡，滯后時(shí)間存在差異。
nRibo-seq
nRibo-seq原理：常規(guī)的Ribo-seq主要用于分析mRNA的翻譯效率端逼，而nRibo-seq則借助轉(zhuǎn)錄過(guò)程中參入的核苷酸類似物（例如4SU）追蹤RNA從轉(zhuǎn)錄到翻譯的過(guò)程朗兵。通過(guò)對(duì)不同時(shí)間點(diǎn)的細(xì)胞樣本進(jìn)行nRibo-seq分析，可以計(jì)算RNA從轉(zhuǎn)錄到翻譯的滯后時(shí)間顶滩。
Reference
Schott, J. et al. Nascent Ribo-Seq measures ribosomal loading time and reveals kinetic impact on ribosome density. Nat Methods (2021).
